UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK1055.3ZK1055.32.9999999999999997e-20chrV 6,590,794
2Y37H2C.4Y37H2C.4n/achrV 18,271,444contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3glb-25T06A1.4n/achrV 1,949,042glb-25 encodes a globin required for normally rapid growth in mass RNAi assays.
4clec-118W04H10.4n/achrII 610,423C. elegans CLEC-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5fbxb-47F58E1.14n/achrII 1,702,944This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
6F54E7.6F54E7.6n/achrIII 5,660,439
7W02D9.8W02D9.8n/achrI 12,558,734contains similarity to Interpro domain IPR004692 (Preprotein translocase SecG subunit)
8dpr-1R10D12.2n/achrV 13,941,139dpr-1 encodes a putative nuclear hormone receptor that affects endoderm differentiation and may promote entry into the dauer state and maintenance of the dauer state; expressed in the endoderm lineage and localization appears dependent on growth conditions.
9nhr-157C17E7.5n/achrV 3,867,765C. elegans NHR-157 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10nhr-83F48G7.3n/achrV 632,120C. elegans NHR-83 protein; contains similarity to Pfam domains PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR015897 (CHK kinase-like)
11fbxa-137T27B7.7n/achrV 2,280,414C. elegans FBXA-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
12srj-37F48G7.1n/achrV 639,279C. elegans SRJ-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13nrd-1D1007.7n/achrI 4,600,304C. elegans NRD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR006569 (Regulation of nuclear pre-mRNA protein), IPR000694 (Proline-rich region), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR008942 (ENTH/VHS), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
14H10E21.2H10E21.2n/achrIII 10,398contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15E02H9.1E02H9.1n/achrIII 2,468,952
16srx-97F19B10.7n/achrII 3,667,915C. elegans SRX-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
17C23H4.2C23H4.2n/achrX 12,221,143contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
18M153.2M153.2n/achrX 12,152,642contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
19AH10.3AH10.3n/achrV 14,144,698contains similarity to Tomato yellow leaf curl virus Hypothetical 10.9 kDa protein (C4 protein).; SW:YC4_TYLCU
20C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
21acr-11D2092.3n/achrI 6,623,291A homolog of an alpha type nicotinic acetylcholine receptor subunit involved in the mediation of fast synaptic transmission at neuromuscular junctions.
22C15C8.6C15C8.6n/achrV 12,750,756contains similarity to Ancylostoma duodenale NADH dehydrogenase subunit 2 (Fragment).; TR:Q8SKS9
23F57E7.1F57E7.1n/achrV 16,481,775contains similarity to Bos taurus Enoyl-CoA hydratase precursor (EC 4.2.1.17) (Fragment).; TR:Q95KZ6
24srh-169C49G7.2n/achrV 4,048,582C. elegans SRH-169 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25T05B4.10T05B4.10n/achrV 4,120,294contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
26Y41E3.11Y41E3.11n/achrIV 15,045,860contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
27Y38F1A.4Y38F1A.4n/achrII 12,967,952contains similarity to Mus musculus Neuropeptide Y receptor type 6 (NPY6-R) (Pancreatic polypeptidesreceptor 2) (PP2).; SW:NY6R_MOUSE
28srw-103ZK697.5n/achrV 1,718,354C. elegans SRW-103 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29tsp-17C02F12.1n/achrX 3,682,658C. elegans TSP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
30str-149Y32B12B.5n/achrV 16,574,182C. elegans STR-149 protein ;
31C43H6.4C43H6.4n/achrX 2,405,689
32Y56A3A.16Y56A3A.16n/achrIII 11,912,267contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Pleckstrin homology domain-containing family M member 3; ENSEMBL:ENSP00000373899
33str-82B0213.8n/achrV 3,975,447C. elegans STR-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F38C2.1F38C2.1n/achrIV 16,249,570contains similarity to Carnobacterium piscicola ATP-dependent translocator.; TR:Q46317
35C23H5.7C23H5.7n/achrIV 2,107,829contains similarity to Pfam domains PF00027 (Cyclic nucleotide-binding domain) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000595 (Cyclic nucleotide-binding), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold)
36C31E10.3C31E10.3n/achrX 13,987,732contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
37Y41E3.3Y41E3.3n/achrIV 14,988,934contains similarity to Pfam domain PF02263 Guanylate-binding protein, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR015894 (Guanylate-binding protein, N-terminal), IPR015900 (Guanylate-binding protein-like, C-terminal)
38rnp-1ZK863.7n/achrV 12,193,297C. elegans RNP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
39irx-1C36F7.1n/achrI 9,538,707irx-1 encodes a homeodomain-containing protein that is most similar to members of the Iroquois subclass of TALE (three amino acid loop extension) superclass atypical homeodomain proteins; IRX-1 is predicted to function as a transcriptional regulator during development, but as loss of irx-1 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of irx-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
40pax-1K07C11.1n/achrV 8,225,481C. elegans PAX-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
41F49C12.12F49C12.12n/achrIV 9,320,583contains similarity to Homo sapiens RNase K; VG:OTTHUMP00000182776
42Y116A8B.5Y116A8B.5n/achrIV 17,228,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43dsl-2W09G12.1n/achrIV 1,203,808dsl-2 encodes a putative transmembrane protein whose extracellular domain has single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-2 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
44W10G11.3W10G11.3n/achrII 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
45W02D9.9W02D9.9n/achrI 12,557,310contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter).; TR:Q8AAL0
46srh-148K08G2.5n/achrV 15,857,580C. elegans SRH-148 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srd-40F17A2.12n/achrX 12,324,508C. elegans SRD-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48str-144C09H5.5n/achrV 8,071,381C. elegans STR-144 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49K12B6.7K12B6.7n/achrV 6,297,759
50C18G1.8C18G1.8n/achrV 4,765,470contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)