UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK265.3ZK265.30chrI 8,242,831contains similarity to Ascaris suum MFP2.; TR:Q7YXK2
2Y57A10B.7Y57A10B.7n/achrII 12,393,162contains similarity to Rattus norvegicus Merlin (Schwannomin) (Neurofibromin 2) (Fragment).; SW:MERL_RAT
3F36D3.4F36D3.4n/achrV 16,517,063contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
4T04A6.3T04A6.30.007chrIII 7,608,687contains similarity to Interpro domain IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein)
5cyn-2ZK520.5n/achrIII 13,693,091cyn-2 is a predicted member of the cytosolic Cyclosporin A-binding cyclophilin family that is functional when expressed in E. coli.
6T21G5.4T21G5.4n/achrI 6,873,167contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
7C38C3.8C38C3.85e-35chrV 1,505,005contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
8C16A11.7C16A11.7n/achrII 4,256,423
9Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
10sfxn-1.2F37H8.4n/achrII 11,186,977C. elegans SFXN-1.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03820 Tricarboxylate carrier contains similarity to Interpro domain IPR004686 (Tricarboxylate/iron carrier)
11F47B3.5F47B3.5n/achrI 3,963,648contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
12C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582
13F23C8.7F23C8.7n/achrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
14C17F3.3C17F3.3n/achrI 6,682,871contains similarity to Interpro domains IPR000956 (Stathmin), IPR005819 (Histone H5), IPR000533 (Tropomyosin), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
15C47A4.5C47A4.5n/achrIV 13,745,790contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
16F32H2.7F32H2.7n/achrI 8,996,424contains similarity to Staphylococcus staphylolyticus Lysostaphin precursor (EC 3.4.24.75) (Glycyl-glycine endopeptidase).; SW:LSTP_STAST
17K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
18ZK1225.4ZK1225.4n/achrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
19F42C5.5F42C5.5n/achrIV 7,293,350contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
20AH6.3AH6.3n/achrII 9,519,577contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
21T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
22C38C3.3C38C3.3n/achrV 1,497,058
23clec-251F11D11.8n/achrV 18,746,563C. elegans CLEC-251 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
24F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
25rmd-6R13H9.1n/achrIV 5,069,350C. elegans RMD-6 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
26C43G2.3C43G2.3n/achrIV 6,578,783
27F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
28F44F4.10F44F4.10n/achrII 10,916,498F44F4.1 encodes a nematode-specific sperm protein probably required for a normally high ovulation rate; F44F4.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, T08G11.2, and Y81G3A.1); F44F4.1(tm332) hermaphrodites show abnormal egg-laying, retaining significantly fewer eggs than wild-type (perhaps due to a lowered ovulation rate) while retaining late-stage embryos; F44F4.1 has no obvious phenotype in mass RNAi experiments, possibly because of genetic redundancy with its paralogs; F44F4.1 expression is enriched in spermatogenesis.
29ZK512.8ZK512.8n/achrIII 9,146,610contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CDC5 is dispensable for premeiotic DNA synthesis and recombination, but required for tripartite synaptonemal complexes, haploidization, and spores; SGD:YMR001C
30C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
31T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
32F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
33F36H12.5F36H12.5n/achrIV 5,267,206contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
34C15H7.3C15H7.3n/achrIII 9,651,090contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
35K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
36R03D7.5R03D7.5n/achrII 10,948,319contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37C08H9.10C08H9.10n/achrII 9,854,672contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
38C47A4.3C47A4.3n/achrIV 13,741,621contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
39clec-123Y25C1A.1n/achrII 3,115,497C. elegans CLEC-123 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40F32B4.2F32B4.2n/achrI 11,513,362contains similarity to Interpro domain IPR002056 (Protein import receptor MAS20)
41ssq-3ZC477.1n/achrIV 7,112,230C. elegans SSQ-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001553 (RecA bacterial DNA recombination), IPR013286 (Annexin, type VII)
42T08B6.4T08B6.4n/achrIV 4,907,072contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
43F26A1.4F26A1.4n/achrIII 4,818,558contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
44C04F12.6C04F12.6n/achrI 9,693,209contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR013303 (Wnt-14 protein)
45C03C11.1C03C11.1n/achrI 10,015,075contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR002952 (Eggshell protein)
46C24A11.1C24A11.1n/achrI 5,402,352
47C15A11.2C15A11.2n/achrI 7,388,033contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CF92
48B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
49Y54E2A.7Y54E2A.7n/achrII 14,772,378contains similarity to Saccharomyces cerevisiae DNA Helicase; identified as an ExtraCellular Mutant; homology exists between ECM32 and two other identified DNA helicases, DNA2 and NAM7; SGD:YER176W
50F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C