UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK384.3ZK384.30chrV 18,730,891contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR001461 (Peptidase A1)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3sre-14C42C1.1n/achrIV 12,260,640C. elegans SRE-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
4str-4C50B6.10n/achrV 13,338,836C. elegans STR-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5C14A6.5C14A6.5n/achrV 18,164,125contains similarity to Arabidopsis thaliana Calreticulin 2 precursor.; SW:CRT2_ARATH
6nhr-149C03G6.12n/achrV 7,349,121C. elegans NHR-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7str-130C09H5.9n/achrV 8,089,962C. elegans STR-130 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F27C1.11F27C1.11n/achrI 5,439,915contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF03607 (Doublecortin) , PF01477 (PLAT/LH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001024 (Lipoxygenase, LH2), IPR008976 (Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2), IPR003533 (Doublecortin), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
9str-264C06B8.4n/achrV 15,491,810C. elegans STR-264 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10srz-70C09G12.6n/achrIV 3,478,198C. elegans SRZ-70 protein ;
11sra-30Y40H7A.6n/achrIV 15,197,622C. elegans SRA-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
12sra-17F28C12.1n/achrI 12,689,638C. elegans SRA-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
13F55B12.2F55B12.2n/achrV 13,816,154contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
14cyp-34A8B0213.14n/achrV 3,966,310C. elegans CYP-34A8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
15srh-296Y94A7B.4n/achrV 17,811,540C. elegans SRH-296 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17hyl-2K02G10.6n/achrX 4,698,095hyl-2 encodes a predicted transmembrane protein that is related to Saccharomyces cerevisiae LAG1 (longevity assurance gene), a protein preferentially expressed in young yeasts; by homology, HYL-2 is predicted to have several possible functions, including regulation of lipid, particularly ceramide, biosynthesis, regulation of lipid transport, and regulation of protein translocation in the endoplasmic reticulum ; however, as loss of hyl-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of hyl-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
18srd-30F07C4.5n/achrV 7,630,532C. elegans SRD-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19C36B7.3C36B7.3n/achrX 7,101,897
20C06C6.1C06C6.1n/achrV 16,011,384contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR010916 (TonB box, conserved site)
21sre-38F15A4.1n/achrII 12,458,457C. elegans SRE-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
22str-87F59E11.16n/achrV 8,987,304C. elegans STR-87 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23C16D6.2C16D6.2n/achrX 12,544,267contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR001402 (Prolactin-releasing peptide receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24srx-117C14C11.5n/achrV 5,645,343C. elegans SRX-117 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25Y71A12C.2Y71A12C.2n/achrI 14,047,116contains similarity to Pfam domain PF09335 SNARE associated Golgi protein contains similarity to Interpro domain IPR015414 (SNARE associated Golgi protein)
26srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
28C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
29ins-24ZC334.3n/achrI 14,031,394ins-24 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-24 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans, but as loss of INS-24 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of INS-24 in C. elegans development is not yet clear.
30str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31Y113G7B.24Y113G7B.24n/achrV 20,231,897contains similarity to Pfam domain PF05916 Synthetic lethal mutants of dpb11-1 five contains similarity to Interpro domain IPR008591 (GINS complex, Sld5 component)
32Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
33F55C7.2F55C7.2n/achrI 4,005,729
34F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
35srbc-1F35F10.9n/achrV 3,300,439C. elegans SRBC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36F35G8.1F35G8.1n/achrX 9,317,241contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
38str-233C06C6.2n/achrV 16,008,971C. elegans STR-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39F55D1.2F55D1.2n/achrX 5,488,910
40sri-45K07E8.9n/achrII 660,949C. elegans SRI-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F28C6.5F28C6.5n/achrII 8,599,990contains similarity to Mus musculus Activity-dependent neuroprotector (Activity-dependent neuroprotectivesprotein).; SW:ADNP_MOUSE
42tsp-8F33C8.3n/achrX 14,727,975tsp-8 is orthologous to the human gene KANGAI 1 (SUPPRESSION OF TUMORIGENICITY 6, PROSTATE; CD82 ANTIGEN (R2 LEUKOCYTE ANTIGEN, ANTIGEN DETECTED BY MONOCLONAL AND ANTIBODY IA4)) (KAI1; OMIM:600623), which when mutated leads to disease.
43egl-10F28C1.2n/achrV 12,459,067egl-10 encodes an RGS protein, expressed in neurons, that affects egg laying and negatively regulates GOA-1 (Galpha[o]) signalling; it requires the Gbeta(5) ortholog GPB-2 for this activity, and genetically interacts with the egl-30 and goa-1 signaling pathways.
44T24C2.3T24C2.3n/achrX 14,544,021contains similarity to Arabidopsis thaliana F25I16.10 protein.; TR:Q9FZ78
45F44A2.2F44A2.2n/achrV 9,319,570contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
46C36B7.2C36B7.2n/achrX 7,106,598contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
47F16G10.13F16G10.13n/achrII 2,395,441contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
48str-124T22H6.3n/achrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49srx-46E02C12.2n/achrV 9,353,867C. elegans SRX-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50D2007.2D2007.2n/achrIII 8,153,415D2007.2 is orthologous to the human gene TRANSKETOLASE (WERNICKE-KORSAKOFF SYNDROME) (TNF; OMIM:606781), which when mutated leads to disease.