UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC581.7ZC581.70chrI 6,661,388contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
2C06A5.2C06A5.2n/achrI 6,006,816contains similarity to Homo sapiens Microtubule-associated protein 1B; ENSEMBL:ENSP00000296755
3Y45F10B.2Y45F10B.2n/achrIV 13,595,366contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_6700.; TR:Q98PP9
4C27B7.6C27B7.6n/achrIV 8,904,670contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
5C04G2.2C04G2.20.005chrIV 10,091,506contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
6K03H1.9K03H1.9n/achrIII 9,941,014contains similarity to Homo sapiens DAN15 protein; TR:Q99491
7ncl-1ZK112.2n/achrIII 7,734,657ncl-1 encodes a cytoplasmic B-box zinc finger protein that negatively regulates rRNA and 5S RNA transcription, nucleolus size, and body size; NCL-1 is orthologous to Drosophila BRAIN TUMOR (BRAT), and ncl-1 mutants can be rescued by brat transgenes; NCL-1 is required for the normally small size of neuronal, muscle, and hypodermal nucleoli, and is already active in 4-cell embryos; NCL-1 may be a repressor of RNA polymerase I and III transcription and an inhibitor of cell growth, based on mutant analysis; ncl-1 animals have much larger neuronal nucleoli than normal, somewhat larger muscle and hypodermal nucleoli, but essentially normal intestinal and germline nucleoli (the last of which are large even in wild-type animals); conversely, intestinal and germline cells have the lowest amounts of NCL-1 protein; ncl-1 animals are 9% larger, have 22% more protein and twice as much rRNA, and transcribe rRNA twice as much as wild-type worms; ncl-1 functions cell autonomously, and ncl-1 mutations suppress the tumorous germline phenotype of pro-1(na48) mutants.
8F26A1.4F26A1.4n/achrIII 4,818,558contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
9ZK622.1ZK622.12e-51chrII 5,294,747contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
10AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
11ZK1010.5ZK1010.5n/achrIII 12,985,882contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
12T05D4.5T05D4.5n/achrIII 13,582,099contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
13fbxa-202T28C12.3n/achrV 6,328,019This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
14try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
15B0218.5B0218.5n/achrIV 8,155,831contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
16dlc-6Y106G6G.3n/achrI 10,323,861dlc-6 encodes a putative dynein light chain 1; DLC-6 is orthologous to human DYNLL1 (OMIM:601562) and DYNLL2 (OMIM:608942), but much more divergent from them than its paralog DLC-1; DLC-6's other paralogs are DLC-2/-5; DLC-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
17C18E9.8C18E9.8n/achrII 8,986,939C18E9.8 is orthologous to the human gene JOINED TO JAZF1 (JJAZ1; OMIM:606245), which when mutated leads to disease.
18T01H3.5T01H3.5n/achrII 7,880,026T01H3.5 encodes an unfamiliar protein; T01H3.5 and T01H3.5 share an operon divergently transcribed from another operon containing vha-4.
19Y116A8C.38Y116A8C.384e-38chrIV 17,132,537contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
20C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
21H32C10.3H32C10.3n/achrIV 5,918,692contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (5), PF01529 (DHHC zinc finger domain) contains similarity to Interpro domains IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type), IPR002110 (Ankyrin)
22ech-3F43H9.1n/achrV 8,022,781C. elegans ECH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
23kin-26T06C10.66e-48chrIV 7,876,748C. elegans KIN-26 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
24H06O01.4H06O01.4n/achrI 7,003,489contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
25Y43F8A.2Y43F8A.2n/achrV 19,373,855contains similarity to Homo sapiens Cytokine receptor common beta chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000262825
26Y24D9B.1Y24D9B.1n/achrIV 4,319,658contains similarity to Interpro domain IPR001469 (ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit)
27C18H7.7C18H7.7n/achrIV 596,081
28C08G5.2C08G5.2n/achrII 740,228
29T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
30K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
31Y45F10B.3Y45F10B.3n/achrIV 13,593,732contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
32clec-135C16A11.8n/achrII 4,257,930C. elegans CLEC-135 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
33snf-7ZK1010.9n/achrIII 13,008,187C. elegans SNF-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
34M05B5.3M05B5.3n/achrI 7,187,440contains similarity to Homo sapiens Similar to Suppressor protein SRP40; VG:OTTHUMP00000170311
35B0513.6B0513.6n/achrIV 13,855,821contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
36F54C8.1F54C8.1n/achrIII 9,440,304contains similarity to Pfam domains PF00725 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02737 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008927 (6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like), IPR006108 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR006176 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding), IPR006180 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR006036 (Potassium uptake protein TrkA)
37W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
38T08B6.4T08B6.4n/achrIV 4,907,072contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
39C16D9.5C16D9.5n/achrV 8,244,484contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
40tag-191C53A5.4n/achrV 14,535,355C. elegans TAG-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
41C36F7.5C36F7.5n/achrI 9,575,404contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR003979 (Tropoelastin), IPR013286 (Annexin, type VII)
42R10D12.10R10D12.10n/achrV 13,957,221contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43M110.7M110.7n/achrII 8,235,210contains similarity to Pfam domain PF01237 Oxysterol-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR000648 (Oxysterol-binding protein)
44C32H11.9C32H11.9n/achrIV 12,935,630contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
45F42G8.8F42G8.8n/achrIV 8,120,646contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
46C06A1.3C06A1.3n/achrII 10,573,080contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
47C18G1.3C18G1.3n/achrV 4,762,839contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
48Y23H5A.4Y23H5A.4n/achrI 2,618,955contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
49C18E3.1C18E3.1n/achrI 4,213,503
50ZK930.5ZK930.5n/achrII 11,882,963contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Phosphoserine phosphatase.; TR:O27663