UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ZC155.2ZC155.21e-94chrIII 5,219,635contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold)
2Y49E10.24Y49E10.24n/achrIII 12,486,416contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
3T23G4.2T23G4.2n/achrIV 13,688,527contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
4nhr-39F44A2.4n/achrV 9,303,947C. elegans NHR-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5C50D2.6C50D2.6n/achrII 86,096
6ZK177.3ZK177.3n/achrII 5,516,470contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
7srj-50T03D3.2n/achrV 2,833,942C. elegans SRJ-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8R04A9.1R04A9.1n/achrX 405,128
9F07C3.2F07C3.2n/achrV 9,226,731
10C16D9.6C16D9.6n/achrV 8,249,274contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9520-PA;; FLYBASE:CG9520
11ZC84.4ZC84.4n/achrIII 9,211,781ZC84.4 encodes a G protein-coupled receptor with acidic amino acids in the -3 position of its PDZ binding motif; ZC84.4 protein binds PDZ domain 10 of the multi-PDZ domain protein, MPZ-1, in GST pulldown experiments; by analogy with SER-1, the PDZ binding motif of ZC84.4 may enhance its signalling.
12T19D7.7T19D7.7n/achrX 678,427contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
13F08G12.5F08G12.5n/achrX 11,309,490contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
14F53F4.2F53F4.2n/achrV 13,589,230contains similarity to Hordeum vulgare Glycine-rich cell wall structural protein precursor.; SW:P17816
15ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
16F36D1.6F36D1.6n/achrI 11,270,696contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
17Y70C5B.1Y70C5B.1n/achrV 16,662,837
18C14A6.7C14A6.7n/achrV 18,167,965contains similarity to Gallus gallus Stathmin 3 (SCG10-like protein) (Neuroplasticin-2).; SW:STN3_CHICK
19K02D10.3K02D10.3n/achrIII 8,771,549
20Y7A5A.3Y7A5A.3n/achrX 15,783,069
21ifta-2T28F3.6n/achrIV 17,301,376ifta-2 encodes a ciliary protein, orthologous to human RABL5, that is required for normally short life span and dauer formation; IFTA-2 is expressed in amphid, labial, and phasmid ciliated sensory neurons; intracellularly, IFTA-2 resides in the bases and axonemes of cilia, colocalizing with DAF-2 and AGE-1; IFTA-2 may be either a cargo or a cargo-docking component of intraflagellar transport (IFT) by the IFT-B complex; ciliary basal localization of IFTA-2 is abolished by a T42N mutation predicted to lock ITFA-2 into an inactive, GDP-bound conformation; ifta-2(tm1724) mutants have abnormally long lifespans and constitutive dauer formation, perhaps because IFTA-2 regulates DAF-2 signalling from ciliated sensory neurons; IFTA-2 is not required for cilium assembly or IFT, nor is it required for chemosensation or osmosensation; the ciliary localization of IFTA-2 is conserved in RABL5; via an X-box in its promoter, ifta-2 is a candidate for direct regulation by DAF-19.
22C43F9.5C43F9.5n/achrIV 10,590,044contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
23srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
24Y43F8B.10Y43F8B.10n/achrV 19,475,668
25tkr-1C38C10.1n/achrIII 9,386,535tkr-1 encodes a G protein-coupled receptor that is the C. elegans tachykinin-like neuropeptide receptor homolog; by homology, TKR-1 is predicted to function in modulation of excitatory neurotransmission; as loss of tkr-1 activity via RNAi results in moderate reduction of fat content, TKR-1 may play a specific role in regulating lipid metabolism; a tkr-1 reporter gene fusion is reportedly expressed in the socket cells of the deirid and post-deirid sensilla from the L2 larval stage through adulthood.
26cwp-5F48C11.2n/achrX 13,184,746C. elegans CWP-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27ndx-2W02G9.1n/achrV 2,664,041ndx-2 encodes a NUDIX hydrolase; by sequence comparison, NDX-2 is predicted to be orthologous to human NUDT5 which, in vitro, possesses ADP-sugar diphosphatase activity; in C. elegans, loss of ndx-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, consistent with the proposed nonessential roles for Nudix proteins in eliminating potentially toxic nucleotide metabolites from cells and modulating levels of metabolic intermediates by shuttling them into alternative biochemical pathways.
28C45G9.11C45G9.11n/achrIII 5,066,320
29C17B7.9C17B7.9n/achrV 3,331,512contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
30E02C12.12E02C12.12n/achrV 9,380,457contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domain IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
31K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
32amt-2F49E11.3n/achrIV 13,044,619amt-2 encodes a transmembrane protein that is one of four C. elegans members of the ammonium transporter AMT/Rh family of proteins predicted to function in transport of ammonium ions across the plasma membrane.
33F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
34srd-36R04D3.6n/achrX 13,294,014C. elegans SRD-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35bath-25T27C10.4n/achrI 10,877,883C. elegans BATH-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00036 (EF hand) (2), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
36F54D12.2F54D12.2n/achrII 1,399,803contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
37sro-1D1022.6n/achrII 7,461,799C. elegans SRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38C12D5.9C12D5.9n/achrV 7,689,147contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
39srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
40srh-192ZC132.7n/achrV 4,313,561C. elegans SRH-192 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41T05E11.2T05E11.2n/achrIV 11,115,881T05E11.2 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; T05E11.2 is worm-specific, with a with highly divergent sequence lacking obvious homologs; T05E11.2 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
42Y57G11C.23Y57G11C.23n/achrIV 14,858,495contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
43srt-44M199.1n/achrIV 15,105,017C. elegans SRT-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44Y116A8C.43Y116A8C.43n/achrIV 17,089,705contains similarity to Bacillus thuringiensis Pesticidial crystal protein cry12Aa (Insecticidal delta-endotoxinsCryXIIA(a)) (Crystaline entomocidal protoxin) (142 kDa crystalsprotein).; SW:CCAA_BACTU
45str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48gab-1ZC482.1n/achrIII 12,775,682gab-1 encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor beta-like subunit with both the neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding and transmembrane domains; gab-1 can form a GABA-responsive channel when co-expressed with alpha/gamma type subunits in a heterologous expression system; experiments with gab-1 indicate that GABA receptors are involved in the mechanism of resistance to the widely used broad-spectrum anthelmintic drug Ivermectin.
49C03H5.7C03H5.7n/achrII 381,414contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA)
50F49D11.2F49D11.2n/achrI 10,922,443contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)