UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxa-29ZC47.36e-175chrIII 1,273,100This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F36F2.2F36F2.2n/achrI 9,017,387contains similarity to Procambarus clarkii I-connectin.; TR:Q95YM2
4T04A11.1T04A11.1n/achrIV 12,476,146contains similarity to Pfam domain PF02567 Phenazine biosynthesis-like protein contains similarity to Interpro domain IPR003719 (Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein)
5B0507.6B0507.6n/achrV 8,749,589contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
6C24F3.2C24F3.2n/achrIV 10,223,062contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016278 (Tyrosine protein phosphatase, dual specificity, 12), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
7Y9C2UA.2Y9C2UA.2n/achrII 9,146,370contains similarity to Arabidopsis thaliana At2g44720/F16B22.21.; TR:Q8RWQ1
8F37C12.10F37C12.10n/achrIII 7,188,147
9flp-10T06C10.4n/achrIV 7,869,261flp-10 encodes a FMRFamide-related neuropeptide; in males, flp-10 activity is required for a sensory transduction pathway that negatively regulates the frequency of certain substeps of turning behavior during mating; a flp-10::gfp reporter is expressed in a number of neurons including AIM, ASI, AUA, BAG, BDU, DVB, PQR, PVR, and URX, and in the vulD cells.
10B0284.4B0284.4n/achrIII 4,386,243contains similarity to Homo sapiens similar to forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1; ENSEMBL:ENSP00000318812
11F56A8.5F56A8.5n/achrIII 13,266,279This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
12Y40H7A.11Y40H7A.11n/achrIV 15,219,977contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
13R02D5.4R02D5.4n/achrV 14,484,482contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P49639 Homeobox protein Hox-A1; ENSEMBL:ENSP00000325321
14C02F12.5C02F12.5n/achrX 3,671,203C02F12.5 encodes a putatively secreted protein with a Kunitz/bovine pancreatic trypsin inhibitor domain; C02F12.5 has no obvious function in mass RNAi assays.
15T05A7.1T05A7.1n/achrII 4,678,765
16cyp-37B1F28G4.1n/achrV 16,279,374C. elegans CYP-37B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
17F53F10.3F53F10.3n/achrI 3,827,677contains similarity to Pfam domain PF03650 Uncharacterised protein family (UPF0041) contains similarity to Interpro domain IPR005336 (Protein of unknown function UPF0041)
18srx-84F35B12.1n/achrV 11,599,872C. elegans SRX-84 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
20F35C5.12F35C5.12n/achrII 12,912,321contains similarity to Interpro domain IPR003614 (Knottin)
21srd-47F17A2.11n/achrX 12,334,389C. elegans SRD-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22T13F3.4T13F3.4n/achrV 16,265,325contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
23C50B8.1C50B8.1n/achrV 13,566,397contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
24C13B9.2C13B9.2n/achrIII 6,621,178contains similarity to Pfam domain PF05161 MOFRL family contains similarity to Interpro domain IPR007835 (MOFRL)
25ZK643.6ZK643.6n/achrIII 8,958,109contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
26cyp-13A4T10B9.1n/achrII 9,796,716C. elegans CYP-13A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
27snb-2F23H12.1n/achrV 12,345,050C. elegans SNB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR016444 (Synaptobrevin, metazoa/fungi), IPR001388 (Synaptobrevin)
28sre-7K02E11.2n/achrV 14,245,132C. elegans SRE-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
29C04E6.7C04E6.7n/achrV 5,894,251contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR011945 (Predicted HAD-superfamily phosphatase, subfamily IA/Epoxide hydrolase, N-terminal), IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR006402 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3), IPR016059 (ATP-dependent DNA ligase, conserved site), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
30H10E21.4H10E21.4n/achrIII 18,471contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
31ard-1F01G4.2n/achrIV 11,132,448ard-1 encodes a homolog of mammalian 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (HADH II)/amyloid-beta binding alcohol dehydrogenase (ABAD) that is predicted to be mitochondrial.
32F19G12.4F19G12.4n/achrX 1,417,386
33K08D8.1K08D8.1n/achrIV 12,893,458contains similarity to Fusobacterium nucleatum Tryptophanase (EC 4.1.99.1).; TR:Q8RHQ6
34spp-11T25D10.3n/achrII 6,406,317C. elegans SPP-11 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
35B0507.9B0507.9n/achrV 8,765,471
36fbxa-189F47H4.94.9999999999999996e-26chrV 17,346,436This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37nnt-1C15H9.1n/achrX 6,124,888nnt-1 encodes a proton-pumping nicotinamide nucleotide transhydrogenase predicted to be mitochondrial.
38F08F1.3F08F1.3n/achrX 8,430,035
39C50B6.1C50B6.1n/achrV 13,308,835contains similarity to Synechocystis sp Hypothetical protein slr1813.; TR:P73698
40srx-20R13H7.1n/achrIV 6,868,598C. elegans SRX-20 protein ;
41fbxa-53F07G6.71e-49chrX 1,717,501C. elegans FBXA-53 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
42C52A11.3C52A11.3n/achrII 10,737,705contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
43srbc-30C02A12.3n/achrV 3,479,236C. elegans SRBC-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44C04G6.5C04G6.5n/achrII 5,085,937contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
45M176.8M176.8n/achrII 9,437,409contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
46fbxa-186F47H4.68.000000000000001e-23chrV 17,337,347This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
47C16D6.3C16D6.3n/achrX 12,526,895contains similarity to Prochlorococcus marinus Predicted protein.; TR:Q7VCK1
48F58E2.3F58E2.30.0009chrIV 3,468,626This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
49Y57G11C.18Y57G11C.18n/achrIV 14,841,760contains similarity to Interpro domain IPR000767 (Disease resistance protein)
50C29G2.6C29G2.6n/achrV 2,584,386