UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK945.7ZK945.72e-141chrII 10,107,878contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAV6
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3C05D2.3C05D2.3n/achrIII 5,616,047C05D2.3 generally resembles aromatic-L-amino-acid/L-histidine decarboxylases; however, its predicted protein sequence lacks six residues critical for AADC function; C05D2.3 is dispensable in mass RNAi assays.
4clec-239Y102A5C.16n/achrV 16,957,229C. elegans CLEC-239 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5C09F9.1C09F9.1n/achrII 14,698,971contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
6Y116A8A.7Y116A8A.7n/achrIV 16,830,442contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
7kel-10T16H12.6n/achrIII 10,099,930C. elegans KEL-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF00651 (BTB/POZ domain) , PF07646 (Kelch motif) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013069 (BTB/POZ), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
8ZK84.5ZK84.5n/achrII 6,016,343
9C17H12.5C17H12.5n/achrIV 6,816,742contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
10C06C6.9C06C6.9n/achrV 15,996,452contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
11scrm-5K08D10.8n/achrIV 4,163,488scrm-5 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); scrm-5(RNAi) animals have no obvious phenotype.
12srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13C50F4.10C50F4.10n/achrV 9,530,766contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14F36H12.5F36H12.5n/achrIV 5,267,206contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
15F38A5.6F38A5.6n/achrIV 6,596,738contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
16snf-2F55H12.1n/achrI 8,873,592C. elegans SNF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
17srv-12T04B2.4n/achrIV 10,052,440C. elegans SRV-12 protein ;
18W06F12.3W06F12.3n/achrIII 13,735,661contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
19C10G8.2C10G8.2n/achrV 5,314,980contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
20ZK1290.7ZK1290.7n/achrII 7,524,953contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
21K02A11.2K02A11.2n/achrI 9,745,095contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences, required for pre-rRNA processing and ribosome biogenesis; SGD:YGR159C
22lips-2C04B4.3n/achrX 12,286,461C. elegans LIPS-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
23C47E12.11C47E12.11n/achrIV 9,970,520contains similarity to Mus musculus Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G (EC 5.2.1.8) (Peptidyl-prolylsisomerase G) (PPIase G) (Rotamase G) (Cyclophilin G).; SW:A2AR02
24W06D4.3W06D4.3n/achrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
25F35H8.4F35H8.4n/achrII 9,559,658contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein.; TR:Q8P0S2
26R07C3.4R07C3.4n/achrII 934,987contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
27nas-5T23H4.3n/achrI 9,887,167nas-5 encodes an astacin-like metalloprotease; loss of nas-5 activity in an RNAi hypersensitive strain results in axon guidance defects, including a failure of DD/VD motoneuron commissures to reach the dorsal cord, defasciculation of the dorsal nerve cord, and midline crossing defects in the ventral nerve cord.
28tba-6F32H2.9n/achrI 8,996,289C. elegans TBA-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
29T04A6.3T04A6.3n/achrIII 7,608,687contains similarity to Interpro domain IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein)
30nhr-222T24A6.11n/achrV 3,542,513C. elegans NHR-222 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31C10G11.10C10G11.10n/achrI 6,305,695
32C02F5.2C02F5.2n/achrIII 8,249,732
33D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
34T02H6.7T02H6.7n/achrII 683,000contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
35sri-66F28B1.6n/achrV 17,060,972C. elegans SRI-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
37F44D12.3F44D12.3n/achrIV 10,022,456contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
38C17C3.11C17C3.11n/achrII 5,538,392contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
39clec-109F17B5.3n/achrI 13,197,634C. elegans CLEC-109 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40C48B6.4C48B6.4n/achrI 6,890,348contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
41F11G11.5F11G11.5n/achrII 4,858,520contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
42T02H6.4T02H6.4n/achrII 690,572contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
43F09E8.1F09E8.1n/achrIV 13,141,838contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002593 (Protein of unknown function DX)
44K08E7.4K08E7.4n/achrIV 12,570,933contains similarity to Plasmodium falciparum Gene 11-1 protein precursor.; TR:Q8I6U6
45scrm-8K08D10.7n/achrIV 4,165,432scrm-8 encodes a putative phospholipid scramblase required for normally short lifespan; SCRM-8 is homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1).
46F35E2.5F35E2.5n/achrI 11,742,773contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
47C15H7.4C15H7.4n/achrIII 9,655,035contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein that forms a complex with Spt4p and mediates both activation and inhibition of transcription elongation; Spt4p-Spt5p complex also plays a role in pre-mRNA processing; SGD:YML010W
48F18A1.1F18A1.1n/achrII 7,687,417
49F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
50K06A1.2K06A1.2n/achrII 6,445,339