UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC317.6ZC317.60chrV 5,467,199
2C18G1.9C18G1.93e-167chrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
3gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
4F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738
5C24D10.2C24D10.2n/achrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
6F36A2.10F36A2.10n/achrI 8,819,797contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR005819 (Histone H5)
7Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
8K06A5.2K06A5.2n/achrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
9R02D5.7R02D5.7n/achrV 14,480,818contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
10F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
11ZK637.15ZK637.15n/achrIII 8,920,543contains similarity to Ureaplasma parvum Hypothetical membrane lipoprotein.; TR:Q9PQR8
12F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
13C54G4.3C54G4.3n/achrI 8,005,688contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, skeletal muscle, fetal; ENSEMBL:ENSP00000255381
14W06D4.2W06D4.2n/achrI 9,057,051contains similarity to Pyrobaculum aerophilum PaREP2b.; TR:Q8ZWN7
15F46A9.1F46A9.1n/achrI 9,458,323contains similarity to Sulfolobus acidocaldarius DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:RA50_SULAC
16F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
17Y43F8C.3Y43F8C.3n/achrV 19,618,472contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
18C10G11.8C10G11.8n/achrI 6,272,876contains similarity to Pfam domain PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR001270 (Chaperonin clpA/B), IPR003960 (AAA ATPase, conserved site), IPR005937 (26S proteasome subunit P45), IPR001957 (Bacterial chromosomal replication initiator protein, DnaA), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
19T22B3.3T22B3.3n/achrIV 11,703,476contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
20C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
21ssp-31ZK1225.6n/achrI 13,219,303C. elegans SSP-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
22F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293
23K08C9.2K08C9.2n/achrI 11,487,661
24K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
25T27E7.1T27E7.1n/achrIV 14,520,345contains similarity to Bos taurus Annexin A7 (Annexin VII) (Synexin) (Fragment).; SW:ANX7_BOVIN
26Y67A6A.1Y67A6A.1n/achrI 9,830,034contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
27ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
28Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
29C18A3.7C18A3.7n/achrII 5,730,004contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Arginine/serine-rich coiled-coil protein 1; ENSEMBL:ENSP00000295930
30C17H12.3C17H12.3n/achrIV 6,794,555contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
31T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
32F21H7.5F21H7.5n/achrV 16,238,153contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
33T08B2.12T08B2.12n/achrI 6,231,810contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:Q6S6W0
34W09D6.4W09D6.4n/achrIII 11,079,964contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein MW2515.; TR:Q8NUN4
35ssp-11T28H11.6n/achrIV 4,999,632C. elegans SSP-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
36F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
37rmd-3B0491.3n/achrII 11,338,942C. elegans RMD-3 protein ; contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54XR4
38R13H9.6R13H9.6n/achrIV 5,067,998contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
39T23B3.5T23B3.5n/achrI 6,705,973contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
40R10E9.2R10E9.2n/achrIII 3,963,390contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein (At2g34570).; TR:Q8GWS9
41ZK938.1ZK938.1n/achrII 9,830,005contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
42Y37D8A.5Y37D8A.5n/achrIII 12,854,726contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
43Y44A6D.5Y44A6D.5n/achrV 20,797,500contains similarity to Pfam domain PF01063 Aminotransferase class IV contains similarity to Interpro domains IPR001544 (Aminotransferase, class IV), IPR005786 (Branched-chain amino acid aminotransferase II)
44R10E4.7R10E4.7n/achrIII 4,295,916contains similarity to Interpro domain IPR015813 (Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core)
45ZK637.12ZK637.12n/achrIII 8,924,673contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YDR545W
46F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
47C55C3.4C55C3.4n/achrIV 5,677,163contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
48K01H12.4K01H12.4n/achrIV 9,714,029contains similarity to Simian T-lymphotropic virus 1 Rex p27 protein (Fragment).; TR:O12387
49C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
50F42G4.6F42G4.6n/achrII 13,079,994F42G4.6 encodes a nematode-specific sperm protein; F42G4.6 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, T08G11.2, and Y81G3A.1); F42G4.6(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; F42G4.6 expression is enriched in spermatogenesis.