UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1tag-277ZK652.31e-48chrIII 7,859,173tag-277 encodes a conserved eukaryotic protein with a ubiquitin-like fold.
2T16H12.1T16H12.1n/achrIII 10,084,745contains similarity to Human papillomavirus type 70 E7 protein.; SW:VE7_HPV70
3F47B7.6F47B7.6n/achrX 3,770,172
4K09A11.5K09A11.5n/achrX 13,277,067contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
5T22C8.7T22C8.7n/achrII 8,632,480contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
6VC5.2VC5.2n/achrV 7,087,384contains similarity to Pfam domain PF00053 Laminin EGF-like (Domains III and V) contains similarity to Interpro domains IPR006056 (YjgF-like protein), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin)
7nhr-162C33G8.10n/achrV 6,991,040C. elegans NHR-162 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
8srbc-81Y45G12C.8n/achrV 2,523,361C. elegans SRBC-81 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
9srj-1ZK829.8n/achrIV 11,964,638C. elegans SRJ-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10srh-179ZK228.7n/achrV 18,477,190C. elegans SRH-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11math-2C08F1.1n/achrII 1,799,617C. elegans MATH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
12nhr-154C13C4.2n/achrV 12,102,273C. elegans NHR-154 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13R05F9.7R05F9.7n/achrII 4,887,230contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
14ZK455.5ZK455.5n/achrX 11,325,637contains similarity to Pfam domain PF01066 CDP-alcohol phosphatidyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR014472 (Choline/ethanolaminephosphotransferase), IPR000462 (CDP-alcohol phosphatidyltransferase)
15fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.
16B0391.3B0391.3n/achrV 15,616,248contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein)
17srt-32C53A5.10n/achrV 14,560,430C. elegans SRT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18T08B2.3T08B2.3n/achrI 6,228,917contains similarity to Interpro domain IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
19W10G11.4W10G11.4n/achrII 3,563,054contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
20K07D4.4K07D4.4n/achrII 4,032,008
21clec-201C30H6.3n/achrIV 17,359,724C. elegans CLEC-201 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22Y6E2A.1Y6E2A.1n/achrV 15,710,013contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
23srh-4K09D9.6n/achrV 4,011,203C. elegans SRH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
24C53A5.9C53A5.9n/achrV 14,557,956contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF07646 (Kelch motif) (3), PF02984 (Cyclin, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR004367 (Cyclin, C-terminal), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
25srh-185C50H11.7n/achrV 3,066,861C. elegans SRH-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004090 (Chemotaxis methyl-accepting receptor)
26F33C8.2F33C8.2n/achrX 14,722,337contains similarity to Interpro domain IPR003382 (Flavoprotein)
27C12D8.9C12D8.9n/achrV 10,242,987contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8ELE1
28B0284.2B0284.2n/achrIII 4,382,911contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Progesterone-induced-blocking factor 1; ENSEMBL:ENSP00000317144
29F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
30T16D1.1T16D1.1n/achrII 5,241,424
31tsp-20B0198.1n/achrX 12,032,731C. elegans TSP-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
32ZK688.3ZK688.3n/achrIII 7,894,068contains similarity to Pfam domain PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR010916 (TonB box, conserved site), IPR011234 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-related), IPR002529 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-like)
33C45E5.4C45E5.4n/achrIV 5,736,046
34C33D3.4C33D3.4n/achrX 10,488,757contains similarity to Buchnera aphidicola Exodeoxyribonuclease V beta chain (EC 3.1.11.5).; SW:EX5B_BUCAP
35str-2C50C10.7n/achrV 9,823,406C. elegans STR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36cut-5R07E3.3n/achrX 10,336,033C. elegans CUT-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
37Y39A1A.10Y39A1A.10n/achrIII 10,632,788contains similarity to Arabidopsis thaliana ORF protein (Fragment).; TR:Q39170
38R04B5.7R04B5.7n/achrV 10,089,830contains similarity to Rattus norvegicus Protein tyrosine phosphatase TD14.; TR:O88902
39K09B11.4K09B11.4n/achrIV 13,429,722contains similarity to Patella vulgata Twist protein (Fragment).; TR:Q8WQQ8
40F13H6.4F13H6.4n/achrV 6,367,454contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
41srt-11W01D2.4n/achrII 14,806,938C. elegans SRT-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42ndx-3Y38A8.1n/achrII 4,954,109The ndx-3 gene encodes a homolog of peroxisomal CoA diphosphatases in both S. cerevisiae (PCD1) and C. elegans (NDX-8); more generally, NDX-3 protein belongs to the family of NUDIX hydrolases.
43fut-2EGAP9.2n/achrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
44ZC190.9ZC190.9n/achrV 8,692,862
45C14E2.2C14E2.2n/achrX 1,808,144contains similarity to Pfam domain PF00155 Aminotransferase class I and II contains similarity to Interpro domains IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR004839 (Aminotransferase, class I and II), IPR000796 (Aspartate/other aminotransferase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
46F55E10.5F55E10.5n/achrX 8,335,538
47clec-202C30H6.4n/achrIV 17,362,968C. elegans CLEC-202 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
48sre-31F57G9.1n/achrII 12,407,787C. elegans SRE-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
49D1007.9D1007.9n/achrI 4,591,009
50gcy-4ZK970.5n/achrII 10,306,418gcy-4 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; by homology, GCY-4 may function as a chemosensory receptor; however, as loss of gcy-4 activity via mutation or large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of gcy-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; the sole gcy-4 ::GFP reporter construct reported to date did not produce any specific GFP signals.