UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srt-22ZK1037.30chrV 15,315,273C. elegans SRT-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
2R11D1.7R11D1.7n/achrV 12,721,371contains similarity to Mycoplasma capricolum Hypothetical 37.9 kDa protein in ptsH 3'region (ORF1).; SW:YPH1_MYCCA
3F59E11.6F59E11.6n/achrV 8,992,414contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
4T15D6.11T15D6.11n/achrI 12,397,457contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
5R03G5.3R03G5.3n/achrX 7,803,002contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
6T14C1.2T14C1.2n/achrX 14,400,452contains similarity to Homo sapiens MHC class I molecule; ENSEMBL:ENSP00000252229
7F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
8T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
9nhr-267H22D14.1n/achrIV 9,285,626C. elegans NHR-267 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10T20H9.6T20H9.6n/achrIII 2,247,987contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
11F56F10.4F56F10.4n/achrX 867,910contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR000664 (Lethal(2) giant larvae protein)
12T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
13srh-265T06E6.9n/achrV 15,416,909C. elegans SRH-265 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
15srx-64K07C6.7n/achrV 3,930,085C. elegans SRX-64 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16ZC250.2ZC250.2n/achrV 5,793,898contains similarity to Pfam domain PF00535 Glycosyl transferase family 2 contains similarity to Interpro domain IPR001173 (Glycosyl transferase, family 2)
17F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
18D1014.6D1014.6n/achrV 8,122,275contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
19T07G12.2T07G12.2n/achrIV 10,531,796contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
20K09H11.1K09H11.1n/achrV 5,749,898contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF01636 (Phosphotransferase enzyme family) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) contains similarity to Interpro domains IPR011945 (Predicted HAD-superfamily phosphatase, subfamily IA/Epoxide hydrolase, N-terminal), IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR006402 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR002575 (Aminoglycoside phosphotransferase)
21C35A5.5C35A5.5n/achrV 10,506,811contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22apt-9W04G3.4n/achrX 11,070,152apt-9 gene encodes an ortholog of GGA (Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology, ARF-binding protein), which contains a domain paralogous to the gamma-adaptin subunits of adaptor protein complexes; based on structural similarity, APT-9 may beinvolved in the formation of intracellular transport vesicles.
23T15B7.13T15B7.13n/achrV 6,827,999contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24C27C12.4C27C12.4n/achrX 14,855,245contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
25K01D12.5K01D12.5n/achrV 12,398,255contains similarity to Interpro domain IPR003980 (Histamine H3 receptor)
26F56A12.2F56A12.2n/achrV 14,377,560contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27B0285.6B0285.6n/achrIII 4,354,080B0285.6 encodes a predicted sodium-coupled carboxylate transporter that is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy and the mammalian NaDC1 and NaDC3 transporters; B0285.6::lacZ reporter fusions are expressed in the excretory cell, from early larval stages through adulthood, with some later expression occasionally seen in two large unidentified structures on the dorsal side of the pharyngeal terminal bulb.
28arc-1ZK1320.6n/achrII 9,676,012arc-1 encodes a member of the ARL (ADP-ribosylation factor(ARF)-like) family of proteins which are very similar to ARF proteins but lack the ability to stimulate ADP ribosylation by cholera toxin; arc-1 has a human homolog, MID1, which when mutated leads to Opitz syndrome (OMIM:300000).
29C31E10.7C31E10.7n/achrX 14,002,346C31E10.7 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:10230) (CYB5; OMIM:250790), which when mutated leads to disease.
30math-35R52.3n/achrII 2,105,696C. elegans MATH-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
31B0495.9B0495.9n/achrII 7,708,071
32glb-6C18C4.9n/achrV 5,569,355glb-6 encodes a globin that is expressed in neurons, but that has no obvious function in mass RNAi assays; glb-6 expression is downregulated in a daf-2(e1370) mutant background under normoxic conditions.
33F45H10.2F45H10.2n/achrII 13,492,421contains similarity to Pfam domain PF02939 UcrQ family contains similarity to Interpro domain IPR004205 (UcrQ)
34C14C6.7C14C6.7n/achrV 549,678contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
35C08F11.7C08F11.7n/achrIV 13,637,874contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR002398 (Peptidase C14, caspase precursor p45)
36sri-27ZK697.4n/achrV 1,726,643C. elegans SRI-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37F21D9.1F21D9.1n/achrV 19,267,093This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
38twk-26C33D12.3n/achrX 3,052,381C. elegans TWK-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
39hrd-1F55A11.3n/achrV 11,768,584C. elegans HRD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
40C49C3.5C49C3.5n/achrIV 17,329,906contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
41srz-12K08G2.7n/achrV 15,862,049C. elegans SRZ-12 protein ;
42T19C9.8T19C9.8n/achrV 17,239,506contains similarity to Amsacta moorei entomopoxvirus AMV141.; TR:Q9EMQ8
43ZK899.3ZK899.3n/achrX 9,454,242contains similarity to Homo sapiens C10ORF6; ENSEMBL:ENSP00000238961
44ugt-49AC3.2n/achrV 10,373,259C. elegans UGT-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
45clec-66F35C5.9n/achrII 12,905,422C. elegans CLEC-66 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
46C40H5.3C40H5.3n/achrX 11,760,088contains similarity to Solanum aggregatum NADH dehydrogenase subunit (Fragment).; TR:Q8HSG2
47cul-6K08E7.7n/achrIV 12,588,438cul-6 encodes a member of the cullin family that may physically interact with SKR-3.
48F13H10.5F13H10.5n/achrIV 10,992,558contains similarity to Pfam domain PF01663 Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR002591 (Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase/phosphate transferase), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
49ZC84.6ZC84.6n/achrIII 9,196,038contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
50nph-1M28.7n/achrII 10,650,519nph-1 encodes a novel, SH3 domain-containing protein that is orthologous to mammalian nephrocystin-1.