UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1mel-26ZK858.40chrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
2Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
3C53B7.6C53B7.6n/achrX 6,868,654
4T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
5H03G16.1H03G16.1n/achrX 15,054,187contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
6T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
7str-185R08C7.7n/achrIV 4,428,740C. elegans STR-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F15E6.5F15E6.5n/achrIV 4,289,807contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
9fbxa-160C08E3.12n/achrII 1,624,293C. elegans FBXA-160 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
10W05H5.1W05H5.1n/achrII 12,443,814contains similarity to Ovis aries Lysophosphatidic acid receptor Edg-2 (LPA receptor 1) (LPA-1).; SW:EDG2_SHEEP
11srt-54K10B4.2n/achrII 117,953C. elegans SRT-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
12clec-121Y25C1A.4n/achrII 3,103,522C. elegans CLEC-121 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13Y116A8C.22Y116A8C.22n/achrIV 17,047,371contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000116 (High mobility group proteins HMG-I and HMG-Y), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
14sru-11Y45F10B.6n/achrIV 13,586,085C. elegans SRU-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
15F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
16scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
17EEED8.6EEED8.6n/achrII 5,385,733EEED8.6 encodes an ATP/ADP-activated metallocarboxypeptidase, orthologous to mammalian AGBL4 proteins, that may function in vivo as an alpha-tubulin C-terminal tyrosine carboxypeptidase; recombinant EEED8.6 is active in vitro on several different C-terminal amino acids of synthetic peptide substrates (with carboxypeptidase A- and B-like, but not O-like specificity); unlike most carboxypeptidases, but like tubulin carboxypeptidase, EEED8.6 is inhibited by high salt or by Z-Glu-Tyr dipeptide; EEED8.6 and its mammalian AGBL4 orthologs, along with other proteins such as mammalian AGBL5, comprise a M14D2 peptidase subfamily; by homolog-based structural modelling, EEED8.6 is predicted to have an unusually open active site.
18E02H4.5E02H4.5n/achrX 14,254,507contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBC6
19lips-1F45E6.4n/achrX 12,494,285C. elegans LIPS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
20srh-211D1065.5n/achrV 4,078,922C. elegans SRH-211 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21srw-26T05G11.3n/achrV 15,931,865C. elegans SRW-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
22glr-8F22A3.3n/achrX 6,508,340glr-8 encodes a highly divergent putative ionotropic glutamate receptor subunit, unclassifiable as NMDA or non-NMDA (though possibly of the Delta subfamily), and without any clear close homologs in metazoa or plants; glr-8 is expressed in the pharyngeal nervous system, the body wall mechanoreceptors ALM and PLM, and two other neurons (BDU and URB); glr-8 is expressed from embryogenesis to adulthood.
23T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
24srbc-17C45H4.3n/achrV 2,178,415C. elegans SRBC-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25F11C3.1F11C3.1n/achrI 14,869,588contains similarity to Xenopus laevis ATP-dependent DNA helicase PIF1 (EC 3.6.1.-).; SW:Q0R4F1
26cyp-25A6K06B9.1n/achrIV 4,197,909C. elegans CYP-25A6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR000044 (Mycoplasma lipoprotein (MG045))
27str-119C13B7.5n/achrV 2,427,301C. elegans STR-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28nhr-271T03E6.3n/achrV 16,579,462C. elegans NHR-271 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
29F09G8.5F09G8.5n/achrIII 8,256,200contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR010916 (TonB box, conserved site)
30R05A10.5R05A10.5n/achrIV 14,169,839contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
31M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
32sri-57F22E5.16n/achrII 2,671,336C. elegans SRI-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33glb-10C29F5.7n/achrII 6,308,800glb-10 encodes a globin; glb-10 is expressed in pharynx, intestine, vulval muscle, and many neurons, with at least some subcellular localization to synapses; however, glb-10 has no obvious function in mass RNAi assays.
34ZC482.7ZC482.7n/achrIII 12,752,251contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35ZK470.4ZK470.4n/achrX 4,139,617
36str-190C18B10.7n/achrV 7,477,853C. elegans STR-190 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37ZK669.2ZK669.2n/achrII 7,937,580contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
38srw-73T03E6.6n/achrV 16,587,756C. elegans SRW-73 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39Y57G11A.3Y57G11A.3n/achrIV 14,502,754contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
40C46F2.1C46F2.1n/achrX 8,078,758
41F56H6.12F56H6.12n/achrI 12,313,605contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
42fpn-1.2R09B5.4n/achrV 1,463,421R09B5.4 is orthologous to the human gene HYPOTHETICAL PROTEIN (SLC11A3; OMIM:604653), which when mutated leads to disease.
43srt-65C03A7.10n/achrV 5,171,907C. elegans SRT-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44C17C3.13C17C3.13n/achrII 5,568,064
45clec-242Y68A4B.2n/achrV 17,244,604C. elegans CLEC-242 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
46rib-2K01G5.6n/achrIII 10,744,609The rib-2 gene encodes an ortholog of human EXT2, which when mutated leads to hereditary multiple exostoses, type II (OMIM:133701).
47str-78Y40H7A.1n/achrIV 15,145,449C. elegans STR-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
49ZK1240.5ZK1240.5n/achrII 2,317,121contains similarity to Interpro domain IPR000315 (Zinc finger, B-box)
50puf-4M4.2n/achrIV 3,207,566C. elegans PUF-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00806 Pumilio-family RNA binding repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR001313 (Pumilio RNA-binding region), IPR016024 (Armadillo-type fold)