UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1twk-9ZK1251.80chrIV 9,695,064C. elegans TWK-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F47D12.6F47D12.6n/achrIII 6,286,908
4B0563.7B0563.7n/achrX 9,153,274contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
5F40F8.4F40F8.4n/achrII 11,139,746contains similarity to Interpro domain IPR001680 (WD40 repeat)
6C24D10.8C24D10.8n/achrIV 5,165,608n/a
7flp-5C03G5.7n/achrX 8,529,581flp-5 encodes a predicted FMRFamide-like peptide neurotransmitter that increases action potential frequency in the pharyngeal muscle when applied to the pharynx of dissected worms; expressed in the sensory neurons ASE and PVM.
8srj-15Y40B10B.2n/achrV 1,963,860C. elegans SRJ-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002120 (Thyrotrophin-releasing hormone receptor)
9M03E7.1M03E7.1n/achrV 5,624,123contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
10C07A4.2C07A4.2n/achrX 10,173,174contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
11C39B10.3C39B10.3n/achrX 10,443,924contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in mating-type locus silencing, interacts with Sir2p; probably functions to recruit or stabilize Sir proteins; SGD:YDR363W
12ZC443.4ZC443.4n/achrV 12,818,211contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of AT-rich interactive domain-containing protein 4B; ENSEMBL:ENSP00000375729
13nhr-206R07B7.13n/achrV 12,092,930C. elegans NHR-206 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
14F15H10.5F15H10.5n/achrV 10,418,359contains similarity to Borrelia burgdorferi Hypothetical protein BB0170.; TR:O51192
15rcn-1F54E7.7n/achrIII 5,683,173rcn-1 encodes a calcipressin, which binds and inhibits calcineurin; RCN-1's orthologs include yeast Rcn1p and human DSCR1 (OMIM:602917; overexpressed in Down syndrome and Alzheimer disease); rcn-1 is expressed in hypodermal seam cells, various neurons, vulval epithelial and muscle cells, marginal pharyngeal cells, and in the male tail; rcn-1 transcription is regulated by TAX-6, and RCN-1 binds TAX-6 protein if free Ca[2+] is present; RCN-1 overexpression, like calcineurin deficiency, causes defects in body size, cuticle thickness, fertility, growth rate, and serotonin-resistance in egg-laying.
16pqn-48K07D4.8n/achrII 4,040,965The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
17K11D12.8K11D12.8n/achrV 5,040,194
18C02B8.3C02B8.3n/achrX 8,139,820
19R102.3R102.3n/achrIV 10,691,049contains similarity to Broad bean wilt virus 2 210kDa protein.; TR:Q9E933
20F18A11.5F18A11.5n/achrII 13,010,794contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
21T02E1.8T02E1.8n/achrI 8,236,518
22F21C10.9F21C10.9n/achrV 9,097,952contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
23T16A1.4T16A1.4n/achrII 2,081,787
24H32K16.1H32K16.1n/achrI 9,151,388contains similarity to Pfam domain PF01490 Transmembrane amino acid transporter protein contains similarity to Interpro domain IPR013057 (Amino acid transporter, transmembrane)
25T14C1.1T14C1.1n/achrX 14,408,600T14C1.1 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that T14C1.1 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
26C30B5.7C30B5.7n/achrII 6,225,999contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
27srt-35F47D2.4n/achrV 4,263,036C. elegans SRT-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
28str-261W09D6.2n/achrIII 11,075,857C. elegans STR-261 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR011256 (Regulatory factor, effector, bacterial), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29eat-4ZK512.6n/achrIII 9,139,280eat-4 encodes an ortholog of the mammalian BNPI vesicular glutamate transporter that affects chemotaxis, feeding, foraging and thermotaxis; eat-4 is expressed in specific neurons, including M3L and M3R which are known to be glutamatergic.
30F23F1.7F23F1.7n/achrII 39,046contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
31C17B7.2C17B7.2n/achrV 3,349,796contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
32K07A1.3K07A1.3n/achrI 9,587,656contains similarity to Pfam domain PF03412 Peptidase C39 family contains similarity to Interpro domain IPR005074 (Peptidase C39, bacteriocin processing)
33Y11D7A.10Y11D7A.10n/achrIV 9,259,330contains similarity to Coniophora arida ATP synthase subunit 6 (EC 3.6.3.14) (ATP synthase A chain)s(Fragment).; TR:Q9XLN6
34F41G4.8F41G4.8n/achrX 16,844,106
35F14D7.8F14D7.8n/achrV 14,312,353contains similarity to Staphylococcus epidermidis Conserved hypothetical protein.; TR:Q8CSE5
36nlp-11ZK1320.10n/achrII 9,690,787C. elegans NLP-11 protein ;
37clec-211F19F10.6n/achrV 7,560,915C. elegans CLEC-211 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
38F21D12.5F21D12.5n/achrII 7,329,535contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
39F35C12.1F35C12.1n/achrI 9,805,249contains similarity to Ralstonia solanacearum PopB.; TR:Q84IE7
40cyp-34A3C41G6.1n/achrV 15,229,059C. elegans CYP-34A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
41srab-12C47A10.6n/achrV 17,782,010C. elegans SRAB-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
42Y37D8A.6Y37D8A.6n/achrIII 12,857,304contains similarity to Interpro domains IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
43C30F2.2C30F2.2n/achrX 16,080,929contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
44str-3M7.13n/achrIV 11,099,437str-3 encodes a seven transmembrane chemosensory receptor; STR-3 is expressed in the ASI chemosensory neurons; STR-3 expression in ASI is repressed in the presence of dauer pheromone at concentrations lower than that which induces dauer formation.
45M01B2.6M01B2.6n/achrV 15,242,739contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
46F56C4.2F56C4.2n/achrIV 10,642,026contains similarity to Oryza sativa DNA binding protein S1FA.; SW:S1FA_ORYSA
47C15B12.4C15B12.4n/achrX 6,472,014contains similarity to Interpro domain IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal)
48M03E7.4M03E7.4n/achrV 5,611,266M03E7.4 encodes a protein, predicted to be secreted, with one chitin-binding peritrophin-A and three low-density lipoprotein receptor domain class A domains; M03E7.4 has no obvious function in mass RNAi assays.
49K03B4.4K03B4.4n/achrV 4,684,430contains similarity to Interpro domain IPR002411 (Cereal allergen/alpha-amylase inhibitor, rice-type)
50Y43F8C.11Y43F8C.11n/achrV 19,670,774contains similarity to Mus sp Interleukin-3 receptor beta subunit (Fragment).; TR:Q64130