UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1hex-5Y70D2A.20chrX 14,903,528hex-5 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase.
2C42C1.12C42C1.12n/achrIV 12,281,946contains similarity to Entamoeba histolytica HM-1:IMSS Hypothetical protein.; TR:Q50Q25
3col-178C34F6.2n/achrX 11,199,889C. elegans COL-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
4K07A1.13K07A1.13n/achrI 9,584,354contains similarity to White spot syndrome virus Wsv319.; TR:Q8VAS3
5tag-162F47B3.8n/achrI 3,948,944C. elegans TAG-162 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) (10), PF00058 (Low-density lipoprotein receptor repeat class B) (9)contains similarity to Interpro domains IPR000033 (), IPR006212 (Furin-like repeat), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
6F32D8.2F32D8.2n/achrV 10,884,916contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
7tag-97C33A11.4n/achrX 15,373,762C. elegans TAG-97 protein; contains similarity to Pfam domains PF02198 (Sterile alpha motif (SAM)/Pointed domain) , PF00178 (Ets-domain) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR000418 (Ets), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR003118 (Sterile alpha motif/pointed), IPR013761 (Sterile alpha motif-type)
8F20H11.5F20H11.5n/achrIII 6,588,571F20H11.5 encodes a putative secreted D-aspartate oxidase (DASPO), paralogous to C47A10.5 and F18E3.7; recombinant F20H11.5 protein is insoluble when expressed in E. coli, and thus has not yet been tested in vitro for activity; F20H11.5 is expressed in a head mesodermal cell, hypodermis, other head cells, and vulva.
9srj-25C05E4.10n/achrV 735,347C. elegans SRJ-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
10sru-18T04A11.9n/achrIV 12,503,147C. elegans SRU-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
11ugt-27C10H11.5n/achrI 4,725,415C. elegans UGT-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
12T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
13C03G6.5C03G6.5n/achrV 7,365,571contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
14srd-34F32G8.1n/achrV 10,548,271C. elegans SRD-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15let-502C10H11.9n/achrI 4,741,246let-502 encodes a Rho-binding Ser/Thr kinase orthologous to human myotonic dystrophy kinase (DM-kinase); let-502 is required for early embryonic cleavages, embryonic elongation, migration of hypodermal P cells to a ventral position, normal spermathecal contraction, and fertility; LET-502 is required for hypodermal cells to properly change their shape, and is expressed in those cells, during embryonic elongation; let-502 mutations are suppressed by mel-11 mutations, and the pattern of LET-502 expression in the embryonic epidermis and the spermatheca is opposite to that of MEL-11, indicating that LET-502 and MEL-11 have opposing functions (presumably tissue contraction and relaxation); MEL-11 requires LET-502 (along with the nonmuscle myosin NMY-1) for proper localization.
16C13A2.10C13A2.10n/achrV 7,274,350contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
17C07D10.5C07D10.5n/achrII 7,382,456
18Y40H7A.10Y40H7A.10n/achrIV 15,212,835contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
19F47B8.6F47B8.6n/achrV 14,329,569contains similarity to Drosophila heteroneura Aminopeptidase N (Fragment).; TR:O61534
20asah-1K11D2.2n/achrI 12,506,351K11D2.2 is orthologous to the human gene N-ACYLSPHINGOSINE AMIDOHYDROLASE (ASAH; OMIM:228000), which when mutated leads to Farber lipogranulomatosis.
21col-184F15A2.1n/achrX 13,469,888C. elegans COL-184 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005404 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3.3), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
22sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
23tag-68F37D6.6n/achrI 10,503,512C. elegans TAG-68 protein; contains similarity to Pfam domains PF03166 (MH2 domain) , PF03165 (MH1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR013019 (MAD homology, MH1), IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001132 (SMAD domain, Dwarfin-type), IPR017855 (SMAD domain-like), IPR013790 (Dwarfin), IPR003619 (MAD homology 1, Dwarfin-type)
24R13H4.6R13H4.6n/achrV 11,864,309contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Putative protease La homolog type (EC 3.4.21.-).; SW:O29883
25srbc-29C02A12.2n/achrV 3,470,161C. elegans SRBC-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26W09C3.7W09C3.7n/achrI 4,714,903
27W02D9.5W02D9.5n/achrI 12,561,291contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
28ZC443.1ZC443.1n/achrV 12,809,256contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
29F32D1.2F32D1.2n/achrV 4,346,245contains similarity to Pfam domain PF04627 Mitochondrial ATP synthase epsilon chain contains similarity to Interpro domain IPR006721 (ATPase, F1 complex, epsilon subunit, mitochondrial)
30C46A5.6C46A5.6n/achrIV 7,761,969
31F26E4.2F26E4.2n/achrI 9,759,327contains similarity to Pasteurella haemolytica HSDR.; TR:P95512
32W06D4.4W06D4.4n/achrI 9,061,846contains similarity to Interpro domain IPR014644 (Protein arginine N-methyltransferase)
33sru-17T04A11.10n/achrIV 12,506,509C. elegans SRU-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
34clec-60ZK666.6n/achrII 10,480,905clec-60 encodes a C-type lectin protein with no obvious non-nematode orthologs required for normal resistance to infection with Microbacterium nematophilum; clec-60 transcription is induced 6.6-fold by infection with M. nematophilum, making it one of the most strongly infection-responsive genes (second only to tts-1), while not being induced by other pathogens; CLEC-60 is expressed throughout the larval intestine, continuing adult expression primarily in the posterior intestinal cells int8 and int9; CLEC-60 contains an N-terminal von Willebrand factor type A domain and a C-terminal C-type lectin domain; CLEC-60 has no obvious function in mass RNAi assays, and is dispensable for viability.
35Y6E2A.5Y6E2A.5n/achrV 15,717,512contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
36duo-1F38B7.5n/achrV 11,556,440C. elegans DUO-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF02338 (OTU-like cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003323 (Ovarian tumour, otubain), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
37col-179C34F6.3n/achrX 11,201,934C. elegans COL-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000596 (Cholecystokinin receptor, type A), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
38col-119C53B4.5n/achrIV 8,979,295C. elegans COL-119 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
39T10B11.2T10B11.2n/achrI 6,934,027contains similarity to Pfam domain PF00781 Diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed) contains similarity to Interpro domain IPR001206 (Diacylglycerol kinase, catalytic region)
40C28C12.2C28C12.2n/achrIV 8,499,682
41srd-26T02B5.4n/achrV 14,162,174C. elegans SRD-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42srw-15C41G6.3n/achrV 15,231,194C. elegans SRW-15 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43C04F5.9C04F5.9n/achrV 5,116,964contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
44ZC190.2ZC190.2n/achrV 8,682,033contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
45wrt-7ZK1037.10n/achrV 15,336,119wrt-7 encodes a hedgehog-like protein, with (from N- to C-terminus) a signal sequence, a Wart domain, and a Hint/Hog domain; the Hint/Hog domain is predicted to cut WRT-7 into two halves and then covalently link cholesterol to the C-terminus of the Wart domain; the Wart domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; WRT-7 is required for normal growth to full size and locomotion; both of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
46C03D6.6C03D6.6n/achrI 9,657,459contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Involved in cell cycle control and ion homeostasis; SGD:YKR072C
47skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
48clec-13H16D19.1n/achrI 12,635,846C. elegans CLEC-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49ZC178.2ZC178.2n/achrV 8,707,635contains similarity to Pfam domain PF05647 C. elegans protein of unknown function (DUF801) contains similarity to Interpro domain IPR008519 (Protein of unknown function DUF801, Caenorhabditis elegans)
50C13G5.2C13G5.2n/achrIII 8,617,549contains similarity to Interpro domain IPR001680 (WD40 repeat)