UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK1225.5ZK1225.50chrI 13,217,724
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3Y40H4A.2Y40H4A.2n/achrV 14,584,349contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
4C02F5.2C02F5.2n/achrIII 8,249,732
5M03E7.3M03E7.3n/achrV 5,615,596
6tba-6F32H2.9n/achrI 8,996,289C. elegans TBA-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
7R07C3.4R07C3.4n/achrII 934,987contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
8F22B5.5F22B5.5n/achrII 8,453,880contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
9C17C3.11C17C3.11n/achrII 5,538,392contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
10ZK84.5ZK84.5n/achrII 6,016,343
11F46F5.6F46F5.6n/achrII 814,673contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
12T21E3.2T21E3.2n/achrI 3,931,189contains similarity to Homo sapiens 55 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000273725
13R07E5.6R07E5.6n/achrIII 4,399,849contains similarity to Interpro domains IPR005432 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha 2 subunit), IPR009149 (BR22)
14F43G9.8F43G9.8n/achrI 8,618,137contains similarity to Dugesia japonica DjFGFR1.; TR:Q8MY86
15D2062.7D2062.7n/achrII 2,617,140
16K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
17R04B5.11R04B5.11n/achrV 10,090,998contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000248104
18F59A3.8F59A3.8n/achrI 5,523,890contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
19srv-12T04B2.4n/achrIV 10,052,440C. elegans SRV-12 protein ;
20tag-212T14D7.3n/achrII 8,859,305C. elegans TAG-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domain IPR001388 (Synaptobrevin)
21T28D9.9T28D9.9n/achrII 6,484,502
22K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
23kin-5T13H10.1n/achrIV 9,968,114kin-5 encodes a predicted protein tyrosine kinase that is most closely related to the non-receptor tyrosine kinases Fes/Fps and Fer that contain an SH2 domain and a tyrosine kinase domain (OMIM:190030, murine Fes appears to be required for hemopoietic homeostasis); as loss of kin-5 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of kin-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
24C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
25K11H3.2K11H3.2n/achrIII 9,846,887contains similarity to Homo sapiens Uveal autoantigen; ENSEMBL:ENSP00000314556
26T08H10.1T08H10.1n/achrV 4,484,972contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
27C25G4.7C25G4.7n/achrIV 12,457,730contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
28F01D4.3F01D4.3n/achrIV 10,474,640contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR005819 (Histone H5), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
29M162.7M162.7n/achrV 19,789,204contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
30F28H1.5F28H1.5n/achrI 3,979,010
31K09G1.2K09G1.2n/achrV 9,590,914contains similarity to Carnobacterium piscicola Putative ABC transporter PisT.; TR:Q93QC9
32tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
33C15H11.1C15H11.1n/achrV 14,394,129contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
34C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171
35T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
36R04B5.1R04B5.1n/achrV 10,078,069contains similarity to Culex nigripalpus baculovirus Putative 33 kDa early protein (CUN014 similar to AcMNPV ORF92).; TR:Q99GP2
37ech-3F43H9.1n/achrV 8,022,781C. elegans ECH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
38ZK1307.3ZK1307.3n/achrII 9,652,584contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39F47B3.1F47B3.1n/achrI 3,972,934contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
40T07E3.2T07E3.2n/achrIII 6,907,721
41Y62H9A.8Y62H9A.8n/achrX 11,891,763contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IEC0
42C46E10.1C46E10.1n/achrII 3,725,048contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
43col-53M01A12.1n/achrI 5,645,857C. elegans COL-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
44T02H6.6T02H6.6n/achrII 683,947
45clec-129W10G11.15n/achrII 3,572,181C. elegans CLEC-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
46C28C12.1C28C12.1n/achrIV 8,502,192contains similarity to Interpro domain IPR002217 (Lipoprotein LPP20)
47F49E11.7F49E11.7n/achrIV 13,054,029contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
48ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
49T15H9.5T15H9.5n/achrII 9,610,953contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q55FI4
50Y57G11C.14Y57G11C.14n/achrIV 14,800,135contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YLR467W