UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZK1053.6ZK1053.60chrI 13,239,621ZK1053.6 encodes an ortholog of human SLC41A1 (OMIM:610801) and bacterial MgtE; like its orthologs, ZK1053.6 is predicted to transport Mg(2+) into cells; ZK1053.6 is paralogous to K07H8.2 and ZK185.2, and has no obvious function in mass RNAi assays.
2str-166T08B6.6n/achrIV 4,885,569C. elegans STR-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3Y38H6A.2Y38H6A.2n/achrV 20,325,833contains similarity to Chlamydia pneumoniae Hypothetical protein CPn0168.; TR:Q9Z916
4T26C11.3T26C11.3n/achrX 1,838,587
5str-248C55A1.3n/achrV 15,628,858C. elegans STR-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6Y37D8A.3Y37D8A.3n/achrIII 12,833,196contains similarity to Methanosarcina mazei Conserved protein.; TR:Q8Q0P1
7F29A7.4F29A7.4n/achrII 2,750,080contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C2orf32; ENSEMBL:ENSP00000263655
8srt-54K10B4.2n/achrII 117,953C. elegans SRT-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9F53E10.5F53E10.5n/achrV 2,597,474
10H16D19.3H16D19.3n/achrI 12,639,596contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
11ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
12srh-145F26D2.4n/achrV 16,411,251C. elegans SRH-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
13ZK682.7ZK682.7n/achrV 9,291,373
14Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
15clec-242Y68A4B.2n/achrV 17,244,604C. elegans CLEC-242 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16gcy-6B0024.6n/achrV 10,311,299gcy-6 encodes a predicted guanylate cyclase; expressed in the ASEL neurons.
17str-77W06D12.4n/achrV 17,720,087C. elegans STR-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18H14A12.5H14A12.5n/achrIII 7,467,767
19C50B8.3C50B8.3n/achrV 13,567,762contains similarity to Pfam domain PF08547 Complex I intermediate-associated protein 30 (CIA30) contains similarity to Interpro domain IPR013857 (NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30)
20sru-11Y45F10B.6n/achrIV 13,586,085C. elegans SRU-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
21nlp-16T13A10.5n/achrIV 6,257,461nlp-16 encodes a predicted neuropeptide that does not belong to a multigene family in C. elegans and is not clearly related to well-characterized neuropeptides; the peptide encoded by nlp-16 has been isolated from Ascaris suum.
22M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
23T04C9.2T04C9.2n/achrIII 5,992,002
24C41D11.3C41D11.3n/achrI 4,430,732contains similarity to Interpro domain IPR001041 (Ferredoxin)
25nhr-208R07B7.15n/achrV 12,095,111C. elegans NHR-208 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26F56H6.12F56H6.12n/achrI 12,313,605contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
27K09E2.2K09E2.2n/achrX 8,677,297
28cyn-16Y17G7B.9n/achrII 12,032,664cyn-16 encodes a highly diverged member of the cyclophilin family; CYN-16 exhibits low levels of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase activity in vitro that is insensitive to the presence of cyclosporin A; a cyn-16::gfp fusion protein is expressed in the intestine during larval and adult stages of development, with particularly strong expression seen in the anterior and posterior ends; in dauer larvae, the cyn-16::gfp reporter is expressed in cell bodies and processes of ventral cord neurons and is no longer visible in the intestine.
29clec-212F19F10.7n/achrV 7,566,626C. elegans CLEC-212 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
30nspb-2F38A5.12n/achrIV 6,591,852C. elegans NSPB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
31C10A4.5C10A4.5n/achrX 7,394,900
32sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33AH9.4AH9.4n/achrX 2,272,675contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
34ZK228.1ZK228.1n/achrV 18,445,683contains similarity to Mus musculus SOX-13 protein.; SW:SX13_MOUSE
35nhr-276Y71A12C.1n/achrI 14,042,539C. elegans NHR-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
36K02F6.4K02F6.4n/achrII 2,541,208contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
37grsp-3C34D4.11n/achrIV 7,131,263C. elegans GRSP-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR005405 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3.4), IPR002952 (Eggshell protein), IPR003991 (Pertactin virulence factor, C-terminal), IPR000817 (Prion protein), IPR001951 (Histone H4)
38str-185R08C7.7n/achrIV 4,428,740C. elegans STR-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39T04F3.4T04F3.4n/achrV 11,762,441contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
40nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
41btb-4F59H6.12n/achrII 2,032,856C. elegans BTB-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
42C17C3.13C17C3.13n/achrII 5,568,064
43W05H5.1W05H5.1n/achrII 12,443,814contains similarity to Ovis aries Lysophosphatidic acid receptor Edg-2 (LPA receptor 1) (LPA-1).; SW:EDG2_SHEEP
44C17A2.5C17A2.5n/achrII 3,834,625contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
45W03H9.1W03H9.1n/achrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
46T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
47C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
48C07A4.3C07A4.3n/achrX 10,175,118contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
49Y16B4A.2Y16B4A.2n/achrX 14,766,829contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
50Y54E2A.8Y54E2A.8n/achrII 14,780,444contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)