UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK622.1ZK622.10chrII 5,294,747contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
2F48F5.1F48F5.1n/achrV 20,437,708contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR003546 (Protein-tyrosine phosphatase, modular, Salmonella/Yersinia), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
3K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
4F26A1.4F26A1.4n/achrIII 4,818,558contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
5ZC581.7ZC581.72e-51chrI 6,661,388contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
6srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7F55D12.6F55D12.6n/achrI 7,902,571contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001865 (Ribosomal protein S2), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
8C06A1.3C06A1.3n/achrII 10,573,080contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
9T08B6.4T08B6.4n/achrIV 4,907,072contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
10B0513.6B0513.6n/achrIV 13,855,821contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
11ZC412.5ZC412.5n/achrV 14,874,791
12C50E10.2C50E10.2n/achrII 12,306,600contains similarity to Pfam domain PF06887 (Protein of unknown function (DUF1265))
13C18E9.8C18E9.8n/achrII 8,986,939C18E9.8 is orthologous to the human gene JOINED TO JAZF1 (JJAZ1; OMIM:606245), which when mutated leads to disease.
14C04G2.2C04G2.20.0001chrIV 10,091,506contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15Y43F8A.2Y43F8A.2n/achrV 19,373,855contains similarity to Homo sapiens Cytokine receptor common beta chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000262825
16sri-66F28B1.6n/achrV 17,060,972C. elegans SRI-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17ncl-1ZK112.2n/achrIII 7,734,657ncl-1 encodes a cytoplasmic B-box zinc finger protein that negatively regulates rRNA and 5S RNA transcription, nucleolus size, and body size; NCL-1 is orthologous to Drosophila BRAIN TUMOR (BRAT), and ncl-1 mutants can be rescued by brat transgenes; NCL-1 is required for the normally small size of neuronal, muscle, and hypodermal nucleoli, and is already active in 4-cell embryos; NCL-1 may be a repressor of RNA polymerase I and III transcription and an inhibitor of cell growth, based on mutant analysis; ncl-1 animals have much larger neuronal nucleoli than normal, somewhat larger muscle and hypodermal nucleoli, but essentially normal intestinal and germline nucleoli (the last of which are large even in wild-type animals); conversely, intestinal and germline cells have the lowest amounts of NCL-1 protein; ncl-1 animals are 9% larger, have 22% more protein and twice as much rRNA, and transcribe rRNA twice as much as wild-type worms; ncl-1 functions cell autonomously, and ncl-1 mutations suppress the tumorous germline phenotype of pro-1(na48) mutants.
18C06A5.2C06A5.2n/achrI 6,006,816contains similarity to Homo sapiens Microtubule-associated protein 1B; ENSEMBL:ENSP00000296755
19F23C8.7F23C8.72e-68chrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
20C47A4.3C47A4.3n/achrIV 13,741,621contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
21F02C9.4F02C9.4n/achrV 3,137,852contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
22snf-2F55H12.1n/achrI 8,873,592C. elegans SNF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
23F47B3.2F47B3.2n/achrI 3,970,840contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
24ZK1010.5ZK1010.5n/achrIII 12,985,882contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
25H06O01.4H06O01.4n/achrI 7,003,489contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
26Y24D9B.1Y24D9B.1n/achrIV 4,319,658contains similarity to Interpro domain IPR001469 (ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit)
27C09B9.4C09B9.4n/achrIV 5,032,484contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28F41G3.5F41G3.5n/achrII 6,748,034contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
29F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
30cyn-2ZK520.5n/achrIII 13,693,091cyn-2 is a predicted member of the cytosolic Cyclosporin A-binding cyclophilin family that is functional when expressed in E. coli.
31F54C8.1F54C8.1n/achrIII 9,440,304contains similarity to Pfam domains PF00725 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02737 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008927 (6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like), IPR006108 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR006176 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding), IPR006180 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR006036 (Potassium uptake protein TrkA)
32srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
34Y45F10B.2Y45F10B.2n/achrIV 13,595,366contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_6700.; TR:Q98PP9
35T22C1.9T22C1.9n/achrI 7,959,350contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nuclear Assembly Factor; SGD:YNL124W
36fbxa-202T28C12.3n/achrV 6,328,019This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37C27B7.6C27B7.6n/achrIV 8,904,670contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
38F36H12.14F36H12.14n/achrIV 5,263,576
39T04A6.3T04A6.3n/achrIII 7,608,687contains similarity to Interpro domain IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein)
40T05A7.6T05A7.60.0000003chrII 4,670,226contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
41C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
42R10D12.10R10D12.10n/achrV 13,957,221contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43T02H6.7T02H6.7n/achrII 683,000contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
44W06D4.3W06D4.3n/achrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
45C16D9.5C16D9.5n/achrV 8,244,484contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
46H32C10.3H32C10.3n/achrIV 5,918,692contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (5), PF01529 (DHHC zinc finger domain) contains similarity to Interpro domains IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type), IPR002110 (Ankyrin)
47H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
48ZK484.7ZK484.7n/achrI 6,095,825contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
49C48B6.4C48B6.4n/achrI 6,890,348contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
50C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582