UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK1225.4ZK1225.40chrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
2F42C5.5F42C5.5n/achrIV 7,293,350contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
3C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582
4clec-123Y25C1A.1n/achrII 3,115,497C. elegans CLEC-123 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5F44D12.6F44D12.6n/achrIV 10,034,055contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein of unknown function, mediates sensitivity to salt stress; interacts physically with the splicing factor Msl1p and also displays genetic interaction with MSL1; SGD:YNL091W
6K03H1.12K03H1.12n/achrIII 9,941,867contains similarity to Gallus gallus BDNF/NT-3 growth factors receptor precursor (EC 2.7.1.112) (TrkBstyrosine kinase) (Trk-B).; SW:TRKB_CHICK
7F32B4.2F32B4.2n/achrI 11,513,362contains similarity to Interpro domain IPR002056 (Protein import receptor MAS20)
8Y69E1A.8Y69E1A.8n/achrIV 10,967,320contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0457.; TR:Q975F4
9T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
10Y54E2A.7Y54E2A.7n/achrII 14,772,378contains similarity to Saccharomyces cerevisiae DNA Helicase; identified as an ExtraCellular Mutant; homology exists between ECM32 and two other identified DNA helicases, DNA2 and NAM7; SGD:YER176W
11Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
12AH6.3AH6.3n/achrII 9,519,577contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR001946 (Adrenergic receptor, alpha-2A)
13C15A11.2C15A11.2n/achrI 7,388,033contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CF92
14C17F3.3C17F3.3n/achrI 6,682,871contains similarity to Interpro domains IPR000956 (Stathmin), IPR005819 (Histone H5), IPR000533 (Tropomyosin), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
15E03H12.7E03H12.7n/achrIV 4,988,167contains similarity to Danio rerio Protein FAM133.; SW:A1A5I1
16C15H7.3C15H7.3n/achrIII 9,651,090contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
17C49A1.3C49A1.3n/achrI 14,218,454contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
18C08F11.10C08F11.10n/achrIV 13,648,607contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron TPR-repeat-containing protein.; TR:Q8A5L6
19C56C10.6C56C10.6n/achrII 6,580,455contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
20F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C
21C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
22C06A8.6C06A8.6n/achrII 7,773,165contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR000875 (Cecropin)
23ZK1251.3ZK1251.3n/achrIV 9,684,045contains similarity to Pfam domain PF02544 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR001104 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal), IPR016636 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase)
24F36H12.9F36H12.9n/achrIV 5,257,678contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
25T20F5.5T20F5.5n/achrI 3,918,806contains similarity to Homo sapiens Isoform E of Proteoglycan-4 precursor; ENSEMBL:ENSP00000356454
26fbxa-178F17A9.1n/achrV 6,116,834F17A9.1 encodes a divergent ONECUT class CUT homeobox protein with a single N-terminal cut domain; F17A9.1 has an atypical tyrosine residue at position 48 of its homeodomain rather than a phenylalanine or tryptophan residue; the cut domain may be a compact DNA-binding domain composed of alpha helices; phylogenetically, F17A9.1 is (somewhat distantly) affiliated with C17H12.9, Drosophila ONECUT, and mammalian HNF6 proteins; F17A9.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
27F36H12.14F36H12.14n/achrIV 5,263,576
28C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
29spe-11F48C1.7n/achrI 5,331,412spe-11 encodes a novel protein that is required for early embryonic development and for regulating the dynamic morphology of sperm pseudopods; although the precise biological role of SPE-11 is not yet known, SPE-11 is one of the few paternally provided proteins known to be essential for embryogenesis, and may constitute a sperm-associated factor required for oocyte activation; SPE-11 is first detected in the nuclei of primary spermatocytes and then remains tightly associated with sperm chromatin until fertilization at which point it appears to be degraded.
30B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
31Y43F8A.2Y43F8A.2n/achrV 19,373,855contains similarity to Homo sapiens Cytokine receptor common beta chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000262825
32C25A8.2C25A8.2n/achrIV 7,010,276contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
33Y113G7C.1Y113G7C.1n/achrV 20,316,312contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000217 (Tubulin), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
34C50E10.2C50E10.2n/achrII 12,306,600contains similarity to Pfam domain PF06887 (Protein of unknown function (DUF1265))
35T28C6.5T28C6.5n/achrIV 8,822,105contains similarity to Interpro domains IPR000909 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific , X region), IPR000023 (Phosphofructokinase)
36T05A7.6T05A7.6n/achrII 4,670,226contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
38F58G1.3F58G1.3n/achrII 12,927,067contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
39F21A3.4F21A3.4n/achrV 15,537,300contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC338999 isoform 2; HI:HIT000389435
40T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
41Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
42clec-134W10G11.11n/achrII 3,580,752C. elegans CLEC-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43K06H7.8K06H7.8n/achrIII 8,097,370contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44C38C3.8C38C3.8n/achrV 1,505,005contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
45T08B6.4T08B6.4n/achrIV 4,907,072contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
46F46F5.9F46F5.9n/achrII 822,679contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
47B0252.5B0252.5n/achrII 6,917,923
48cyn-2ZK520.5n/achrIII 13,693,091cyn-2 is a predicted member of the cytosolic Cyclosporin A-binding cyclophilin family that is functional when expressed in E. coli.
49ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
50Y18D10A.21Y18D10A.21n/achrI 12,930,221contains similarity to Watermelon silver mottle virus L protein.; TR:Q9DSQ1