UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK697.1ZK697.10chrV 1,753,103
2W05H5.3W05H5.3n/achrII 12,446,465contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
3T01C3.1T01C3.1n/achrV 14,989,266contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF06920 (Dedicator of cytokinesis) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR010703 (Dedicator of cytokinesis)
4T05H4.7T05H4.7n/achrV 6,416,194contains similarity to Pfam domain PF00182 Chitinase class I contains similarity to Interpro domain IPR000726 (Glycoside hydrolase, family 19, catalytic)
5W04G5.4W04G5.4n/achrI 11,631,445contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR008996 (Cytokine, IL-1-like), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
6T01G9.3T01G9.3n/achrI 8,283,218contains similarity to Pfam domains PF00560 (Leucine Rich Repeat) (9), PF01463 (Leucine rich repeat C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
7F15E11.5F15E11.5n/achrV 2,343,260contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
8F52G3.4F52G3.4n/achrX 16,950,151
9F10E7.8F10E7.8n/achrII 7,103,165F10E7.8 encodes a FAR11-like protein that inhibits DHC-1 in vivo; F10E7.8 is orthologous to human FAM40A and FAM40B, and to budding yeast FAR11; F10E7.8(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that F10E7.8 negatively regulates dynein; in early embryos, F10E7.8 is a pronuclear and nuclear protein; F10E7.8 has no obvious function in mass RNAi assays.
10F44C8.7F44C8.7n/achrV 2,216,907contains similarity to Pfam domain PF04142 Nucleotide-sugar transporter contains similarity to Interpro domains IPR004689 (UDP-galactose transporter), IPR007271 (Nucleotide-sugar transporter)
11B0379.6B0379.6n/achrI 10,097,535contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in pre-rRNA processing, 18S rRNA synthesis, and snoRNA synthesis; component of the small subunit processome complex, which is required for processing of pre-18S rRNA; SGD:YOR310C
12F27E5.5F27E5.5n/achrII 10,129,961contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13R10E11.5R10E11.5n/achrIII 9,787,703contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ77065, highly similar to Homo sapiens golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (GOLGA4), mRNA; ENSEMBL:ENSP00000349305
14gmd-2F56H6.5n/achrI 12,293,092gmd-2 encodes one of two C. elegans GDP-mannose dehydratases; in vitro, and when coexpressed with GER-1, GMD-2 catalyzes the formation of GDP-fucose from GDP-mannose; gmd-2 transcripts are generally present throughout larval and adult stages.
15M04D8.4M04D8.4n/achrIII 10,030,454contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE0262.; TR:Q8XNS0
16F19G12.2F19G12.2n/achrX 1,429,318contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
17T28C6.7T28C6.7n/achrIV 8,828,801contains similarity to Interpro domain IPR009055 (UvrB, C-terminal UvrC-binding)
18K09H9.4K09H9.4n/achrI 3,134,515contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
19gur-5ZK622.2n/achrII 5,287,091C. elegans GUR-5 protein ;
20T14F9.2T14F9.2n/achrX 2,235,334
21F54F3.4F54F3.4n/achrV 12,923,361contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
22C16D6.3C16D6.3n/achrX 12,526,895contains similarity to Prochlorococcus marinus Predicted protein.; TR:Q7VCK1
23F33A8.6F33A8.6n/achrII 11,051,217contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR000222 (), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
24trxr-2ZK637.10n/achrIII 8,915,015C. elegans TRXR-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02852 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR012999 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I, active site), IPR004099 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation), IPR006338 (Thioredoxin and glutathione reductase selenoprotein), IPR016156 (FAD/NAD-linked reductase, dimerisation), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR000815 (Mercuric reductase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
25egl-2F16B3.1n/achrV 1,294,353egl-2 encodes a voltage-gated potassium channel that affects egg laying, muscle activation, defecation, mechanosensation, and chemosensation; expressed in the intestinal muscle, AFD, ALN, AQR, ASE, AWC, BAG, IL2, PLN, PQR, and URX neurons as well as a subset of sensory neurons in the male tail.
26F54B11.5F54B11.5n/achrX 13,595,020contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
27col-148C12D8.8n/achrV 10,242,222C. elegans COL-148 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR003979 (Tropoelastin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
28C56A3.6C56A3.6n/achrV 13,554,913contains similarity to Pfam domain PF00036 (EF hand)
29B0361.10B0361.10n/achrIII 7,286,727contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR010908 (Longin), IPR001388 (Synaptobrevin), IPR011012 (Longin-like)
30grl-12F28A12.2n/achrV 8,636,381grl-12 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
31srj-45T03D3.6n/achrV 2,836,005C. elegans SRJ-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
32F41E7.1F41E7.1n/achrX 10,281,146contains similarity to Pfam domain PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family contains similarity to Interpro domains IPR006153 (Sodium/hydrogen exchanger), IPR001680 (WD40 repeat)
33W04D2.5W04D2.5n/achrV 12,493,975contains similarity to Pfam domain PF00411 Ribosomal protein S11 contains similarity to Interpro domain IPR001971 (Ribosomal protein S11)
34sup-10R09G11.1n/achrX 17,529,998C. elegans SUP-10 protein ;
35T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
36srv-7T22B7.5n/achrX 5,643,888C. elegans SRV-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
37his-64F22B3.1n/achrIV 11,407,277his-64 encodes an H4 histone.
38glb-17F49E2.4n/achrX 9,574,890glb-17 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
39C01G12.5C01G12.5n/achrII 14,586,920contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
40mbr-1T01C1.2n/achrX 10,720,732C. elegans MBR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05225 helix-turn-helix, Psq domain contains similarity to Interpro domains IPR011526 (Helix-turn-helix, Psq-like), IPR007889 (Helix-turn-helix, Psq)
41nhr-116F09C6.9n/achrV 16,913,761C. elegans NHR-116 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42W09C3.3W09C3.3n/achrI 4,708,334contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
43srh-207ZK262.1n/achrV 18,409,607C. elegans SRH-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44srh-206Y102A5C.15n/achrV 16,954,279C. elegans SRH-206 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45sri-53ZC239.10n/achrII 3,201,906C. elegans SRI-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46H10E21.4H10E21.4n/achrIII 18,471contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
47Y37H2B.1Y37H2B.1n/achrV 18,227,570contains similarity to Xylella fastidiosa Beta-hexosaminidase precursor.; TR:Q9PF31
48T01H10.8T01H10.8n/achrX 12,134,602T01H10.8 encodes a BEACH domain-containing protein that is orthologous to the mammalian lysosomal trafficking regulator LYST which when mutated leads to Chediak-Higashi syndrome (CHS, OMIM:606897).
49ZC411.1ZC411.1n/achrV 8,878,230
50C24A3.1C24A3.1n/achrX 9,003,584contains similarity to Aedes aegypti Condensin, SMC5-subunit, putative (Fragment).; TR:Q16IF0