Affine Alignment
 
Alignment between HNRNPA1 (top ENST00000340913.11_5 372aa) and HNRNPA1 (bottom ENST00000340913.11_5 372aa) score 38475

001 MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGTLTDCVVMRDPNTKRSRGFGFV 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGTLTDCVVMRDPNTKRSRGFGFV 060

061 TYATVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHH 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 TYATVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHH 120

121 LRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKA 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 LRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKA 180

181 LSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGS 240

241 GDGYNGFGNDGGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYDSYNNGGGGGFGG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 GDGYNGFGNDGGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYDSYNNGGGGGFGG 300

301 GSGSNFGGGGSYNDFGNYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGS 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 GSGSNFGGGGSYNDFGNYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGS 360

361 SSSSSYGSGRRF 372
    ||||||||||||
361 SSSSSYGSGRRF 372