UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK250.9ZK250.90chrII 1,965,500contains similarity to Pfam domain PF05970 Eukaryotic protein of unknown function (DUF889) contains similarity to Interpro domains IPR010285 (Protein of unknown function DUF889, eukaryote), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR006034 (Asparaginase/glutaminase)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
4F20D1.9F20D1.9n/achrX 15,002,884contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
5T06C12.11T06C12.11n/achrV 15,893,552contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F29G6.2F29G6.2n/achrX 11,510,328contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ43363 fis, clone NT2RP7017474; ENSEMBL:ENSP00000374260
7ZK1067.2ZK1067.2n/achrII 9,218,954contains similarity to Pfam domain PF01422 NF-X1 type zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR000967 (Zinc finger, NF-X1-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001555 (Phosphoribosylglycinamide formyltransferase, active site), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
8math-49ZK250.7n/achrII 1,954,675C. elegans MATH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
9str-226C07G3.4n/achrV 3,513,510C. elegans STR-226 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10srh-51C10G11.3n/achrI 6,301,375C. elegans SRH-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11srh-293K08G2.8n/achrV 15,866,710C. elegans SRH-293 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12R186.1R186.1n/achrV 12,962,447contains similarity to Pfam domain PF05742 Protein of unknown function (DUF833) contains similarity to Interpro domain IPR008551 (Protein of unknown function DUF833)
13srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14sru-15T02D1.3n/achrIV 17,396,805C. elegans SRU-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
15sra-2AH6.6n/achrII 9,529,242C. elegans SRA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
16T12A2.6T12A2.6n/achrIII 6,243,060
17tag-182C16A3.7n/achrIII 6,377,219C. elegans TAG-182 protein; contains similarity to Pfam domains PF01422 (NF-X1 type zinc finger) (9), PF01424 (R3H domain) contains similarity to Interpro domains IPR000967 (Zinc finger, NF-X1-type), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001374 (Single-stranded nucleic acid binding R3H), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
18odr-7T18D3.2n/achrX 12,460,277odr-7 encodes an olfactory-specific member of the nuclear receptor superfamily that affects chemotaxis to some volatile odorants and the cell fate of the AWA olfactory neurons; ODR-7 is expressed in the AWA neurons; in specifying the identity of the AWA neurons, ODR-7 appears to lie upstream of odr-10, which encodes a seven transmembrane domain olfactory receptor that is required for the response to diacetyl, an odorant detected by the AWA neurons.
19T10E9.2T10E9.2n/achrI 6,543,527
20F10C2.4F10C2.4n/achrV 12,043,441F10C2.4 encodes a homolog of the DNA polymerase delta complex subunit A that is required in embryos for the normal timing of embryonic cell divisions (much as DIV-1 is) and, also, for normal chromosome segregation (probably because of defective DNA replication).
21C08B6.3C08B6.3n/achrV 10,111,050contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22nhr-72C17A2.8n/achrII 3,849,882C. elegans NHR-72 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23C25F9.2C25F9.2n/achrV 19,424,086contains similarity to Pfam domain PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral contains similarity to Interpro domains IPR006172 (DNA-directed DNA polymerase, family B), IPR004868 (DNA-directed DNA polymerase, family B, mitochondria/virus), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
24C49C3.5C49C3.5n/achrIV 17,329,906contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
25nhr-9ZK418.1n/achrIII 7,096,245C. elegans NHR-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26T16G12.6T16G12.6n/achrIII 10,072,699contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
27sra-18F28C12.2n/achrI 12,692,935C. elegans SRA-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
28srh-68T21B4.5n/achrII 12,507,810C. elegans SRH-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002379 (ATPase, F0/V0 complex, subunit C)
29B0361.6B0361.6n/achrIII 7,276,316contains similarity to Pfam domain PF02598 Uncharacterized ACR, COG2106 contains similarity to Interpro domain IPR003750 (Protein of unknown function DUF171)
30tag-235M03C11.4n/achrIII 10,406,358C. elegans TAG-235 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
31pqn-8C05B5.3n/achrIII 9,996,987The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
32ZK1307.7ZK1307.7n/achrII 9,638,262contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33T20D4.9T20D4.9n/achrV 3,404,051T20D4.9 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T20D4.9 has no clear orthologs in other organisms.
34ama-1F36A4.7n/achrIV 4,253,109ama-1 encodes the large subunit of RNA polymerase II required for mRNA transcription; AMA-1 is essential for proper embryonic development, particularly for the early division and migration of the endodermal precursor (E) cells that initiate gastrulation; AMA-1 is expressed ubiquitously in the developing embryo until the 550-cell stage.
35R12E2.1R12E2.1n/achrI 4,183,608contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF00651 (BTB/POZ domain) , PF07707 (BTB And C-terminal Kelch) , PF07646 (Kelch motif) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR017096 (Kelch-like protein, gigaxonin), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013069 (BTB/POZ), IPR011705 (BTB/Kelch-associated), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
36T16G12.1T16G12.1n/achrIII 10,044,880contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
37H34P18.1H34P18.1n/achrV 6,805,459contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38R02E12.5R02E12.5n/achrX 3,997,923
39R05D11.6R05D11.6n/achrI 8,597,435contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE2542.; TR:Q8XHE3
40C04B4.4C04B4.4n/achrX 12,291,546contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein involved in exit from mitosis; SGD:YJL076W
41cyp-33C3F41B5.4n/achrV 2,243,821C. elegans CYP-33C3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
42R05D3.2R05D3.2n/achrIII 8,373,629R05D3.2 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:16889) (C7orf2; OMIM:605522), which when mutated leads to disease.
43H28G03.4H28G03.4n/achrX 5,223,420contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
44str-7F22B8.5n/achrV 16,098,738C. elegans STR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45scc-3F18E2.3n/achrV 12,765,914scc-3 encodes a cohesin complex subunit homologous to Saccharomyces cerevisiae Irr1p/Scc3p; SCC-3 is required during meiosis for synaptonemal complex formation and sister chromatid cohesion, proper localization of REC-8 to chromosomes, mitotic chromosome segregation, embryonic development, and vulval morphogenesis; in embryos, SCC-3 forms a cohesin complex with SCC-1, SMC-1, SMC-3, and TIM-1, a HEAT/Armadillo repeat-containing protein related to Drosophila TIMELESS; in the germline, SCC-3 associates with chromatin of transistion zone nuclei, assembles along the longitudinal axes of synapsed chromosomes at pachytene, and unlike other cohesins, localizes throughout chromatin at diakinesis; SCC-3 localization requires TIM-1, and SCC-3 and REC-8 are mutually required for chromatin localization.
46gcy-14ZC412.2n/achrV 14,865,514gcy-14 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; the precise role of GCY-14 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; however, by sequence similarity GCY-14 can be predicted to function in chemosensory signal transduction.
47smc-4F35G12.8n/achrIII 4,590,281The smc-4 gene encodes a homolog of the SMC4 subunit of mitotic condensin; SMC-4 acts with MIX-1 to enable chromosome segregation.
48sgt-1R05F9.10n/achrII 4,903,031C. elegans SGT-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (2), PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
49T19B4.5T19B4.5n/achrI 5,675,326
50srx-17F55B12.8n/achrV 13,841,443C. elegans SRX-17 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)