UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-113Y68A4A.70chrV 17,213,595C. elegans SRH-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3srd-74C24H11.4n/achrIII 11,782,974C. elegans SRD-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4srh-48C06C3.63e-26chrII 9,384,056C. elegans SRH-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5tag-263C11E4.3n/achrX 9,590,518C. elegans TAG-263 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
6str-74C14H10.4n/achrX 10,240,354C. elegans STR-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7srh-243F37B4.31e-16chrV 2,871,265C. elegans SRH-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8cdc-48.3K04G2.3n/achrI 8,034,273C. elegans CDC-48.3 protein; contains similarity to Pfam domains PF07726 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) , PF00004 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) , PF07728 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR011704 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-5), IPR011703 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-3), IPR003960 (AAA ATPase, conserved site), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
9F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
10F44G3.10F44G3.10n/achrV 16,139,209F44G3.10 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; F44G3.10 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; F44G3.10 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
11F56D2.5F56D2.5n/achrIII 5,579,782contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF01485 (IBR domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
12C08B6.10C08B6.10n/achrV 10,126,265contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
13srh-38C31B8.11n/achrV 2,921,646C. elegans SRH-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14ugt-37F10D2.6n/achrV 7,143,012C. elegans UGT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
15srg-44F31E9.2n/achrV 17,329,671C. elegans SRG-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
16R09D1.3R09D1.3n/achrII 9,439,305contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
17ncx-6C07A9.4n/achrIII 9,712,021ncx-6 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-7/-10; NCX-6 may function intracellularly; NCX-6 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
18F17C11.6F17C11.6n/achrV 10,955,512contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9ZT77
19T22C8.1T22C8.1n/achrII 8,613,779contains similarity to Rattus norvegicus Cysteinyl leukotriene receptor 2 (CysLTR2) (RSBPT32).; SW:CLT2_RAT
20srz-96Y68A4A.6n/achrV 17,200,545C. elegans SRZ-96 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000418 (Ets)
21coq-1C24A11.9n/achrI 5,414,239coq-1 encodes a putative hexaprenyl pyrophosphate synthetase, orthologous to S. cerevisiae COQ1; COQ-1 is required for ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis and for normally short lifespan; coq-1 mutants have slowed pharyngeal pumping, and eventually arrest as paralysed larvae before dying; coq-1(RNAi) animals have reduced levels of coenzyme Q9 and superoxide, and have abnormally long lifespans; coq-1 mutants are not rescued by dietary coenzyme Q.
22R07E5.5R07E5.5n/achrIII 4,398,025contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
23K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
24R119.5R119.5n/achrI 391,462contains similarity to Pfam domain PF01135 Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT) contains similarity to Interpro domain IPR000682 (Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)
25C18A11.4C18A11.4n/achrX 8,046,427contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)
26math-16C16C4.8n/achrII 1,878,171C. elegans MATH-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
27F39F10.2F39F10.2n/achrX 16,895,317contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28ZK856.11ZK856.11n/achrV 10,204,273contains similarity to Pfam domain PF01176 Translation initiation factor 1A / IF-1 contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR006196 (S1, IF1 type), IPR001253 (Eukaryotic initiation factor 1A (eIF-1A))
29C56A3.4C56A3.4n/achrV 13,551,128contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
30C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
31glb-9C28F5.2n/achrII 7,510,599glb-9 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
32W03D2.9W03D2.9n/achrIV 4,074,075contains similarity to Interpro domain IPR009151 (Basigin)
33fbxa-203W05F2.5n/achrI 3,372,801This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
34F19G12.3F19G12.3n/achrX 1,425,941contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
35Y63D3A.8Y63D3A.8n/achrI 14,116,402contains similarity to Interpro domains IPR002114 (Phosphotransferase system, HPr serine phosphorylation site), IPR006634 (TRAM, LAG1 and CLN8 homology)
36H14E04.3H14E04.3n/achrIII 2,385,751
37T10E9.5T10E9.5n/achrI 6,522,462
38F58A3.4F58A3.4n/achrX 11,010,149contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39srt-62T27C10.2n/achrI 10,900,411C. elegans SRT-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
40C33C12.9C33C12.9n/achrII 2,188,303contains similarity to Pfam domain PF05175 Methyltransferase small domain contains similarity to Interpro domains IPR007848 (Methyltransferase small), IPR004557 (Putative methylase), IPR002296 (N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
41srh-11R09F10.6n/achrX 8,318,283C. elegans SRH-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42ZC373.4ZC373.4n/achrX 10,066,060contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43dylt-3T05C12.5n/achrII 8,181,777dylt-3 encodes a putative dynein light chain subunit paralogous to DYLT-3, and orthologous to human DYNLT1 and DYNLT3 (OMIM: 300302); unlike its paralog DYLT-1, DYLT-3 does not obviously inhibit DHC-1 in vivo.
44W06B3.1W06B3.1n/achrX 12,015,209contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR004821 (Cytidyltransferase-related), IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
45R52.4R52.4n/achrII 2,107,797
46C41D11.3C41D11.3n/achrI 4,430,732contains similarity to Interpro domain IPR001041 (Ferredoxin)
47C26C6.8C26C6.8n/achrI 7,504,574contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) (3), PF00018 (SH3 domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR011511 (Variant SH3)
48srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
49srh-71T10D4.59e-32chrII 3,124,197C. elegans SRH-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50K02F6.6K02F6.6n/achrII 2,530,385contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)