UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK757.2ZK757.23e-158chrIII 9,875,718contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3K10H10.6K10H10.6n/achrII 14,504,011contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
4ncs-1C44C1.3n/achrX 961,929The ncs-1 gene encodes a neuronal calcium sensor protein that, along with calcium, is essential for thermotaxis along isothermal paths in thermal gradients.
5F53A2.1F53A2.1n/achrIII 13,321,932contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114), IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
6F53A2.9F53A2.9n/achrIII 13,357,930contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
7M163.5M163.5n/achrX 14,475,017contains similarity to Interpro domain IPR008995 ()
8Y7A5A.7Y7A5A.7n/achrX 15,802,663contains similarity to Murine herpesvirus 72 Membrane virion glycoprotein 150.; TR:Q9DYE3
9pqn-25D1044.3n/achrIII 5,510,853The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
10clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
11C17E7.10C17E7.10n/achrV 3,899,486contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
12R08C7.4R08C7.4n/achrIV 4,436,206contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
13C41D11.6C41D11.6n/achrI 4,461,426
14R07G3.8R07G3.8n/achrII 7,619,307contains similarity to Pfam domain PF07159 Protein of unknown function (DUF1394) contains similarity to Interpro domain IPR009828 (Protein of unknown function DUF1394)
15Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
16str-20C05E4.2n/achrV 757,182C. elegans STR-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17pbs-6C02F5.9n/achrIII 8,243,577The pbs-6 gene encodes a homolog of mammalian PSMB1.
18F22B3.5F22B3.5n/achrIV 11,416,056contains similarity to Interpro domains IPR001304 (C-type lectin), IPR006583 (CW)
19K01A12.3K01A12.3n/achrX 8,622,819contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20K03B8.8K03B8.8n/achrV 11,410,221contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
21F54B11.4F54B11.4n/achrX 13,593,035contains similarity to Neurospora crassa Hypothetical protein.; TR:Q8X031
22T07F12.2T07F12.2n/achrX 4,891,246contains similarity to Pfam domain PF02225 PA domain contains similarity to Interpro domain IPR003137 (Protease-associated PA)
23unc-120D1081.2n/achrI 8,461,612unc-120 encodes a member of the MADS-box family of transcription factors that is most closely related to Drosophila blistered and the vertebrate serum response factors (SRFs); UNC-120 is required for locomotion and muscle development and for formation of the normal number of muscle A and I bands; UNC-120 is also required for maintaining wild-type expression levels of the muscle components actin and myosin; UNC-120 is first expressed in the early embryo in body wall muscle precursors and later is expressed in both body wall and vulval muscles.
24F23B2.3F23B2.3n/achrIV 9,134,019contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
25Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)
26srz-74K03D3.1n/achrIV 16,330,219C. elegans SRZ-74 protein ;
27Y57G11A.4Y57G11A.4n/achrIV 14,484,352contains similarity to Interpro domain IPR005018 (DOMON related)
28EEED8.4EEED8.4n/achrII 5,410,795contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
29srt-13ZC142.1n/achrV 4,249,044C. elegans SRT-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000539 (Frizzled protein)
30ZK512.2ZK512.2n/achrIII 9,143,217contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
31bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
32K09E3.1K09E3.1n/achrX 17,126,661
33K04A8.3K04A8.3n/achrV 6,559,849
34ace-2Y44E3A.2n/achrI 3,304,491An acetylcholineesterase involved in the termination of cholinergic nerve transmission; it is predominantly expressed in motoneurons.
35str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36clec-195Y116A8C.21n/achrIV 17,044,558C. elegans CLEC-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37F52H2.4F52H2.4n/achrX 2,546,392contains similarity to Pfam domain PF00474 Sodium:solute symporter family contains similarity to Interpro domains IPR010979 (Ribosomal protein S13-like, H2TH), IPR001734 (Na+/solute symporter)
38fbxa-160C08E3.12n/achrII 1,624,293C. elegans FBXA-160 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
39srh-118K03D7.6n/achrV 17,495,205C. elegans SRH-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40Y43F8C.13Y43F8C.13n/achrV 19,691,051contains similarity to Pfam domain PF01156 Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001910 (Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase)
41bath-39F25H9.4n/achrV 13,460,604C. elegans BATH-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
42C01B10.7C01B10.7n/achrIV 6,638,773contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
43C36B1.9C36B1.9n/achrI 8,745,380contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000568 (ATPase, F0 complex, subunit A)
44F56H11.2F56H11.2n/achrIV 9,532,255contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical protein.; TR:Q81E16
45srw-117C44C3.6n/achrV 2,982,800C. elegans SRW-117 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
46fbxb-76H02I12.2n/achrIV 11,378,732This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
47sprr-2F42D1.3n/achrX 14,802,137C. elegans SPRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
48nhr-150C06B8.1n/achrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49nhr-268K06B4.6n/achrV 15,690,903C. elegans NHR-268 protein
50Y39A1A.17Y39A1A.17n/achrIII 10,688,996contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)