UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Y73F4A.3Y73F4A.35e-86chrIV 9,040,014contains similarity to Pfam domain PF03351 DOMON domain contains similarity to Interpro domains IPR005018 (DOMON related), IPR008960 (Carbohydrate-binding family 9/cellobiose dehydrogenase, cytochrome), IPR013050 (DOMON)
2fbxa-24F54D10.2n/achrII 3,817,370C. elegans FBXA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
3F12D9.2F12D9.2n/achrX 8,646,792
4F46A8.7F46A8.7n/achrI 11,238,164contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein MGC35285; ENSEMBL:ENSP00000279688
5C34F11.8C34F11.8n/achrII 5,210,353contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
6C03G6.17C03G6.17n/achrV 7,380,393contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
7nlp-12M01D7.5n/achrI 1,843,618nlp-12 encodes two predicted neuropeptide-like proteins; nlp-12 is part of a LQFamide neuropeptide family that has members in at least one other nematode species; nlp-12 is expressed in one tail neuron; as loss of nlp-12 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of nlp-12-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
8T24F1.5T24F1.5n/achrII 11,319,376contains similarity to Bombyx mori Lebocin 1/2 precursor.; SW:LEB1_BOMMO
9lact-6C06A12.5n/achrIV 17,430,817lact-6 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted signal sequence in its N terminus.
10ttr-29R90.4n/achrV 12,906,429C. elegans TTR-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
11F36D1.7F36D1.7n/achrI 11,263,396contains similarity to Bacteriophage T5 L-shaped tail fiber protein (LTF protein).; SW:VLTF_BPT5
12ttr-27R90.2n/achrV 12,903,803C. elegans TTR-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
13cex-1F56D1.6n/achrII 5,448,034C. elegans CEX-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
14F47B8.2F47B8.2n/achrV 14,316,299contains similarity to Lyngbya lagerheimii CP 43 protein (Fragment).; TR:Q937F7
15F14F11.2F14F11.2n/achrII 8,295,048contains similarity to Rhodopirellula baltica Methanol dehydrogenase regulatory protein (EC 1.1.1.244).; TR:Q7UX83
16C17G10.7C17G10.7n/achrII 5,607,281
17F58E10.7F58E10.7n/achrV 13,993,064contains similarity to Xenopus laevis FK506-binding protein.; TR:Q9I8P8
18nlp-35C33A12.2n/achrIV 9,518,633C. elegans NLP-35 protein ;
19F07C3.9F07C3.9n/achrV 9,254,456
20ZK971.1ZK971.1n/achrII 10,279,516contains similarity to Arabidopsis thaliana Gb|AAB67622.1.; TR:Q9LT65
21F11C1.4F11C1.4n/achrX 12,979,059contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9186-PA;; FLYBASE:CG9186
22F08G12.8F08G12.8n/achrX 11,317,416contains similarity to Mus musculus Tenascin-R.; TR:Q8BYI9
23nlp-8D2005.2n/achrI 7,801,131C. elegans NLP-8 protein ;
24F53A9.7F53A9.7n/achrX 8,716,682contains similarity to Interpro domain IPR002395 (HMW kininogen)
25dhs-26ZK816.5n/achrX 3,361,621dhs-26 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
26gst-41R13D7.7n/achrV 7,398,864C. elegans GST-41 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
27ins-11C17C3.4n/achrII 5,556,897ins-11 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-11 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and is expressed in the labial sensory neurons, the nerve ring, and other neurons; although the precise role of INS-11 in C. elegans development is not yet clear, loss of INS-11 function via RNA-mediated interference can result in animals that are smaller than wild type (Sma).
28F53F4.7F53F4.7n/achrV 13,613,185contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
29K01A2.10K01A2.10n/achrII 322,278contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 92; ENSEMBL:ENSP00000238156
30F32G8.3F32G8.3n/achrV 10,554,899contains similarity to Homo sapiens Splice isoform Long of Q13595 Transformer-2 protein homolog; ENSEMBL:ENSP00000297071
31bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
32nlp-7F18E9.2n/achrX 8,593,444C. elegans NLP-7 protein ;
33nlp-5F35C11.1n/achrII 8,243,059C. elegans NLP-5 protein ;
34lys-3Y22F5A.6n/achrV 10,282,795lys-3 encodes one of a family of ten C. elegans lysozyme genes that are homologous to lysozymes in the amoeboid protozoon Entamoeba histolytica.
35C32H11.3C32H11.3n/achrIV 12,919,384contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
36C17B7.4C17B7.4n/achrV 3,339,687contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
37C08E8.4C08E8.4n/achrV 18,372,276contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domain IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464)
38dhs-31T04B2.6n/achrIV 10,040,250C. elegans DHS-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
39T28A11.5T28A11.5n/achrV 3,270,895contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
40F53A9.1F53A9.1n/achrX 8,711,652contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR002395 (HMW kininogen)
41ZK970.7ZK970.7n/achrII 10,312,538contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
42C13A2.4C13A2.4n/achrV 7,279,942contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
43nlp-37F48B9.4n/achrX 2,163,570C. elegans NLP-37 protein ;
44fipr-24C37A5.8n/achrI 14,157,799C. elegans FIPR-24 protein ;
45F16B4.7F16B4.7n/achrV 1,585,902contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG7294-PA;; FLYBASE:CG7294
46F53A9.6F53A9.6n/achrX 8,713,583contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002395 (HMW kininogen)
47tag-243T04A8.4n/achrIII 4,686,618C. elegans TAG-243 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding)
48clec-98ZK39.7n/achrI 11,154,783C. elegans CLEC-98 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49T07D1.3T07D1.3n/achrX 2,443,181contains similarity to Interpro domain IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
50tsp-5Y45F10B.1n/achrIV 13,591,144C. elegans TSP-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)