UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxb-101Y63D3A.30chrI 14,088,963C. elegans FBXB-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
4Y48E1B.11Y48E1B.11n/achrII 13,596,085
5R03A10.1R03A10.1n/achrX 15,430,484contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in transcription-coupled repair nucleotide exicision repair of UV-induced DNA lesions; homolog of human CSB protein; SGD:YJR035W
6coh-1K08A8.3n/achrX 7,470,222coh-1 encodes a RAD21 homolog that affects embryonic viability and is believed to affect cohesion of sister chromatids in somatic cells; expressed in the distal tip cells of the gonad, embryonic, and somatic cells
7T05B4.9T05B4.9n/achrV 4,117,993contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
8F47G4.6F47G4.6n/achrI 14,060,105contains similarity to Pfam domain PF00505 HMG (high mobility group) box contains similarity to Interpro domains IPR000910 (High mobility group box, HMG1/HMG2), IPR009071 (High mobility group box, HMG)
9C35A11.3C35A11.3n/achrV 5,374,943contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MUC5AC (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000371671
10B0207.2B0207.2n/achrI 5,955,959
11F28B3.4F28B3.4n/achrI 4,937,314contains similarity to Pfam domain PF06464 DMAP1-binding Domain contains similarity to Interpro domains IPR010506 (DMAP1-binding), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
12C16D9.3C16D9.3n/achrV 8,239,232
13ZK1053.1ZK1053.1n/achrI 13,229,159contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
14ZK1240.8ZK1240.8n/achrII 2,328,024contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
15F46B3.2F46B3.2n/achrV 20,594,388contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
16Y44A6B.3Y44A6B.3n/achrV 20,633,182contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
17F08B4.4F08B4.4n/achrIV 8,679,036
18C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
19fkh-8F40H3.4n/achrII 6,190,440fkh-8 encodes one of 15 C. elegans forkhead transcription factors; loss of fkh-8 activity via RNAi has been reported to result in either no defects or a weakly penetrant aldicarb resistance phenotype; an FKH-8 reporter fusion is expressed in nerve cells in the head and tail ganglia of both males and hermaphrodites with expression beginning in the later stages of embryogenesis and continuing through adulthood.
20srw-124C44C3.1n/achrV 2,977,215C. elegans SRW-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21K12H6.7K12H6.7n/achrII 2,835,833
22nlp-22T24D8.3n/achrX 2,341,705C. elegans NLP-22 protein ;
23jkk-1F35C8.3n/achrX 5,370,204jkk-1 encodes a member of the MAP kinase kinase superfamily that affects synaptic vesicle localization and is required in type-D motor neurons for normal locomotion; can function in the Hog1 MAP kinase pathway I in yeast as an activator of JNK and is expressed in most neurons
24C43H6.3C43H6.3n/achrX 2,408,512contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
25R52.4R52.4n/achrII 2,107,797
26C05E11.3C05E11.3n/achrX 4,580,554contains similarity to Mus musculus Lysosomal-associated transmembrane protein 4A (Golgi 4-transmembranesspanning transporter) (Mouse transporter protein) (MTP).; SW:Q60961
27C24A3.8C24A3.8n/achrX 9,006,620
28srb-16F58A6.6n/achrII 5,149,697C. elegans SRB-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
29C10A4.3C10A4.3n/achrX 7,408,027
30F25D1.2F25D1.2n/achrV 10,531,704contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
31F30B5.7F30B5.7n/achrIV 4,230,520contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
32clec-20T07H3.5n/achrII 1,594,363C. elegans CLEC-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
33sdz-19F45E6.6n/achrX 12,502,884C. elegans SDZ-19 protein ;
34M28.4M28.4n/achrII 10,645,246contains similarity to Homo sapiens Kinesin-like protein 2; ENSEMBL:ENSP00000324020
35C08H9.11C08H9.11n/achrII 9,858,792contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
36srb-2C27D6.9n/achrII 5,168,699C. elegans SRB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
37C25B8.5C25B8.5n/achrX 6,633,438contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38R07C3.14R07C3.14n/achrII 929,840
39hlh-17F38C2.2n/achrIV 16,255,479C. elegans HLH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
40R08C7.1R08C7.1n/achrIV 4,451,940
41C03H5.4C03H5.4n/achrII 375,541contains similarity to Pfam domain PF00068 Phospholipase A2 contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR001211 (Phospholipase A2, eukaryotic), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
42hlh-27C17C3.10n/achrII 5,540,531C. elegans HLH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
43fbxb-19F58E1.90.00000000000001chrII 1,688,706This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
44srh-60W10G11.9n/achrII 3,585,242C. elegans SRH-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45F58G1.7F58G1.7n/achrII 12,945,904contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
46T10B5.4T10B5.4n/achrV 1,871,195contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
47F21H7.3F21H7.3n/achrV 16,232,966contains similarity to Rickettsia conorii Hypothetical protein RC0540.; TR:Q92I80
48dyf-8C43C3.3n/achrX 9,700,112dyf-8 encodes a protein predicted to form a cell-surface ligand with a zona pellucida domain; DYF-8 is required for permeability of amphid and phasmid neurons to external dyes, chemotaxis to ammonium chloride, avoidance of high osmotic stimuli, male mating, and dauer formation.
49clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50T15B7.14T15B7.14n/achrV 6,833,799