UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK643.7ZK643.74e-52chrIII 8,925,977
2srh-219C06B8.6n/achrV 15,496,906C. elegans SRH-219 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F40D4.12F40D4.12n/achrV 17,161,146contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
4srg-17F15A4.7n/achrII 12,474,385C. elegans SRG-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
5clec-202C30H6.4n/achrIV 17,362,968C. elegans CLEC-202 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6cyp-34A3C41G6.1n/achrV 15,229,059C. elegans CYP-34A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
7srw-79T11F1.5n/achrII 2,947,802C. elegans SRW-79 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8srw-109ZK488.9n/achrV 607,863C. elegans SRW-109 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
9K01A11.1K01A11.1n/achrIII 3,429,872contains similarity to Dictyostelium discoideum PAXILLIN-like protein.; TR:Q8MML5
10scl-4C39E9.1n/achrIV 13,062,457C. elegans SCL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR000480 (Glutelin)
11F55C9.6F55C9.6n/achrV 19,295,191contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
12F56C3.9F56C3.9n/achrX 1,392,907contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related)
13W04B5.6W04B5.6n/achrIII 2,434,376
14sre-31F57G9.1n/achrII 12,407,787C. elegans SRE-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
15C12D8.9C12D8.9n/achrV 10,242,987contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8ELE1
16F35C12.1F35C12.1n/achrI 9,805,249contains similarity to Ralstonia solanacearum PopB.; TR:Q84IE7
17srb-15C48B6.5n/achrI 6,899,186C. elegans SRB-15 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18F11A5.8F11A5.8n/achrV 16,208,396contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
19W04E12.3W04E12.3n/achrV 19,737,520contains similarity to Bacillus subtilis Nuclease sbcCD subunit C.; SW:SBCC_BACSU
20F02C12.2F02C12.2n/achrX 13,398,638contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
21fbxa-220Y66A7A.1n/achrIII 11,483,373C. elegans FBXA-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
22ceh-28K03A11.3n/achrX 13,075,231A homeobox protein of the NK-2 family; it is expressed in a single pharyngeal neuron, M4.
23srw-36F14F8.7n/achrV 16,684,004C. elegans SRW-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
24C29F9.1C29F9.1n/achrIII 133,396
25F34H10.1F34H10.1n/achrX 9,626,427contains similarity to Homo sapiens ubiquitin and ribosomal protein S27a precursor; ENSEMBL:ENSP00000272317
26F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
27clec-201C30H6.3n/achrIV 17,359,724C. elegans CLEC-201 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
28Y39A3B.3Y39A3B.3n/achrIII 1,986,275
29C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
30abf-3F54B8.5n/achrV 15,817,602abf-3 encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum; ABF-3 may play a role in innate immunity, though at present the only evidence for its having an antimicrobial humoral function is its sequence similarity.
31srz-6T21B4.1n/achrII 12,492,894C. elegans SRZ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32daf-11B0240.3n/achrV 11,721,848The daf-11 gene encodes a guanylate cyclase that affects dauer formation, chemotaxis, and axon formation; it is genetically upstream of daf-12 with respect to dauer larvae formation and is expressed in a subset of amphid neurons.
33K02E7.11K02E7.11n/achrII 1,075,134
34glb-8C26C6.7n/achrI 7,510,602glb-8 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays; glb-8 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background; glb-8 expression is downregulated in a daf-2(e1370) mutant background under normoxic conditions; glb-8 expression is lower in L3 larvae than in young adults or dauers.
35LLC1.2LLC1.2n/achrIV 14,460,481contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
36srd-42R04D3.7n/achrX 13,302,450C. elegans SRD-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37srw-44F14F8.6n/achrV 16,681,440C. elegans SRW-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38Y54E5A.2Y54E5A.2n/achrI 14,694,856contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
39F53F4.1F53F4.1n/achrV 13,585,118contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
40T01C8.4T01C8.4n/achrX 16,788,345contains similarity to Pfam domain PF00155 Aminotransferase class I and II contains similarity to Interpro domains IPR004838 (Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR004839 (Aminotransferase, class I and II), IPR000796 (Aspartate/other aminotransferase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
41F33D11.6F33D11.6n/achrI 5,845,654
42srz-95Y102A5C.33n/achrV 16,992,941C. elegans SRZ-95 protein ;
43gpa-10C55H1.2n/achrV 6,853,746gpa-10 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADF, ASI, ASJ, ALN, CAN, LUA, and the spermatheca.
44M6.4M6.4n/achrX 631,028
45F54D12.8F54D12.8n/achrII 1,396,527contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR003609 (Apple-like)
46F56A11.4F56A11.4n/achrIV 550,691contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48nhr-132R11G11.1n/achrV 535,310C. elegans NHR-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49T02G6.1T02G6.1n/achrI 11,796,907contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4U4
50srx-32R13D11.9n/achrV 820,140C. elegans SRX-32 protein ;