UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC190.10ZC190.101e-72chrV 8,696,074
2F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
3uev-3F26H9.7n/achrI 9,311,457uev-3 encodes a ubiquitin-conjugating enzyme (UBC or E2) variant that contains the UBC motif, but lacks the critical active-site cysteine residue necessary for catalytic activity; as loss of UEV-3 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UEV-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; based on similarity to Saccharomyces cerevisiae and human proteins, however, UEV-3 may play a role in cell cycle control or response to stress or DNA damage.
4K09H9.4K09H9.4n/achrI 3,134,515contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
5F07H5.7F07H5.7n/achrII 8,793,642
6srsx-1F40D4.5n/achrV 17,177,360C. elegans SRSX-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
7F01F1.14F01F1.14n/achrIII 5,882,603
8srx-39C03A7.6n/achrV 5,157,191C. elegans SRX-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9B0238.7B0238.7n/achrV 5,261,699contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
10str-102R08H2.13n/achrV 15,385,819C. elegans STR-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11ZK353.2ZK353.2n/achrIII 8,398,849contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
12F35E8.9F35E8.9n/achrV 15,916,920contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
13ubc-21C06E2.3n/achrX 8,870,667C. elegans UBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR009060 (UBA-like), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
14srd-47F17A2.11n/achrX 12,334,389C. elegans SRD-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15C04E6.3C04E6.3n/achrV 5,920,241
16C54G10.1C54G10.1n/achrV 14,641,219contains similarity to Homo sapiens similar to secreted gel-forming mucin; ENSEMBL:ENSP00000328427
17srsx-12C13D9.5n/achrV 4,980,446C. elegans SRSX-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18ZK1307.9ZK1307.9n/achrII 9,650,113contains similarity to Pfam domain PF04502 Family of unknown function (DUF572) contains similarity to Interpro domain IPR007590 (Protein of unknown function DUF572)
19C53D6.6C53D6.6n/achrIV 9,030,151contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
20T02B11.6T02B11.6n/achrV 887,079contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
21ztf-9ZK287.6n/achrV 9,691,558C. elegans ZTF-9 protein; contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
22F59B10.2F59B10.2n/achrII 10,508,511contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR005819 (Histone H5)
23F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
24C07A9.10C07A9.10n/achrIII 9,685,849contains similarity to Pfam domain: PF00442 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolases family 2), Score=28.0, E-value=1e-05, N=1
25C09H5.1C09H5.1n/achrV 8,082,547
26asna-2F47G3.2n/achrX 2,383,478C. elegans ASNA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02374 Anion-transporting ATPase contains similarity to Interpro domain IPR003348 (Anion-transporting ATPase)
27str-225C07G3.6n/achrV 3,508,534C. elegans STR-225 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
28srj-45T03D3.6n/achrV 2,836,005C. elegans SRJ-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
29nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30C07A9.12C07A9.12n/achrIII 9,726,313contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
31gcy-4ZK970.5n/achrII 10,306,418gcy-4 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; by homology, GCY-4 may function as a chemosensory receptor; however, as loss of gcy-4 activity via mutation or large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of gcy-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; the sole gcy-4 ::GFP reporter construct reported to date did not produce any specific GFP signals.
32srh-167F57G8.3n/achrV 16,334,360C. elegans SRH-167 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33twk-10K04A8.4n/achrV 6,553,200C. elegans TWK-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
34srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
35srg-5T12A2.11n/achrIII 6,263,078C. elegans SRG-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
36C44B12.6C44B12.6n/achrIV 1,131,250contains similarity to Interpro domain IPR010345 (Interleukin-17)
37F39G3.6F39G3.6n/achrV 4,712,695contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
38srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39dsl-4F16B12.2n/achrX 14,091,441dsl-4 encodes a putative secreted protein with a single DSL domain and three EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; unlike the nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins (including DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7), DSL-4 is evolutionarily divergent, with perhaps a distant affinity to APX-1, ARG-1, and LAG-2.
40F25H9.7F25H9.7n/achrV 13,468,733contains similarity to Pfam domain PF05882 ACN9 family contains similarity to Interpro domain IPR008381 (ACN9)
41T21E12.3T21E12.3n/achrI 4,403,989contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
42EGAP2.2EGAP2.2n/achrII 5,230,269
43B0507.5B0507.5n/achrV 8,754,261
44sos-1T28F12.3n/achrV 4,533,472The sos-1 gene, also known as let-341, encodes an ortholog of Son of sevenless, a guanine nucleotide exchange factor that affects viability, sex myoblast migration, vulval induction, and oogenesis; it acts genetically downstream of let-23 and upstream of let-60 with respect to vulval development.
45srh-139F57E7.3n/achrV 16,484,653C. elegans SRH-139 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46srh-206Y102A5C.15n/achrV 16,954,279C. elegans SRH-206 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47sqv-8ZK1307.5n/achrII 9,648,550The sqv-8 gene encodes a glucuronyl transferase, biochemically active in vitro, that is required for cytokinesis of one-cell embryos and for vulval morphogenesis; SQV-8 is homologous to three distinct glucuronyl transferases (GlcAT-I, GlcAT-P and GlcAT-D) that play a role in the synthesis of different glycoconjugates; the common requirement for SQV-8 in both cytokinesis and morphogenesis may be to promote filling an extracellular space with hygroscopic proteoglycans (either in the eggshell, or underneath the L4 cuticle), which in turn may cause the space to fill with fluid.
48ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
49F31B9.1F31B9.1n/achrX 15,912,318contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50Y39A1A.7Y39A1A.7n/achrIII 10,619,501contains similarity to Sus scrofa Lymphocyte antigen 64-like protein.; TR:Q7YRL4