UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK218.5ZK218.56e-153chrV 17,101,526contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4cyp-13A8T10B9.4n/achrII 9,806,501C. elegans CYP-13A8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
5srb-16F58A6.6n/achrII 5,149,697C. elegans SRB-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
6gst-19F37B1.8n/achrII 13,626,271C. elegans GST-19 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
7F47B10.8F47B10.8n/achrX 10,905,841contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
8C17H11.1C17H11.1n/achrX 8,177,329contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9srd-1F33H1.5n/achrII 10,181,388srd-1 encodes a seven transmembrane chemosensory receptor; SRD-1 is expressed in the ASI chemosensory neurons; SRD-1 expression in ASI is repressed in the presence of dauer pheromone at concentrations lower than that which induces dauer formation.
10D2007.2D2007.2n/achrIII 8,153,415D2007.2 is orthologous to the human gene TRANSKETOLASE (WERNICKE-KORSAKOFF SYNDROME) (TNF; OMIM:606781), which when mutated leads to disease.
11sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
12C26F1.6C26F1.6n/achrV 7,772,218C26F1.6 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C26F1.6 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
13F54F2.6F54F2.6n/achrIII 8,800,500
14str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F45E1.1F45E1.1n/achrX 8,008,286
16B0554.7B0554.7n/achrV 439,300contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
17T05A10.6T05A10.6n/achrX 10,793,737contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
18K02F6.5K02F6.5n/achrII 2,535,834contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
19cyp-34A8B0213.14n/achrV 3,966,310C. elegans CYP-34A8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
20egl-20W08D2.1n/achrIV 9,813,959egl-20 encodes a member of the WNT family of developmental signaling proteins that affects migration of QL and QR and their descendents; expressed in muscle and epidermal cells at the posterior of the worm.
21srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22F26A1.8F26A1.8n/achrIII 4,821,475contains similarity to Interpro domain IPR000010 (Proteinase inhibitor I25, cystatin)
23nkat-1F28H6.3n/achrX 14,139,007nkat-1 encodes kynurenine aminotransferase III, an ortholog of mammalian KAT3; nkat-1(RNAi) animals have no obvious phenotype.
24C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
25twk-40T28A8.1n/achrIII 13,487,791C. elegans TWK-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
26K02E11.6K02E11.6n/achrV 14,251,141contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
27T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
28F57C9.6F57C9.6n/achrI 4,823,394contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29F27C1.11F27C1.11n/achrI 5,439,915contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF03607 (Doublecortin) , PF01477 (PLAT/LH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001024 (Lipoxygenase, LH2), IPR008976 (Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2), IPR003533 (Doublecortin), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
30sir-2.3F46G10.3n/achrX 13,332,774C. elegans SIR-2.3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02146 Sir2 family contains similarity to Interpro domain IPR003000 (NAD-dependent histone deacetylase, silent information regulator Sir2)
31T05B4.9T05B4.92e-73chrV 4,117,993contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
32C08F11.2C08F11.2n/achrIV 13,622,516contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Hypothetical protein MTH421.; SW:Y421_METTH
33str-87F59E11.16n/achrV 8,987,304C. elegans STR-87 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34B0310.3B0310.3n/achrX 512,692
35odr-3C34D1.3n/achrV 13,248,189odr-3 encodes a G protein alpha subunit; odr-3 activity is required for normal chemotaxis, odorant avoidance, and nociceptive function as well as cilium morphogenesis in chemosensory neurons; an ODR-3::GFP is expressed in five pairs of sensory neurons AWA, AWB, AWC, ASH, and ADF; the AWC neurons consistently express GFP most strongly, while the AWB neurons express at lower levels and the AWA, ASH, and ADF neurons express only weakly; in AWC neurons, ODR-3::GFP localizes to cilia which have a characteristic wing-shaped morphology.
36sra-17F28C12.1n/achrI 12,689,638C. elegans SRA-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
37T17A3.10T17A3.10n/achrIII 155,573contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
38F59D6.6F59D6.6n/achrV 3,036,408contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
39F15G9.2F15G9.2n/achrX 9,713,365contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAW6
40C06B3.7C06B3.7n/achrV 13,910,615contains similarity to Streptococcus agalactiae Tn5252, relaxase.; TR:Q8DZ67
41F53G12.11F53G12.11n/achrI 145,479contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
42F15A8.1F15A8.1n/achrX 4,441,526
43lgc-37ZC482.5n/achrIII 12,789,021ZC482.5 is orthologous to the human gene GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID A RECEPTOR GAMMA 2 (GABRG2; OMIM:137164), which when mutated leads to disease.
44F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
45F35G8.1F35G8.1n/achrX 9,317,241contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46srbc-16C45H4.1n/achrV 2,182,614C. elegans SRBC-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47K11H3.5K11H3.5n/achrIII 9,844,623contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P49321 Nuclear autoantigenic sperm protein; ENSEMBL:ENSP00000320980
48C47F8.5C47F8.5n/achrI 12,322,989contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
49Y52B11A.4Y52B11A.4n/achrI 10,991,938contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras), IPR006689 (ARF/SAR superfamily), IPR002078 (RNA polymerase sigma factor 54, interaction)
50F07E5.9F07E5.9n/achrII 2,077,849contains similarity to Interpro domain IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)