UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK938.6ZK938.60chrII 9,844,266contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
2lgc-1T05B4.1n/achrV 4,136,911C. elegans LGC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
3egrh-1C27C12.2n/achrX 14,847,486C27C12.2 is orthologous to the human gene BA436D10.3 (EARLY GROWTH RESPONSE 2 (KROX-20 (DROSOPHILA) HOMOLOG)) (EGR2; OMIM:129010), which when mutated leads to disease.
4Y54E2A.10Y54E2A.10n/achrII 14,791,729contains similarity to Dictyostelium discoideum Protein-tyrosine phosphatase 3 (EC 3.1.3.48) (Protein-tyrosine-sphosphate phosphohydrolase 3).; SW:PTP3_DICDI
5srv-4F15E6.7n/achrIV 4,286,920C. elegans SRV-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
6shw-3R186.5n/achrV 12,974,845C. elegans SHW-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003973 (Potassium channel, voltage dependent, Kv2), IPR003970 (Potassium channel, voltage dependent, Kv8), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003969 (Potassium channel, voltage dependent, Kv6), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
7F25H2.2F25H2.2n/achrI 10,544,713contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001683 (Phox-like), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
8C24A8.1C24A8.1n/achrX 4,323,582C24A8.1 encodes an homolog of mammalian D2 or D3 dopamine receptors, and a paralog of DOP-2/-3; C24A8.1 is expressed in the nervous system; because of its paralogy, C24A8.1 might act redundantly with DOP-2 to promote the basal slowing response to bacterial feeding, or it might account for the residual response to excess dopamine seen in triple dop-1/-2/-3 mutants; but C24A8.1 otherwise has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
9nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
11srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
12F59A3.10F59A3.10n/achrI 5,542,985
13W04A4.4W04A4.4n/achrI 13,676,809contains similarity to Pfam domain PF00648 Calpain family cysteine protease contains similarity to Interpro domain IPR001300 (Peptidase C2, calpain)
14gur-4K09E4.5n/achrII 14,106,298C. elegans GUR-4 protein ;
15sra-1AH6.4n/achrII 9,520,857sra-1 encodes a predicted seven transmembrane receptor; expressed in the male SPD and SPV neurons.
16F21A10.4F21A10.4n/achrX 10,185,057contains similarity to Mus musculus Tumor rejection antigen P815A.; SW:TUR8_MOUSE
17his-25ZK131.2n/achrII 13,824,963his-25 encodes an H3 histone.
18C27F2.1C27F2.1n/achrIII 4,989,295contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
19nas-39F38E9.2n/achrX 16,464,603C. elegans NAS-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF00431 (CUB domain) (4), PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR015446 (Bone morphogenetic protein 1/tolloid-like protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006210 (EGF), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013091 (EGF calcium-binding)
20C36C5.15C36C5.15n/achrV 3,168,358contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
21srd-5T19E7.5n/achrIV 5,673,565C. elegans SRD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004268 (Virulence factor MVIN-like)
22nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23srx-136F09F3.12n/achrV 13,858,174C. elegans SRX-136 protein ;
24srw-47K10G4.2n/achrV 17,261,345C. elegans SRW-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25K01A11.2K01A11.2n/achrIII 3,426,861contains similarity to Xenopus laevis LOC495955 protein.; TR:Q5PQ79
26ZC15.3ZC15.3n/achrV 20,299,636contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, smooth muscle isoform; ENSEMBL:ENSP00000300036
27pgp-10C54D1.1n/achrX 7,162,476pgp-10 encodes an ATP-binding protein that is a member of the P-glycoprotein subclass of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily; PGP-10 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of pgp-10 activity via RNAi results in no obvious defects, the exact role of pgp-10 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; pgp-10 promoter-gfp fusion proteins are expressed in larvae and adults in the intestine and hypodermis.
28srxa-16F44G3.5n/achrV 16,113,637C. elegans SRXA-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
29pha-2M6.3n/achrX 635,373pha-2 encodes a homeodomain protein that is orthologous to vertebrate Hex proteins required for the development of B lymphocytes and organs derived from foregut endoderm; in C. elegans, pha-2 is essential for proper development and morphogenesis of the pm5 pharyngeal muscles cells during late stages of embryogenesis; in regulating pm5 fate specification, PHA-2 appears to act downstream of the organ identity factor PHA-4, and upstream of ceh-22, whose expression it may negatively regulate in pm5; a rescuing PHA-2::GFP reporter is expressed in pharyngeal cells, intestinal-rectal cells, and postembryonic head neurons.
30srh-174F40D4.1n/achrV 17,179,348C. elegans SRH-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31Y6B3B.1Y6B3B.1n/achrI 13,699,504contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
32F15A8.1F15A8.1n/achrX 4,441,526
33F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
34F14H8.4F14H8.4n/achrV 15,024,402contains similarity to Clostridium acetobutylicum Protein containing a domain related to multimeric flavodoxin WrbAsfamily.; TR:Q97H25
35str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36F42G8.5F42G8.5n/achrIV 8,137,753
37Y62H9A.9Y62H9A.9n/achrX 11,896,785contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I659
38F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
39F58A6.2F58A6.2n/achrII 5,137,627
40F21E9.6F21E9.6n/achrX 1,356,015
41T05B9.2T05B9.2n/achrII 11,257,607contains similarity to Rattus norvegicus Fibrillin-2.; TR:Q9WUH9
42F35E8.2F35E8.2n/achrV 15,906,320contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DZ81
43T07H6.4T07H6.4n/achrX 6,284,028contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
44R04E5.7R04E5.7n/achrX 8,797,318
45E03A3.5E03A3.5n/achrIII 4,061,679contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold)
46F49E12.7F49E12.7n/achrII 8,395,633contains similarity to Mycobacterium tuberculosis Hypothetical protein (HoxN/HupN/NixA family nickel transporter).; TR:O05804
47srab-10C36C5.7n/achrV 3,143,828C. elegans SRAB-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
48C34E7.3C34E7.3n/achrX 12,931,101contains similarity to Plasmodium falciparum Ribonuclease, putative.; TR:Q8ICL5
49fkh-5F26A1.2n/achrIII 4,845,567fkh-5 encodes a member of the forkhead domain transcription factor family.
50F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)