UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1srz-47Y68A4A.22.0000000000000002e-157chrV 17,191,554C. elegans SRZ-47 protein ;
2Y62H9A.7Y62H9A.7n/achrX 11,885,307contains similarity to Mus musculus Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterases1A (EC 3.1.4.17) (Cam-PDE 1A) (61 kDa Cam-PDE).; SW:CN1A_MOUSE
3B0462.1B0462.1n/achrV 18,326,871contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
4Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
5sra-8AH6.12n/achrII 9,538,328C. elegans SRA-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
6srw-76W06G6.6n/achrV 16,637,565C. elegans SRW-76 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
7nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
8srx-68K07C6.11n/achrV 3,913,635C. elegans SRX-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9cyp-25A5F42A6.4n/achrIV 3,328,559C. elegans CYP-25A5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
10C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
11Y51B9A.6Y51B9A.6n/achrII 9,401,875contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
12gpa-13F18E2.5n/achrV 12,753,806gpa-13 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADF, ASH, AWC, PHA, and PHB.
13C11H1.2C11H1.2n/achrX 14,306,277contains similarity to Interpro domain IPR015672 (G-protein coupled receptor 89-related)
14W10G11.4W10G11.4n/achrII 3,563,054contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
15C14A11.6C14A11.6n/achrX 2,812,319
16F10E7.2F10E7.2n/achrII 7,123,253contains similarity to Schistocerca gregaria Homeobox protein abdominal-A homolog (Fragment).; SW:P29556
17C32B5.3C32B5.3n/achrII 981,863
18F15D3.9F15D3.9n/achrI 11,558,305
19ifta-1C54G7.4n/achrX 5,549,123C. elegans IFTA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR017233 (WD repeat protein 35), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
20nhr-126F44C8.10n/achrV 2,230,032nhr-126 encodes a member of the nuclear hormone receptor family.
21EGAP2.2EGAP2.2n/achrII 5,230,269
22F59B1.6F59B1.6n/achrV 3,630,559contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23K03D7.9K03D7.9n/achrV 17,488,056contains similarity to Homo sapiens Olfactory receptor 1A1; ENSEMBL:ENSP00000305207
24F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
25T21H8.5T21H8.5n/achrX 13,878,684contains similarity to Interpro domain IPR000515 (Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component)
26srt-68B0238.3n/achrV 5,251,344C. elegans SRT-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27C17B7.10C17B7.10n/achrV 3,341,460C17B7.10 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.10 has no clear orthologs in other organisms.
28F16G10.4F16G10.4n/achrII 2,369,673contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002371 (Flagellar hook-associated protein)
29lgc-7Y57G11C.2n/achrIV 14,712,127C. elegans LGC-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
30F21G4.4F21G4.4n/achrX 9,898,328contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
31T28C6.7T28C6.7n/achrIV 8,828,801contains similarity to Interpro domain IPR009055 (UvrB, C-terminal UvrC-binding)
32B0495.6B0495.6n/achrII 7,698,778contains similarity to Pfam domain PF07189 Splicing factor 3B subunit 10 (SF3b10) contains similarity to Interpro domain IPR009846 (Splicing factor 3B subunit 5/RDS3 complex subunit 10)
33srj-29F22B8.1n/achrV 16,076,456C. elegans SRJ-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00060 (Ligand-gated ion channel) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) contains similarity to Interpro domains IPR001638 (Bacterial extracellular solute-binding protein, family 3), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001320 (Ionotropic glutamate receptor), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR001508 (NMDA receptor)
34ZC53.4ZC53.4n/achrX 1,931,714contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227Y0
35srw-136K12D9.10n/achrV 3,009,736C. elegans SRW-136 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36sre-33W05H5.6n/achrII 12,453,974C. elegans SRE-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
37C54G4.4C54G4.4n/achrI 7,999,947contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR006585 (Fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016060 (Complement control module), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38R07A4.2R07A4.2n/achrX 10,745,349contains similarity to Rhodopirellula baltica Probable serine/threonine-protein kinase pknB (EC 2.7.1.-).; TR:Q7UFE6
39sra-7AH6.11n/achrII 9,545,368C. elegans SRA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
40srh-99C46E10.7n/achrII 3,715,771C. elegans SRH-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F46B3.15F46B3.15n/achrV 20,628,725contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
42C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43M02B1.2M02B1.2n/achrIV 12,846,951contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV233 hypothetical protein.; TR:Q9YVK8
44T23F6.2T23F6.2n/achrIV 12,722,330
45fut-2EGAP9.2n/achrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
46srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
47B0348.1B0348.1n/achrV 49,270contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
48R04B5.7R04B5.7n/achrV 10,089,830contains similarity to Rattus norvegicus Protein tyrosine phosphatase TD14.; TR:O88902
49clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
50srj-44T03D3.11n/achrV 2,845,216C. elegans SRJ-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)