UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK512.2ZK512.20chrIII 9,143,217contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
2ace-2Y44E3A.2n/achrI 3,304,491An acetylcholineesterase involved in the termination of cholinergic nerve transmission; it is predominantly expressed in motoneurons.
3clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
4W03G9.7W03G9.7n/achrI 4,988,180contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii Chromosome partition protein smc homolog.; SW:Q59037
5fbxa-160C08E3.12n/achrII 1,624,293C. elegans FBXA-160 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
6C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
7F43B10.1F43B10.1n/achrX 16,662,035
8W05H5.1W05H5.1n/achrII 12,443,814contains similarity to Ovis aries Lysophosphatidic acid receptor Edg-2 (LPA receptor 1) (LPA-1).; SW:EDG2_SHEEP
9Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)
10C46H11.3C46H11.3n/achrI 5,041,773contains similarity to Pfam domain PF04699 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) contains similarity to Interpro domains IPR006789 (ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
11ZK669.2ZK669.2n/achrII 7,937,580contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
12osm-12Y75B8A.12n/achrIII 12,196,633C. elegans OSM-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016575 (Bardet-Biedl syndrome 7 protein)
13srx-23F31F4.2n/achrV 683,114C. elegans SRX-23 protein ;
14rrf-2M01G12.12n/achrI 12,102,320rrf-2 encodes an RNA-directed RNA polymerase (RdRP) homolog of unknown function; RRF-2 is not obviously required for either somatic or germline RNAi, or for transitive RNAi.
15srx-46E02C12.2n/achrV 9,353,867C. elegans SRX-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16K04H8.2K04H8.2n/achrI 14,254,220contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
17T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
18F15E6.5F15E6.5n/achrIV 4,289,807contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
19K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20Y62H9A.10Y62H9A.10n/achrX 11,901,221contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
22srx-122F35F10.8n/achrV 3,296,984C. elegans SRX-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23T01C4.1T01C4.1n/achrV 7,126,255contains similarity to Pfam domains PF01476 (LysM domain) (4), PF05938 (Plant self-incompatibility protein S1) , PF00704 (Glycosyl hydrolases family 18) contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR010264 (Plant self-incompatibility S1), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR001579 (Glycoside hydrolase, chitinase active site), IPR002482 (Peptidoglycan-binding LysM), IPR001002 (Chitin-binding, type 1)
24K09E2.2K09E2.2n/achrX 8,677,297
25nhr-136C13C4.3n/achrV 12,108,116C. elegans NHR-136 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26cyp-25A6K06B9.1n/achrIV 4,197,909C. elegans CYP-25A6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR000044 (Mycoplasma lipoprotein (MG045))
27F11D11.6F11D11.6n/achrV 18,752,774contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
28K05G3.2K05G3.2n/achrX 16,497,319
29cdc-25.2F16B4.8n/achrV 1,581,313cdc-25.2 encodes a putative homolog of Cdc25 phosphatase protein family that affects germline proliferation.
30nhr-150C06B8.1n/achrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31mel-26ZK858.4n/achrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
32clec-92Y52B11A.5n/achrI 11,016,484C. elegans CLEC-92 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33C01G5.7C01G5.7n/achrIV 6,518,588
34clec-195Y116A8C.21n/achrIV 17,044,558C. elegans CLEC-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35C15C8.5C15C8.5n/achrV 12,749,106contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
36fkh-5F26A1.2n/achrIII 4,845,567fkh-5 encodes a member of the forkhead domain transcription factor family.
37sdf-9Y44A6D.4n/achrV 20,795,100sdf-9 encodes a protein tyrosine phosphatase, paralogous to EAK-6; sdf-9 acts in parallel to akt-1 to regulate insulin-like signaling and dauer formation and may promote DAF-9 activity by means of steroid hormone signalling; sdf-9 dauer larvae resemble those of daf-9 and daf-12 dauer-constitutive mutants, and these Daf-c mutants are all enhanced by cholesterol deprivation; SDF-9 is expressed in the neuroendocrine XXXL/R cells, where it associates with the plasma membrane; ablation of the XXXL/R cells in wild-type L1 larvae also causes daf-9-like pseudodauer larvae.
38C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
39F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
40B0432.1B0432.1n/achrII 298,462
41Y43F8C.13Y43F8C.13n/achrV 19,691,051contains similarity to Pfam domain PF01156 Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001910 (Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase)
42fbxa-168C31C9.4n/achrII 13,647,223This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
43C07A4.3C07A4.3n/achrX 10,175,118contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
44Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
45Y75B8A.6Y75B8A.6n/achrIII 12,127,086The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
46nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
47R05H10.5R05H10.5n/achrII 14,868,296contains similarity to Pfam domain PF00255 Glutathione peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
48R07G3.8R07G3.8n/achrII 7,619,307contains similarity to Pfam domain PF07159 Protein of unknown function (DUF1394) contains similarity to Interpro domain IPR009828 (Protein of unknown function DUF1394)
49C04C3.6C04C3.6n/achrIV 3,421,207contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)