UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1morc-1ZC155.30chrIII 5,205,271C. elegans MORC-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3tre-5C23H3.7n/achrII 54,158C. elegans TRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
4F09E5.2F09E5.2n/achrII 5,376,151contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
5F25H5.7F25H5.7n/achrI 9,156,467contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
6clec-29T25E12.9n/achrV 16,738,407C. elegans CLEC-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
7Y54E2A.8Y54E2A.8n/achrII 14,780,444contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
8che-11C27A7.4n/achrV 12,147,469che-11 encodes a large, unfamiliar protein with orthologs in vertebrates and arthropods (e.g., KIAA0590 and CG11838-PA) and in Chlamydomonas (IFT140), as well as distant similarity to OSM-1 and ZK520.1; che-11 is required for normal synthesis of sensory cilia (via intraflagellar transport) in sensory neurons, osmotic avoidance, and dauer formation.
9nhr-75C49D10.6n/achrII 3,867,513C. elegans NHR-75 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10C33A11.2C33A11.2n/achrX 15,367,917contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG4025-PA;; FLYBASE:CG4025
11T16A1.3T16A1.3n/achrII 2,084,511
12clec-176E03H12.3n/achrIV 4,984,700C. elegans CLEC-176 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
13srh-116Y61B8A.1n/achrV 17,253,997C. elegans SRH-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14srt-38F47D2.6n/achrV 4,270,408C. elegans SRT-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15pdhk-2ZK370.5n/achrIII 8,739,634C. elegans PDHK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005467 (Signal transduction histidine kinase, core), IPR004358 (Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal), IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like)
16sru-30C50C10.3n/achrV 9,814,394C. elegans SRU-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
17Y75B8A.25Y75B8A.25n/achrIII 12,278,010contains similarity to Homo sapiens Golgi autoantigen, golgin subfamily B member 1; ENSEMBL:ENSP00000315938
18phy-3T20B3.7n/achrV 16,836,164C. elegans PHY-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
19srh-279F11A5.2n/achrV 16,193,941C. elegans SRH-279 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20F57G4.9F57G4.9n/achrV 17,644,291contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
21R01H10.4R01H10.4n/achrIII 10,255,933contains similarity to Sus scrofa Outer dense fiber protein.; SW:ODFP_PIG
22srg-61C24B9.11n/achrV 2,739,518C. elegans SRG-61 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
23F14D2.6F14D2.6n/achrII 3,331,956contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
24F35E8.6F35E8.6n/achrV 15,912,576contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
25str-181R11D1.6n/achrV 12,717,648C. elegans STR-181 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26srh-220F47C12.5n/achrIV 3,977,216C. elegans SRH-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27tat-3W09D10.2n/achrIII 10,725,682C. elegans TAT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006539 (Phospholipid-translocating P-type ATPase, flippase), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
28osm-7T05D4.4n/achrIII 13,578,274C. elegans OSM-7 protein ;
29srx-96T01D3.4n/achrV 13,712,245C. elegans SRX-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30F10B5.3F10B5.3n/achrII 8,148,546contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
31W04A4.2W04A4.2n/achrI 13,683,368contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ90033; TR:Q8N2R3
32C43D7.7C43D7.7n/achrV 19,319,210contains similarity to Dictyostelium discoideum Filament-interacting protein.; TR:Q967Y0
33T20F7.3T20F7.3n/achrX 16,860,808contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
34srx-8C14C6.9n/achrV 555,265C. elegans SRX-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35str-209F26G5.5n/achrV 4,949,965C. elegans STR-209 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37C17G10.3C17G10.3n/achrII 5,583,865
38F19B10.4F19B10.4n/achrII 3,661,345contains similarity to Interpro domain IPR015425 (Actin-binding FH2)
39frm-9F31B12.3n/achrX 10,817,663frm-9 encodes a B41/ERM (ezrin/radixin/moesin) domain containing protein.
40M163.2M163.2n/achrX 14,497,680contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
41Y38H6A.3Y38H6A.3n/achrV 20,342,053contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
42sre-32W05H5.7n/achrII 12,455,773C. elegans SRE-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
43F26H9.8F26H9.8n/achrI 9,322,465contains similarity to Pfam domains PF01501 (Glycosyl transferase family 8) , PF06427 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR009448 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase), IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
44mgl-2F45H11.4n/achrI 10,387,757mgl-2 encodes a Group I metabotropic glutamate receptor (OMIM:604473, 604102, loss-of-function mutations in mice are associated with defects in long-term potentiation); by homology, MGL-2 is predicted to function as a post-synaptic G protein-coupled receptor that, in response to glutamate binding, stimulates phospholipase C activity and increases neuronal excitation, and in mammalian tissue culture cells, glutamate stimulation of MGL-2 does result in increased phosphoinositide turnover; a mutation in mgl-2 indicates that it is required for normal head movements and tap reversal reflexes, while loss of mgl-2 activity via large-scale RNAi screens indicates that MGL-2 is also required for embryogenesis; a mgl-2::GFP reporter is expressed in interneurons.
45T16A9.4T16A9.4n/achrV 14,218,017T16A9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while T16A9.4 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
46F11G11.13F11G11.13n/achrII 4,875,478contains similarity to Pfam domain PF00217 ATP:guanido phosphotransferase, C-terminal catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR000749 (ATP:guanido phosphotransferase), IPR014746 (Glutamine synthetase/guanido kinase, catalytic region)
47W09D6.5W09D6.5n/achrIII 11,089,923contains similarity to Saccharomyces cerevisiae cell wall integrity and stress response component 1; SGD:YOR008C
48K06G5.3K06G5.3n/achrX 14,221,334contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C
49C45G9.1C45G9.1n/achrIII 5,075,294contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
50C44E4.2C44E4.2n/achrI 4,632,370contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)