UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK643.1ZK643.14e-169chrIII 8,934,736contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
2ZK863.1ZK863.1n/achrV 12,169,192contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
3lin-49F42A9.2n/achrIV 8,623,398C. elegans LIN-49 protein; contains similarity to Pfam domains PF00628 (PHD-finger) , PF00439 (Bromodomain) contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR001487 (Bromodomain), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
4T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
5K02E10.7K02E10.7n/achrX 2,504,770contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
6F52C6.14F52C6.14n/achrII 1,932,827contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
7srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
8dgk-3F54G8.2n/achrIII 9,165,462dgk-3 encodes a diacylglycerol kinase that is the C. elegans ortholog of mammalian DGK-beta; dgk-3 activity is required for regulation of long-term thermotactic behavioral plasticity and for regulation of olfactory adaptation; large-scale expression studies have reported dgk-3 expression in head neurons, the intestine, and the pharyngeal lumen, while expression profiling indicates that dgk-3 is expressed in the AFD thermosensory neurons as well as a small number of additional sensory neurons.
9Y56A3A.28Y56A3A.28n/achrIII 11,966,536contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
10srg-8T12A2.9n/achrIII 6,254,139C. elegans SRG-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
11F09G2.2F09G2.2n/achrV 7,197,657contains similarity to Interpro domain IPR011028 (Cyclin-like)
12Y75B8A.31Y75B8A.31n/achrIII 12,353,159contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of UPF0528 protein C5orf21 precursor; ENSEMBL:ENSP00000265139
13F09E5.10F09E5.10n/achrII 5,349,294contains similarity to Interpro domain IPR009079 (Four-helical cytokine-like, core)
14C32B5.4C32B5.4n/achrII 980,130contains similarity to Interpro domains IPR000931 (Adenovirus fibre protein), IPR008893 (WGR)
15sulp-1C55B7.6n/achrI 6,484,156sulp-1 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-1 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-1::GFP transcriptional fusion is expressed strongly in several neurons, weakly in hypodermal cells and the intestine, and very faintly in the excretory cell and body wall muscle.
16lgc-18T01H10.7n/achrX 12,126,727C. elegans LGC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
17T20D3.11T20D3.11n/achrIV 9,349,648contains similarity to Anopheles gambiae str PEST AGAP009276-PA (Fragment).; TR:Q7PVH5
18C37A2.6C37A2.6n/achrI 6,788,535contains similarity to Pfam domain PF06325 Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA) contains similarity to Interpro domain IPR010456 (Ribosomal L11 methyltransferase)
19C35C5.6C35C5.6n/achrX 11,566,764contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2478-PA;; FLYBASE:CG2478
20K10C9.4K10C9.4n/achrV 1,051,572contains similarity to Interpro domain IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
21H14E04.1H14E04.1n/achrIII 2,404,160contains similarity to Pfam domains PF02353 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase) , PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) , PF01209 (ubiE/COQ5 methyltransferase family) contains similarity to Interpro domains IPR004033 (UbiE/COQ5 methyltransferase), IPR003333 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
22E03H4.7E03H4.7n/achrI 12,422,814contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
23K03H6.4K03H6.4n/achrIV 1,519,644
24F52H2.4F52H2.4n/achrX 2,546,392contains similarity to Pfam domain PF00474 Sodium:solute symporter family contains similarity to Interpro domains IPR010979 (Ribosomal protein S13-like, H2TH), IPR001734 (Na+/solute symporter)
25tsp-8F33C8.3n/achrX 14,727,975tsp-8 is orthologous to the human gene KANGAI 1 (SUPPRESSION OF TUMORIGENICITY 6, PROSTATE; CD82 ANTIGEN (R2 LEUKOCYTE ANTIGEN, ANTIGEN DETECTED BY MONOCLONAL AND ANTIBODY IA4)) (KAI1; OMIM:600623), which when mutated leads to disease.
26nhr-103F44C8.4n/achrV 2,226,236nhr-103 encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain.
27clec-9Y70C5C.2n/achrV 16,705,835C. elegans CLEC-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
28lgc-49K10D6.1n/achrV 11,192,427C. elegans LGC-49 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR001390 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha subunit), IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
29K03E5.1K03E5.1n/achrI 3,431,349contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR000859 (CUB)
30T06D8.2T06D8.2n/achrII 11,229,674contains similarity to Pfam domain PF02151 UvrB/uvrC motif contains similarity to Interpro domains IPR009055 (UvrB, C-terminal UvrC-binding), IPR001943 (UvrB/UvrC protein)
31tsp-3Y39E4B.4n/achrIII 13,213,403C. elegans TSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domain IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen)
32T26E4.7T26E4.7n/achrV 15,794,497contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33hyl-2K02G10.6n/achrX 4,698,095hyl-2 encodes a predicted transmembrane protein that is related to Saccharomyces cerevisiae LAG1 (longevity assurance gene), a protein preferentially expressed in young yeasts; by homology, HYL-2 is predicted to have several possible functions, including regulation of lipid, particularly ceramide, biosynthesis, regulation of lipid transport, and regulation of protein translocation in the endoplasmic reticulum ; however, as loss of hyl-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of hyl-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
34ZK1098.1ZK1098.1n/achrIII 9,523,635ZK1098.1 encodes a protein, with multiple WW/rsp5/WWP domains and FF domains, required for embryonic viability and for normally high rates of postembryonic growth.
35T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
36C03C10.4C03C10.4n/achrIII 4,097,487contains similarity to Pfam domain PF05276 SH3 domain-binding protein 5 (SH3BP5) contains similarity to Interpro domain IPR007940 (SH3-binding 5)
37C01B12.5C01B12.5n/achrII 10,817contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domains IPR000615 (Bestrophin), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein)
38mys-1VC5.4n/achrV 7,083,085mys-1 encodes a MYST family histone acetyltransferase orthologous to Drosophila EG0007.7, human TIP60, and S. cerevisiae Esa1p; during vulval development, mys-1 acts as Class C synMuv gene: mys-1 mutations enhance mutations in components of the C. elegans NuRD and Rb repressor complexes that negatively regulate expression of genes required for vulval induction; in addition, mys-1(RNAi) enhances mutations in pha-4, which encodes a FoxA transcription factor required for pharyngeal organogenesis; mys-1 mutations also cause a synthetic slow growth phenotype in combination with mutations in the MCD-1 zinc-finger protein; thus, mys-1 activity is essential for proper cell fate specification of different cell types at different times during C. elegans development.
39clec-131W10G11.7n/achrII 3,575,385C. elegans CLEC-131 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40irk-2M02A10.2n/achrX 706,700irk-2 encodes an inwardly rectifying potassium channel based on sequence homology to the the human potassium channel genes KCNJ1/KCNJ2.
41nud-2R11A5.2n/achrI 7,858,613nud-2 encodes an ortholog of human NDE1 (OMIM:609449) and NDEL1 (OMIM:607538), effectors of LIS1 (OMIM:601545); NUD-2, along with other orthologs of LIS1-associated proteins (NUD-1, DHC-1, CDK-5, and CDKA-1), is required to prevent convulsions induced by exposure to the GABA antagonist pentylenetetrazole (PTZ); nud-2(RNAi), like RNAi of nud-1 et al., not only induces PTZ susceptibility but also causes GABA-containing synaptic vesicles in the ventral nerve cord to be distributed raggedly, and nud-2(RNAi) animals are abnormally susceptible to paralysis by the GABA agonist muscimol; nud-2(RNAi) phenotypes are dominantly enhanced by a heterozygous lis-1 allele, and nud-2(RNAi) delays the recovery from PTZ-induced paralysis of lis-1 heterozygotes.
42C01G10.9C01G10.9n/achrV 15,083,391contains similarity to Pfam domain PF01008 Initiation factor 2 subunit family contains similarity to Interpro domains IPR000649 (Initiation factor 2B related), IPR011559 (Initiation factor 2B alpha/beta/delta)
43srw-119K12D9.7n/achrV 2,999,188C. elegans SRW-119 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44fbxb-15ZC204.7n/achrII 1,653,009C. elegans FBXB-15 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
45srb-9F37C12.16n/achrIII 7,174,868C. elegans SRB-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
46Y62H9A.3Y62H9A.3n/achrX 11,879,462contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin)
47F13G3.10F13G3.10n/achrI 7,313,972contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
48C35C5.2C35C5.2n/achrX 11,539,654contains similarity to Pfam domains PF04389 (Peptidase family M28) , PF02225 (PA domain) , PF04253 (Transferrin receptor-like dimerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR007365 (Transferrin receptor-like, dimerisation), IPR007484 (Peptidase M28), IPR003137 (Protease-associated PA)
49F53G2.8F53G2.8n/achrII 2,483,639
50srh-184D1054.12n/achrV 10,797,485C. elegans SRH-184 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)