UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1gur-3ZC504.50chrX 10,404,346gur-3 encodes a predicted seven-transmembrane protein related to the gustatory class of receptors in Drosophila.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3T05H4.10T05H4.10n/achrV 6,420,809contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
4srt-20F47D2.7n/achrV 4,277,348C. elegans SRT-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
5ZC101.1ZC101.1n/achrII 14,679,682The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
6fbxb-14W08F4.9n/achrII 582,428C. elegans FBXB-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
7T08B6.1T08B6.1n/achrIV 4,887,059
8R05C11.2R05C11.2n/achrIV 2,058,493contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
9srx-134F09F3.7n/achrV 13,855,910C. elegans SRX-134 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
10F25A2.1F25A2.1n/achrV 1,180,578contains similarity to Rattus norvegicus C-X-C chemokine receptor type 7 (CXC-R7) (CXCR-7) (G-protein coupledsreceptor RDC1 homolog) (RDC-1) (Chemokine orphan receptor 1).; SW:O89039
11F39B3.2F39B3.2n/achrX 17,569,704contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12C35A5.9C35A5.9n/achrV 10,527,324C35A5.9 encodes a class 4 histone deacetylase (HDAC), orthologous to human HDAC11.
13srh-41Y54G11A.12n/achrII 14,286,480C. elegans SRH-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000264 (Serum albumin), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14str-68Y73C8C.6n/achrV 3,106,888C. elegans STR-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F11E6.7F11E6.7n/achrIV 17,459,510contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Flocculin, putative.; TR:A2FIF9
16Y37A1A.3Y37A1A.3n/achrIV 13,900,330contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
17C06E2.2C06E2.2n/achrX 8,879,967
18sru-9Y45F10B.11n/achrIV 13,589,633C. elegans SRU-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
19clec-263F26F2.6n/achrV 20,571,518C. elegans CLEC-263 protein; contains similarity to Pfam domains PF08277 (PAN-like domain) (2), PF00024 (PAN domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
20T09E11.3T09E11.3n/achrI 12,369,888contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
21ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
22F14H8.5F14H8.5n/achrV 15,021,516contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q812W2
23arl-6C38D4.8n/achrIII 4,814,024arl-6 encodes an ADP-Ribosylation factor-Like member of the Ras superfamily of small GTP-binding proteins and is a predicted homolog of the human ARL6 gene, identified as the gene that underlies Bardet-Biedl syndrome type 3; GFP-tagged ARL-6 undergoes intraflagellar transport (IFT) in the ciliary axoneme, implicating ARL-6 in ciliary transport; arl-6 is expressed in amphid and phasmid ciliated sensory neurons.
24R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
25C25A1.12C25A1.12n/achrI 10,192,090contains similarity to Pfam domain PF00561 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase), IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase)
26glb-14F21A3.6n/achrV 15,543,990glb-14 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays; glb-14 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background; glb-14 is downregulated in a daf-2(e1370) mutant background under normoxic conditions.
27F40A3.5F40A3.5n/achrV 7,869,571contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28F13A7.7F13A7.7n/achrV 16,382,944contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences, required for pre-rRNA processing and ribosome biogenesis; SGD:YGR159C
29C23H4.2C23H4.2n/achrX 12,221,143contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
30T07F12.3T07F12.3n/achrX 4,887,726contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
31ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
32F46F5.8F46F5.8n/achrII 821,517
33tbb-4B0272.1n/achrX 9,435,612C. elegans TBB-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin)
34B0198.3B0198.3n/achrX 12,045,895contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
35rom-2C48B4.2n/achrIII 9,593,829C. elegans ROM-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF01694 (Rhomboid family) , PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002610 (Peptidase S54, rhomboid), IPR017213 (Peptidase S54, rhomboid, metazoan)
36ZK1248.7ZK1248.7n/achrII 5,813,080contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
37agr-1F41G3.12n/achrII 6,767,868agr-1 encodes a large (1396-residue) putative agrin, orthologous to human AGRIN (OMIM:103320), EGFLAM, and Q9NQ15; AGR-1 is expressed in buccal epithelium and deposited in pharyngeal basal epithelium; AGR-1 is also expressed in IL1 neurons, distal tip cells, and intestine; an AGR-1 fragment can cluster vertebrate dystroglycan in cell culture; agr-1(eg1770) mutations show no obvious phenotype, including levimasole resistance, and do not enhance other mutations perturbing acetylcholine signalling, the dystrophin-glycoprotein-complex, muscle cell differentiation, or the extracellular matrix.
38C27C12.4C27C12.4n/achrX 14,855,245contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39R01H10.5R01H10.5n/achrIII 10,257,869contains similarity to Homo sapiens Similar to TAF7-like RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 50kDa; ENSEMBL:ENSP00000218510
40R03H10.6R03H10.6n/achrII 4,172,578contains similarity to Pfam domain PF01336 OB-fold nucleic acid binding domain contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR004365 (Nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type)
41dpy-28Y39A1B.3n/achrIII 10,770,127dpy-28 encodes a non-SMC condensin subunit homolog, similar to XCAP-D2 in Xenopus, Cnd1 in S. pombe, and Ycs4p in S. cerevisiae, that is required for negative, chromosome-wide regulation of X-chromosomal genes in XX but not XO animals (dosage compensation), and for some undetermined aspect of body morphogenesis; DPY-28 is part of a multiprotein 'dosage compensation' complex with DPY-26, DPY-27 and MIX-1.
42F31F4.17F31F4.17n/achrV 659,395
43C05G5.2C05G5.2n/achrX 14,748,776contains similarity to Xenopus laevis Nucleolar phosphoprotein.; TR:Q91803
44C08A9.3C08A9.3n/achrX 17,089,713contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
45moc-2W01A11.6n/achrV 6,503,257C. elegans MOC-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00994 Probable molybdopterin binding domain contains similarity to Interpro domains IPR008284 (Molybdenum cofactor biosynthesis, conserved site), IPR001453 (Molybdopterin binding)
46F21D9.1F21D9.1n/achrV 19,267,093This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
47F54B11.5F54B11.5n/achrX 13,595,020contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
48lin-32T14F9.5n/achrX 2,229,639lin-32 encodes a basic helix-loop-helix transcription factor that is required for development of several types of neurons, including the touch receptor neurons and the male sensory ray neurons.
49F30A10.1F30A10.1n/achrI 9,473,896contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
50nhr-227T27B7.5n/achrV 2,286,399C. elegans NHR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)