UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1ZK593.9ZK593.90chrIV 10,941,883contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
2F45E4.6F45E4.6n/achrIV 7,631,176contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
3col-89F17C8.2n/achrIII 4,748,632C. elegans COL-89 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
4grl-9ZC487.4n/achrV 6,730,970grl-9 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
5R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
6F14H3.2F14H3.2n/achrV 16,050,616contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
7C50E10.1C50E10.1n/achrII 12,301,690contains similarity to Gibberella zeae Hypothetical protein.; TR:Q4IR83
8nhr-266F56H1.2n/achrI 5,738,931C. elegans NHR-266 protein; contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
9R08C7.8R08C7.8n/achrIV 4,433,806contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
10T10E9.3T10E9.3n/achrI 6,536,631contains similarity to Pfam domain PF03351 DOMON domain contains similarity to Interpro domains IPR005018 (DOMON related), IPR013050 (DOMON)
11K09C6.2K09C6.2n/achrV 857,653contains similarity to Yarrowia lipolytica Similar to sp|P32583 Saccharomyces cerevisiae YKR092c SRP40 Suppressorsprotein.; TR:Q6CEY9
12srz-12K08G2.7n/achrV 15,862,049C. elegans SRZ-12 protein ;
13clec-155T04A8.3n/achrIII 4,684,119C. elegans CLEC-155 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
14F36D3.5F36D3.5n/achrV 16,512,428contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
15ZK354.3ZK354.3n/achrIV 5,310,807contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
16mps-3T06A4.2n/achrI 761,378mps-3 encodes a single-pass transmembrane protein that is related to the vertebrate KCNE proteins, also known as MinK-related peptides (MiRPs) that associate with, and regulate, pore-forming ion channels; mps-1 is required for the normal function of several neurons and thus for normal body touch sensation, chemotaxis to select molecules, osmotic avoidance, and nose-touch; when coexpressed in tissue culture cells with C. elegans KVS-1, MPS-3 is able to alter the activity of this potassium-selective channel, suggesting that MPS-3 functions in vivo to regulate KVS-1 activity in neurons in which the two proteins are coexpressed; in addition, activity of MPS-2, MPS-3, and KVS-1 coexpressed in culture suggests that these three proteins can form a functional ternary complex that genetic analyses indicate likely plays a role in regulating responsiveness to sodium; MPS-3 reporter fusions are expressed in the ADF amphid sensory neuron, the PVC and PVN neurons, and two neurons in the anterior bulb of the pharynx.
17sfxn-1.4C47D12.3n/achrII 11,680,034C. elegans SFXN-1.4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03820 Tricarboxylate carrier contains similarity to Interpro domain IPR004686 (Tricarboxylate/iron carrier)
18R05A10.1R05A10.1n/achrIV 14,187,493
19elo-7F56H11.3n/achrIV 9,530,584The elo-7 gene encodes a paralog of elo-1 and elo-2, each of which encodes a polyunsaturated fatty acid (PUFA) elongase; ELO-7 has no known function in vivo.
20K07H8.7K07H8.7n/achrIV 8,259,664contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
21H39E20.1H39E20.1n/achrX 1,396,448
22C32C4.3C32C4.3n/achrV 10,646,016contains similarity to Yersinia pestis Putative phage-related membrane protein.; TR:Q8ZEA4
23F19B6.3F19B6.3n/achrIV 12,327,905contains similarity to Lactococcus lactis Unknown protein.; TR:Q9CF64
24W05B10.3W05B10.3n/achrV 12,661,622contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV209 putative vaccinia A21L homolog, similar to SW:P20996.; TR:Q9YVN3
25Y41C4A.7Y41C4A.7n/achrIII 11,699,359contains similarity to Interpro domain IPR008962 (PapD-like)
26Y54E2A.9Y54E2A.9n/achrII 14,785,517contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
27Y37A1A.2Y37A1A.2n/achrIV 13,909,126contains similarity to Pfam domain PF05978 Eukaryotic protein of unknown function (DUF895) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
28skr-20R12H7.5n/achrX 13,223,155The skr-20 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-20(RNAi) animals are at least superficially normal.
29F35B3.1F35B3.1n/achrX 17,016,472contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
30cdc-25.4R05H5.2n/achrII 10,189,551a homolog of dual specificity phosphatase Cdc25.
31C18H2.3C18H2.3n/achrIII 7,685,691contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
32T02H6.6T02H6.6n/achrII 683,947
33R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
34R05D7.2R05D7.2n/achrI 12,166,865contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
35C34C12.4C34C12.4n/achrIII 3,468,832contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf34; ENSEMBL:ENSP00000295958
36R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
37gska-3C36B1.100.005chrI 8,750,510C. elegans GSKA-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38T27E4.6T27E4.6n/achrV 9,071,672contains similarity to Interpro domain IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
39F56F4.3F56F4.3n/achrI 6,142,912contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR002208 (SecY protein), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
40T02E1.6T02E1.6n/achrI 8,211,732contains similarity to Akodon andinus NADH dehydrogenase subunit 4 (EC 1.6.5.3) (NADH-ubiquinonesoxidoreductase chain 4) (Fragment).; TR:O21539
41Y69H2.11Y69H2.11n/achrV 18,644,329contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
42H06H21.9H06H21.9n/achrIV 4,826,390H06H21.9 encodes a Caenorhabditis-specific protein with two PDZ domains that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
43sru-23F36G9.6n/achrV 15,971,479C. elegans SRU-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
44ZK354.8ZK354.8n/achrIV 5,305,065contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
45F54C1.8F54C1.8n/achrI 5,005,486
46srw-72F20E11.6n/achrV 17,467,788C. elegans SRW-72 protein ;
47F35C8.2F35C8.2n/achrX 5,375,578contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48F40F12.3F40F12.3n/achrIII 9,919,252
49Y40B1A.3Y40B1A.3n/achrI 13,356,226contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region)
50Y43F8A.3Y43F8A.3n/achrV 19,379,196contains similarity to Pfam domain PF07859 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR017157 (Arylacetamide deacetylase), IPR013094 (Alpha/beta hydrolase fold-3)