UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1cyc-2.2ZC116.26e-68chrV 12,611,951ZC116.2 encodes, along with E04A4.7, one of two C. elegans cytochrome c proteins; the product of ZC116.2 is predicted to function in the electron transport chain by transferring electrons from respiratory chain Complex III to Complex IV; RNAi screens indicate the ZC116.2 activity is required for embryonic development as well as for normal body size and rates of growth.
2F31E8.5F31E8.5n/achrII 6,806,093
3C04F12.6C04F12.6n/achrI 9,693,209contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR013303 (Wnt-14 protein)
4C24A11.1C24A11.1n/achrI 5,402,352
5C18H7.4C18H7.4n/achrIV 594,283contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
6spe-11F48C1.7n/achrI 5,331,412spe-11 encodes a novel protein that is required for early embryonic development and for regulating the dynamic morphology of sperm pseudopods; although the precise biological role of SPE-11 is not yet known, SPE-11 is one of the few paternally provided proteins known to be essential for embryogenesis, and may constitute a sperm-associated factor required for oocyte activation; SPE-11 is first detected in the nuclei of primary spermatocytes and then remains tightly associated with sperm chromatin until fertilization at which point it appears to be degraded.
7cyn-2ZK520.5n/achrIII 13,693,091cyn-2 is a predicted member of the cytosolic Cyclosporin A-binding cyclophilin family that is functional when expressed in E. coli.
8F47B3.5F47B3.5n/achrI 3,963,648contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
9T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
10C10H11.7C10H11.7n/achrI 4,720,444contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
11F17C8.3F17C8.3n/achrIII 4,733,966contains similarity to Pfam domains PF01958 (Domain of unknown function DUF108) , PF03447 (Homoserine dehydrogenase, NAD binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR005106 (Aspartate/homoserine dehydrogenase, NAD-binding), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002811 (Aspartate dehydrogenase)
12F13G11.2F13G11.2n/achrIV 14,633,712contains similarity to Rattus norvegicus Chondroadherin precursor (Cartilage leucine-rich protein).; SW:CHAD_RAT
13C47A4.5C47A4.5n/achrIV 13,745,790contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
14Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
15C38C3.8C38C3.8n/achrV 1,505,005contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
16Y43C5B.3Y43C5B.3n/achrIV 10,354,101contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR001312 (Hexokinase), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier)
17ZK507.3ZK507.3n/achrIII 9,102,142contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
18T05F1.8T05F1.8n/achrI 9,643,072contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
19C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
20C27D8.2C27D8.2n/achrIV 12,713,741contains similarity to Pfam domain PF07707 BTB And C-terminal Kelch contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011705 (BTB/Kelch-associated), IPR013089 (Kelch related)
21C33F10.12C33F10.12n/achrII 4,837,006contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
22K07A1.5K07A1.5n/achrI 9,591,179contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR003060 (Pyocin S killer protein)
23C08F8.6C08F8.6n/achrIV 11,163,509contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
24F47B3.2F47B3.2n/achrI 3,970,840contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
25Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
26T22C1.9T22C1.9n/achrI 7,959,350contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nuclear Assembly Factor; SGD:YNL124W
27D1081.5D1081.5n/achrI 8,481,820contains similarity to Interpro domain IPR009061 ()
28bath-37K08E4.5n/achrIV 12,073,207C. elegans BATH-37 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
29T21G5.4T21G5.4n/achrI 6,873,167contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
30dod-21C32H11.10n/achrIV 12,937,319C. elegans DOD-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
31C01G12.8C01G12.8n/achrII 14,595,473contains similarity to Pfam domains PF00689 (Cation transporting ATPase, C-terminus) , PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) , PF00690 (Cation transporter/ATPase, N-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR005775 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit, eukaryotic), IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR004014 (ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR006068 (ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR000695 (H+ transporting ATPase, proton pump)
32T08B6.4T08B6.4n/achrIV 4,907,072contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
33F36A2.12F36A2.12n/achrI 8,826,422
34F56F3.4F56F3.4n/achrIII 4,469,813contains similarity to Pfam domains PF00240 (Ubiquitin family) , PF01428 (AN1-like Zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR000058 (Zinc finger, AN1-type), IPR000626 (Ubiquitin)
35K06H7.8K06H7.8n/achrIII 8,097,370contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36C35E7.9C35E7.9n/achrI 10,807,562contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
37F02C9.4F02C9.4n/achrV 3,137,852contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
38Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
39ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
40F33D11.7F33D11.7n/achrI 5,850,957contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
41C16A11.7C16A11.7n/achrII 4,256,423
42T02E1.6T02E1.6n/achrI 8,211,732contains similarity to Akodon andinus NADH dehydrogenase subunit 4 (EC 1.6.5.3) (NADH-ubiquinonesoxidoreductase chain 4) (Fragment).; TR:O21539
43C47A4.3C47A4.3n/achrIV 13,741,621contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
44F59A7.9F59A7.9n/achrV 2,005,893contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domains IPR005856 (Cysteine synthase K/M), IPR001216 (Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase P-phosphate-binding site), IPR005859 (Cysteine synthase A), IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit), IPR016040 (NAD(P)-binding)
45F36H12.9F36H12.9n/achrIV 5,257,678contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
46B0334.10B0334.10n/achrII 11,518,945contains similarity to Vaccinia virus TB17L.; TR:Q9JF36
47ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
48ZC412.5ZC412.5n/achrV 14,874,791
49K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
50B0218.7B0218.7n/achrIV 8,165,316