UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-210Y73C8C.20chrV 3,119,349C. elegans CLEC-210 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
2B0238.1B0238.1n/achrV 5,241,934contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
3H02F09.3H02F09.3n/achrX 1,570,762contains similarity to Interpro domain IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter)
4W02B12.9W02B12.9n/achrII 11,470,937contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
5mec-5E03G2.3n/achrX 15,946,401mec-5 encodes a collagen unique in the number of Gly-X-Y repeats and in the composition of amino acids surrounding these repeats; MEC-5 is required for normal mechanosensory response to gentle touch and for the proper functioning of the touch receptor neurons; mec-5 interacts genetically with mec-4 and mec-10 which encode degenerins (ion channels) expressed in the touch neurons, mec-9, which encodes a protein containing EGF-like and Kunitz/protease inhibitor domains secreted by the touch neurons, and mec-12, which encodes an alpha-tubulin expressed in the touch neurons; these genetic interactions suggest that MEC-5 may play a role in anchoring the degenerin complex to the extracellular matrix; MEC-5 is produced and secreted by hypodermal cells.
6M28.8M28.8n/achrII 10,630,658contains similarity to Interpro domain IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II)
7F10D11.4F10D11.4n/achrI 8,441,960contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
8K03H1.5K03H1.5n/achrIII 9,935,960contains similarity to Pfam domains PF03782 (AMOP domain) , PF06119 (Nidogen-like) , PF00094 (von Willebrand factor type D domain) , PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR005533 (AMOP), IPR002909 (Cell surface receptor IPT/TIG), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003886 (Nidogen, extracellular region), IPR016060 (Complement control module), IPR001846 (von Willebrand factor, type D)
9AC8.4AC8.4n/achrX 227,022
10F46G10.4F46G10.4n/achrX 13,335,352contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
11F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
12F55G11.7F55G11.7n/achrIV 12,961,290contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
13E04F6.6E04F6.6n/achrII 7,198,430contains similarity to Interpro domain IPR000183 (Orn/DAP/Arg decarboxylase 2)
14F18A11.2F18A11.2n/achrII 13,034,546contains similarity to Pfam domain PF00650 CRAL/TRIO domain contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal)
15F40A3.2F40A3.2n/achrV 7,880,134contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
16W02B12.1W02B12.1n/achrII 11,450,148contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
17mom-1T07H6.2n/achrX 6,295,619mom-1 encodes a predicted O-acyltransferase that is orthologous to Porcupine proteins conserved across a wide range of species; MOM-1 functions as part of a Wnt/MAPK signaling pathway that is required maternally for endoderm induction in the early embryo; by homology, MOM-1 is predicted to be a membrane-spanning endoplasmic reticulum protein that stimulates post-translational processing of Wnt signaling molecules such as MOM-2; embryonic mosaic analysis indicates that MOM-1 activity is required in the signaling cell, P2, for proper specification of endoderm, consistent with its predicted role in processing MOM-2/Wnt.
18C30F12.2C30F12.2n/achrI 6,969,030contains similarity to Pfam domain PF03969 AFG1-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005654 (AFG1-like ATPase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
19str-48C34D4.8n/achrIV 7,123,053C. elegans STR-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
21ugt-61F39G3.1n/achrV 4,743,888C. elegans UGT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
22B0238.13B0238.13n/achrV 5,245,859contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
23B0524.6B0524.6n/achrIII 1,903,905
24R05D3.6R05D3.6n/achrIII 8,350,531R05D3.6 encodes the epsilon subunit of the soluble, catalytic F1 portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); RNAi experiments indicate that loss of R05D3.6 activity has minor effects on growth rate.
25C52A10.2C52A10.2n/achrV 5,235,946contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
26fbxa-31ZC47.5n/achrIII 1,270,493This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
27Y75B8A.3Y75B8A.3n/achrIII 12,104,053contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
28snf-12T25B6.7n/achrX 9,031,634C. elegans SNF-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
29abts-2F52D10.1n/achrX 11,587,609abts-2 encodes an anion transporter; when expressed in Xenopus oocytes, ABTS-2 does not exhibit detectable transport of chloride, sulfate, or oxolate anions; ABTS-2::GFP fusion proteins are expressed in the larval excretory cell and the adult ovaries, while an abts-2::gfp promoter fusion is seen in only one tail ganglion neuron; in intestinal cells, the ABTS-2::GFP fusion protein localizes to the basolateral membrane.
30T10E10.4T10E10.4n/achrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
31mab-10R166.1n/achrII 10,532,058C. elegans MAB-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF04905 (NAB conserved region 2 (NCD2)) , PF04904 (NAB conserved region 1 (NCD1)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR006988 (Nab, N-terminal), IPR006989 (Nab, central region)
32sulp-4K12G11.1n/achrV 11,877,220sulp-4 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-4 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids and when expressed in Xenopus oocytes, SULP-4 exhibits robust transport of sulfate and more modest transport of chloride ions and oxalate; a SULP-4::GFP fusion is expressed in the apical canaliculae of the excretory cell and also in some head neurons.
33F40F4.7F40F4.7n/achrX 3,244,931contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
34F32H5.4F32H5.4n/achrV 13,362,228contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
35sgcb-1K01A2.1n/achrII 327,229K01A2.1 is orthologous to the human gene SARCOGLYCAN, BETA (43KD DYSTROPHIN-ASSOCIATED GLYCOPROTEIN) (SGCB; OMIM:600900), which when mutated leads to disease.
36srsx-28C51E3.3n/achrV 10,153,640C. elegans SRSX-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37C50D2.2C50D2.2n/achrII 110,283contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR004841 (Amino acid permease-associated region), IPR002293 (Amino acid/polyamine transporter I)
38Y43F8B.14Y43F8B.14n/achrV 19,453,610contains similarity to Saccharomyces cerevisiae has strong homology to Drosophila ISWI; SGD:YOR304W
39D1014.7D1014.7n/achrV 8,119,293contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
40F31A3.3F31A3.3n/achrX 17,533,568
41C25G4.10C25G4.10n/achrIV 12,472,778contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF01682 (DB module) (3), PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
42R102.6R102.6n/achrIV 10,699,884contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
43F21G4.1F21G4.1n/achrX 9,890,917contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF03137 (Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR000539 (Frizzled protein), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44R07H5.9R07H5.9n/achrIV 11,208,377contains similarity to Saccharomyces cerevisiae involved in septin organization; SGD:YCL024W
45K08D10.10K08D10.10n/achrIV 4,155,758
46tag-336Y69H2.12n/achrV 18,653,219C. elegans TAG-336 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (7), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
47F53B3.3F53B3.3n/achrX 2,868,560
48ZK488.6ZK488.6n/achrV 591,473contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
49srx-35T01C4.5n/achrV 7,121,587C. elegans SRX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50C32E8.11C32E8.11n/achrI 3,812,136contains similarity to Pfam domains PF02617 (ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS) , PF02207 (Putative zinc finger in N-recognin (UBR box)) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013993 (Zinc finger, N-recognin, metazoa), IPR014719 (Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like), IPR003126 (Zinc finger, N-recognin), IPR000315 (Zinc finger, B-box), IPR003769 (Adaptor protein ClpS, core)