UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC196.1ZC196.11e-74chrV 8,744,495
2srx-128F55B12.7n/achrV 13,838,056C. elegans SRX-128 protein ;
3F27E5.1F27E5.1n/achrII 10,140,416contains similarity to Pfam domain PF02275 Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR003199 (Choloylglycine hydrolase), IPR016699 (Acid ceramidase-like)
4K08D8.1K08D8.1n/achrIV 12,893,458contains similarity to Fusobacterium nucleatum Tryptophanase (EC 4.1.99.1).; TR:Q8RHQ6
5D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
6str-183T13F3.1n/achrV 16,276,778C. elegans STR-183 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7dnj-4C01G8.4n/achrI 5,283,025This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
8W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
9math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
10F46B3.15F46B3.15n/achrV 20,628,725contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
11hex-1T14F9.3n/achrX 2,225,047hex-1 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase that is orthologous to the human gene CERVICAL CANCER PROTO-ONCOGENE 7 (HEXB; OMIM:606873), which when mutated leads to disease.
12T24E12.5T24E12.5n/achrII 3,755,632contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
13rlbp-1T23G11.5n/achrI 7,688,763C. elegans RLBP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00620 RhoGAP domain contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
14F59B10.2F59B10.2n/achrII 10,508,511contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR005819 (Histone H5)
15T02D1.4T02D1.4n/achrIV 17,401,011contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
17Y7A5A.9Y7A5A.9n/achrX 15,828,129contains similarity to Cyprinus carpio Nucleolin.; TR:Q804J2
18F58G4.3F58G4.3n/achrV 8,105,172contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
19rnt-1B0414.2n/achrI 5,782,356rnt-1 encodes a transcription factor that is the sole C. elegans member of the RUNX family of transcriptional regulators; rnt-1 activity is required for several developmental processes, including regulation of hypodermal seam cell proliferation and proper development of the male tail; RNT-1 can physically interact with SMA-4 and regulates, either directly or indirectly, expression of tlp-1 and cki-1, which encode a C2H2 zinc finger and CDK inhibitor, respectively; RNT-1::GFP reporter fusions are reportedly expressed in the nuclei of hypodermal seam cells, intestinal cells, body wall muscles, and, in males, cells derived from the V5, V6 and T lineages that give rise to the sensory rays.
20F59H5.1F59H5.1n/achrII 2,509,863F59H5.1 encodes an unfamiliar protein with a low-complexity N-terminal region and a C-terminal DUF545 motif (of unknown function, found solely in nematode proteins); F59H5.1 is expressed in neuronal head ganglia, intestinal cells, hypodermal cells, and coelomocytes, with strong expression in embryos; F59H5.1 has no obvious function or phenotype in RNAi assays, whether in a normal background or in goa-1(-) or goa-1(gf) mutant backgrounds.
21str-94F07C3.8n/achrV 9,248,642C. elegans STR-94 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR005384 (Duffy antigen/chemokine receptor)
22F35F10.5F35F10.5n/achrV 3,285,611
23F15B9.6F15B9.6n/achrV 13,015,372contains similarity to Interpro domain IPR001211 (Phospholipase A2)
24F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
25D1079.1D1079.1n/achrX 4,405,551
26srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
28T08E11.1T08E11.1n/achrII 1,838,405This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
29C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
30B0393.7B0393.7n/achrIII 4,777,124contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
31B0462.1B0462.1n/achrV 18,326,871contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
32sri-77D2062.9n/achrII 2,604,314C. elegans SRI-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33K07A9.3K07A9.3n/achrIV 1,835,383contains similarity to Interpro domain IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
34R10H1.1R10H1.1n/achrII 7,495,254contains similarity to Interpro domain IPR008374 (SF-assemblin)
35ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
36srj-29F22B8.1n/achrV 16,076,456C. elegans SRJ-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00060 (Ligand-gated ion channel) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) contains similarity to Interpro domains IPR001638 (Bacterial extracellular solute-binding protein, family 3), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001320 (Ionotropic glutamate receptor), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR001508 (NMDA receptor)
37F14H3.12F14H3.12n/achrV 16,074,705contains similarity to Pfam domain PF02149 Kinase associated domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001772 (Kinase-associated KA1)
38K03H6.2K03H6.2n/achrIV 1,512,894contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR008262 (Lipase, active site), IPR016201 (Plexin-like fold)
39T08D2.6T08D2.6n/achrX 180,977contains similarity to Homo sapiens Protein YIPF4; ENSEMBL:ENSP00000238831
40srx-79C01G10.2n/achrV 15,098,590C. elegans SRX-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
42sre-33W05H5.6n/achrII 12,453,974C. elegans SRE-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
43F26A3.1F26A3.1n/achrI 7,641,050contains similarity to Interpro domain IPR008262 (Lipase, active site)
44T28H10.1T28H10.1n/achrV 12,504,477contains similarity to Pfam domain PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR008278 (4'-phosphopantetheinyl transferase)
45try-4F31D4.6n/achrV 20,855,551C. elegans TRY-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
46C17B7.10C17B7.10n/achrV 3,341,460C17B7.10 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.10 has no clear orthologs in other organisms.
47str-102R08H2.13n/achrV 15,385,819C. elegans STR-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48C47D12.5C47D12.5n/achrII 11,685,843
49spp-11T25D10.3n/achrII 6,406,317C. elegans SPP-11 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
50B0250.4B0250.4n/achrV 20,456,958contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)