UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK218.11ZK218.116e-152chrV 17,107,962contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
2ZK666.2ZK666.2n/achrII 10,471,714contains similarity to Homo sapiens ASH1; ENSEMBL:ENSP00000265206
3C28F5.1C28F5.1n/achrII 7,506,343
4C01G10.1C01G10.1n/achrV 15,102,337contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
5ZC376.8ZC376.8n/achrV 14,180,879contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region)
6F56F3.3F56F3.3n/achrIII 4,458,938contains similarity to Drosophila dasycnemia Wingless (Fragment).; TR:O46305
7F46A9.2F46A9.2n/achrI 9,459,902contains similarity to Saccharomyces cerevisiae part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA); similar to microtubule binding proteins and to X90565_5.cds; SGD:YLR197W
8gly-15C54C8.11n/achrI 12,463,985gly-15 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; gly-15 expressed only in cellular processes that are probably part of the secretory network of the G2 gland cells.
9lgc-51F12B6.3n/achrI 2,244,756C. elegans LGC-51 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
10srg-53T02B11.1n/achrV 880,685C. elegans SRG-53 protein ;
11R05D3.3R05D3.3n/achrIII 8,365,486
12spp-9T25C12.2n/achrX 11,487,901C. elegans SPP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03489 Saposin-like type B, region 2 contains similarity to Interpro domains IPR008138 (Saposin-like type B, 2), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
13gly-14M01F1.1n/achrIII 3,491,809gly-14 encodes a UDP-N-acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1, 2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GnT 1); GLY-14 exhibits GnT 1 activity when assayed in vitro; a gly-14::lacZ reporter construct is expressed only in the intestine throughout larval and adult stages, with expression generally restricted to the anterior and posterior gut cells.
14F59D6.7F59D6.7n/achrV 3,038,633contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
15fbxb-58H11E01.1n/achrX 1,628,252C. elegans FBXB-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
16F11F1.5F11F1.5n/achrIII 13,402,502contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR003661 (Signal transduction histidine kinase, subgroup 1, dimerisation and phosphoacceptor region), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
17scl-26C50E3.10n/achrV 7,601,057C. elegans SCL-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
18cpb-1C40H1.1n/achrIII 9,323,513cpb-1 encodes a cytoplasmic polyadenylation element binding (CPEB) protein homolog involved in two steps of spermatogenesis; two CPEB proteins have distinct functions in spermatogenesis, with FOG-1 specifying sperm cell fate, and CPB-1 conversely executing that decision, being required for progression through meiosis; cpb-1(RNAi) spermatocytes fail to undergo meiotic cell divisions; CPB-1 protein is present in the germ line just prior to overt spermatogenesis, but once sperm differentiation begins, CPB-1 disappears; CPB-1 physically interacts with EBF, which, like CPEB, regulates genes by binding the 3' UTRs of mRNAs; while CPB-1 is required for spermatogenesis, it is dispensable for oogenesis; this is in contrast to CPEBs in vertebrates (Xenopus), arthropods (Drosophila), and molluscs (Spisula), which all participate in oogenesis.
19F54F12.1F54F12.1n/achrIII 13,051,731contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
20F22B3.7F22B3.7n/achrIV 11,418,098contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
21F16B4.6F16B4.6n/achrV 1,588,179contains similarity to Pfam domain PF00550 Phosphopantetheine attachment site contains similarity to Interpro domains IPR006163 (Phosphopantetheine-binding), IPR009081 (Acyl carrier protein-like), IPR003231 (Acyl carrier protein (ACP))
22srp-8F20D6.3n/achrV 8,184,913srp-8 encodes a predicted serpin (serine protease inhibitor)
23F46B3.9F46B3.9n/achrV 20,621,052contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
24C08H9.13C08H9.13n/achrII 9,870,236contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR003624 (Leukemia inhibitory factor), IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
25srg-34Y51A2D.12n/achrV 18,563,515C. elegans SRG-34 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
26Y51A2B.4Y51A2B.4n/achrV 18,387,652contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
27F18A12.6F18A12.6n/achrII 3,401,335F18A12.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.6 has no clear orthologs in other organisms.
28twk-37C48E7.9n/achrI 6,270,306C. elegans TWK-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2)
29F36D4.6F36D4.6n/achrV 9,427,160
30F15D3.6F15D3.6n/achrI 11,574,794contains similarity to Pfam domain PF04707 PRELI-like family contains similarity to Interpro domain IPR006797 (MSF1)
31R04E5.9R04E5.9n/achrX 8,808,513contains similarity to Homo sapiens Triadin; ENSEMBL:ENSP00000333984
32F28A12.1F28A12.1n/achrV 8,639,396contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
33T23F1.5T23F1.5n/achrV 15,461,926contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
34F49H6.13F49H6.13n/achrV 17,008,999contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR001285 (Synaptophysin/synaptoporin)
35F10C2.7F10C2.7n/achrV 12,055,113contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36M04C7.3M04C7.3n/achrI 8,546,387contains similarity to Brucella melitensis Exopolyphosphatase (EC 3.6.1.11).; TR:Q8YCD4
37sru-35C33D9.4n/achrIV 8,789,328C. elegans SRU-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
38C08D8.1C08D8.1n/achrV 8,347,824contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39ZK1086.3ZK1086.3n/achrX 13,791,278contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
40R07B7.7R07B7.7n/achrV 12,072,671
41unc-4F26C11.2n/achrII 9,898,980The unc-4 gene encodes a paired-class homeodomain protein with homologs in Drosophila and vertebrates; UNC-4 is required for establishing the identity of the A class motor neurons DA and VA, and is thus required for movement, axon guidance, and synapse formation; UNC-4 is negatively regulated by VAB-7, and UNC-4 activity requires UNC-37; unc-4 is expressed in the A-type motor neurons, DA and VA, the six VC motor neurons that innervate the vulval muscles, and the three SAB motor neurons; unc-4 is also expressed in the pharyngeal I5 motor neuron and the AVF neurons in the retrovesicular ganglion.
42F10C1.3F10C1.3n/achrII 5,757,653
43dsl-5F58B3.8n/achrIV 11,620,190dsl-5 encodes a putative secreted protein with single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-5 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
44W03G9.5W03G9.5n/achrI 4,969,127contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
45C08H9.14C08H9.14n/achrII 9,872,219contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
46F46F5.1F46F5.1n/achrII 790,983
47clec-58ZK666.3n/achrII 10,475,101C. elegans CLEC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
48Y49F6C.6Y49F6C.6n/achrII 3,364,648contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
49T24D5.5T24D5.5n/achrX 12,599,103contains similarity to Plasmodium falciparum PfEMP1-like protein.; TR:Q8IC59
50T16A9.3T16A9.3n/achrV 14,208,326contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)