UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK550.5ZK550.50chrIV 17,258,404contains similarity to Pfam domain PF05721 Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) contains similarity to Interpro domain IPR008775 (Phytanoyl-CoA dioxygenase)
2T05C12.1T05C12.1n/achrII 8,174,196contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
3F35E2.9F35E2.9n/achrI 11,724,844contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
4ncx-8C13D9.7n/achrV 4,985,459ncx-8 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-6/-7 and NCX-9/-10; NCX-8 may function intracellularly; NCX-8 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-8 is required for normally high levels of body fat.
5ZK666.8ZK666.8n/achrII 10,492,235contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
6C04E6.4C04E6.4n/achrV 5,908,497
7fbxb-7Y20C6A.2n/achrV 17,378,293C. elegans FBXB-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
8srd-26T02B5.4n/achrV 14,162,174C. elegans SRD-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9ptr-16T21H3.2n/achrV 1,172,902ptr-16 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-16 is partially required for normal molting from L2 to L3 larval stages; however, PTR-16 and PTR-1 together are strongly required for both molting and viability, with double ptr-1/-16 RNAi animals showing pronounced molting defects and lethality; PTR-16 is also required for normal growth to full size and locomotion.
10C09B9.2C09B9.2n/achrIV 5,030,143
11F45E4.6F45E4.6n/achrIV 7,631,176contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
12sru-17T04A11.10n/achrIV 12,506,509C. elegans SRU-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
13F54H5.2F54H5.2n/achrII 6,628,318contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14ZK593.9ZK593.9n/achrIV 10,941,883contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
15hdl-1ZK829.2n/achrIV 11,947,905C. elegans HDL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00282 Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR010977 (Aromatic-L-amino-acid decarboxylase), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
16Y52B11B.1Y52B11B.1n/achrI 11,123,920contains similarity to Lactococcus lactis FhuD-like protein.; TR:Q8VU74
17srd-4ZK863.5n/achrV 12,185,574C. elegans SRD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18ZK632.4ZK632.4n/achrIII 9,806,382ZK632.4 is orthologous to the human gene PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE (MPI; OMIM:154550), which when mutated leads to disease.
19cyp-33C4F44C8.1n/achrV 2,237,058C. elegans CYP-33C4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
20R08C7.8R08C7.8n/achrIV 4,433,806contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
21C14C6.8C14C6.8n/achrV 552,129contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22sra-37T21H8.2n/achrX 13,892,086C. elegans SRA-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
23snf-9C49C3.1n/achrIV 17,313,754C. elegans SNF-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
24W01B6.6W01B6.6n/achrIV 10,081,890contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
25ZK1128.3ZK1128.3n/achrIII 10,117,815contains similarity to Mus musculus 2410017P07Rik protein.; TR:Q9CZE0
26F09B9.4F09B9.4n/achrX 10,161,110contains similarity to Interpro domain IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle)
27F14H3.2F14H3.2n/achrV 16,050,616contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
28F35C11.2F35C11.2n/achrII 8,245,233contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
29srx-56C03G6.2n/achrV 7,374,979C. elegans SRX-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
30T28H10.3T28H10.3n/achrV 12,513,961contains similarity to Pfam domain PF01650 Peptidase C13 family contains similarity to Interpro domain IPR001096 (Peptidase C13, legumain)
31F46H5.5F46H5.5n/achrX 7,256,401
32F45E1.3F45E1.3n/achrX 7,987,677contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
33C04G2.10C04G2.10n/achrIV 10,116,708contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
34T25B9.6T25B9.6n/achrIV 10,759,435contains similarity to Interpro domain IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
35lact-2ZK945.1n/achrII 10,096,751lact-2 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted transmembrane domain in its N terminus.
36fbxb-48F45C12.13n/achrII 1,718,632C. elegans FBXB-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
37bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
38C06A5.6C06A5.6n/achrI 5,984,551
39R06B9.1R06B9.1n/achrII 13,764,398contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
40srw-2T03D3.3n/achrV 2,831,793C. elegans SRW-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
41nhr-18F44C8.3n/achrV 2,228,092The nhr-18 gene encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain; the human homolog of nhr-18, CYP21, when mutated leads to congenital adrenal hyperplasia (OMIM:201910).
42Y42A5A.3Y42A5A.3n/achrV 11,095,685contains similarity to Bacillus subtilis Hypothetical protein yhen.; TR:O07596
43col-89F17C8.2n/achrIII 4,748,632C. elegans COL-89 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
44ZK596.2ZK596.2n/achrIV 10,908,696contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
45clec-59ZK666.5n/achrII 10,478,656C. elegans CLEC-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
46F35H8.1F35H8.1n/achrII 9,552,878contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ILJ6
47C06E7.4C06E7.4n/achrIV 5,855,392contains similarity to Human cytomegalovirus Protein UL53 (Protein HFRF2).; SW:P16794
48C28D4.4C28D4.4n/achrIV 9,744,359contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
49F23C8.11F23C8.11n/achrI 2,450,235contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
50K12D9.12K12D9.12n/achrV 3,021,212contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)