UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC266.2ZC266.23e-145chrV 4,696,862
2K08D9.1K08D9.1n/achrV 3,236,735
3R05F9.7R05F9.7n/achrII 4,887,230contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
4fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.
5B0284.2B0284.2n/achrIII 4,382,911contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Progesterone-induced-blocking factor 1; ENSEMBL:ENSP00000317144
6srt-45M162.3n/achrV 19,780,434C. elegans SRT-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7fbxb-21ZC204.8n/achrII 1,648,389fbxb-21 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXB-21 also contains a C-terminal type 2 F-box-associated domain of presently unknown function.
8C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
9F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
10sra-33B0304.6n/achrII 4,535,979C. elegans SRA-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
11H35N09.1H35N09.1n/achrX 8,607,362
12W01A11.2W01A11.2n/achrV 6,497,783contains similarity to Pfam domain PF03982 Diacylglycerol acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR007130 (Diacylglycerol acyltransferase)
13F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
14T22E5.3T22E5.3n/achrX 6,386,631contains similarity to Pfam domains PF01682 (DB module) , PF00041 (Fibronectin type III domain) contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
15srg-4T12A2.12n/achrIII 6,261,094C. elegans SRG-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
16scl-19ZK384.1n/achrV 18,732,354C. elegans SCL-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
17srj-1ZK829.8n/achrIV 11,964,638C. elegans SRJ-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18clec-235F36D3.10n/achrV 16,531,589C. elegans CLEC-235 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
19F15D4.4F15D4.4n/achrII 13,241,088contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
20C53D6.6C53D6.6n/achrIV 9,030,151contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
21F14H3.9F14H3.9n/achrV 16,068,329contains similarity to Pfam domain PF03236 (Domain of unknown function DUF263)
22fbxb-111F08D12.11n/achrII 2,774,479This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
23F25H9.7F25H9.7n/achrV 13,468,733contains similarity to Pfam domain PF05882 ACN9 family contains similarity to Interpro domain IPR008381 (ACN9)
24F59B1.4F59B1.4n/achrV 3,626,020contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000194 (ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding)
25T16H12.1T16H12.1n/achrIII 10,084,745contains similarity to Human papillomavirus type 70 E7 protein.; SW:VE7_HPV70
26str-116F07B10.2n/achrV 11,267,629C. elegans STR-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27vab-15R07B1.1n/achrX 9,848,439The vab-15 gene encodes a msh-like homeobox gene that appears required for production of touch cell precursors, and that is orthologous to the human gene MSH HOMEO BOX HOMOLOG 1 (MSX1; OMIM:142983) which when mutated leads to disease.
28K01A2.6K01A2.6n/achrII 300,268
29C31B8.1C31B8.1n/achrV 2,932,269
30srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
31W09C5.1W09C5.1n/achrI 13,627,524contains similarity to Pfam domain PF01201 Ribosomal protein S8e contains similarity to Interpro domain IPR001047 (Ribosomal protein S8e)
32glb-20R01E6.6n/achrX 13,554,276glb-20 encodes a globin; glb-20 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-20 has no obvious function in mass RNAi assays.
33C08A9.8C08A9.8n/achrX 17,103,774contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
34H25K10.6H25K10.6n/achrIV 16,235,400contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35mec-4T01C8.7n/achrX 16,805,158mec-4 encodes an amiloride-sensitive Na+ channel protein (degenerin) required to sense gentle mechanical stimuli (e.g. touch) along the body wall; MEC-4 is paralogous to, and coexpressed with, MEC-10, in all six touch cell neurons where they form a heteromeric mechanotransduction channel.
36srg-5T12A2.11n/achrIII 6,263,078C. elegans SRG-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
37Y73C8C.4Y73C8C.4n/achrV 3,101,079contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
38sre-56C50E10.8n/achrII 12,326,444C. elegans SRE-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR002090 (Na+/H+ exchanger, isoform 6 (NHE6)), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39T10H10.2T10H10.2n/achrX 2,296,444contains similarity to Pfam domains PF04777 (Erv1 / Alr family) , PF00085 (Thioredoxin) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR006863 (Erv1/Alr), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
40Y38H8A.5Y38H8A.5n/achrIV 13,467,731The Y38H8A.5 gene encodes a homolog of the human gene ZNF195 (or p57KIP2), which when mutated leads to Beckwith-Wiedemann syndrome (OMIM:130650).
41ZK455.5ZK455.5n/achrX 11,325,637contains similarity to Pfam domain PF01066 CDP-alcohol phosphatidyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR014472 (Choline/ethanolaminephosphotransferase), IPR000462 (CDP-alcohol phosphatidyltransferase)
42nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
43B0280.7B0280.7n/achrIII 7,111,015
44F47B10.6F47B10.6n/achrX 10,888,627
45srh-155F40D4.2n/achrV 17,180,821C. elegans SRH-155 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
46T10E10.3T10E10.3n/achrX 6,313,109contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47F36G9.3F36G9.3n/achrV 15,958,350contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
48B0205.5B0205.5n/achrI 10,740,393
49clec-247Y51A2A.1n/achrV 18,285,606C. elegans CLEC-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
50K06H6.1K06H6.1n/achrV 588,891contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)