UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y5F2A.3Y5F2A.32.9999999999999996e-104chrIV 11,069,794contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
2C45G3.4C45G3.4n/achrI 9,219,134contains similarity to Dictyostelium discoideum Prespore-specific protein (Fragment).; TR:O97140
3F53F4.1F53F4.1n/achrV 13,585,118contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
4srd-39R04D3.8n/achrX 13,299,680C. elegans SRD-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5C41G6.12C41G6.12n/achrV 15,207,410contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
6C17B7.12C17B7.12n/achrV 3,353,590
7F46F5.15F46F5.15n/achrII 788,813
8F25E2.1F25E2.1n/achrX 803,494contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9srw-86C25F9.7n/achrV 19,400,392C. elegans SRW-86 protein ;
10srw-10ZC482.6n/achrIII 12,755,860C. elegans SRW-10 protein ;
11C49F5.5C49F5.5n/achrX 11,986,477contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
12srh-102F40D4.11n/achrV 17,164,173C. elegans SRH-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13B0336.12B0336.12n/achrIII 5,710,236
14C17B7.8C17B7.8n/achrV 3,322,428C17B7.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.8 has no clear orthologs in other organisms.
15C56G7.2C56G7.2n/achrIII 3,387,880This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
16srz-6T21B4.1n/achrII 12,492,894C. elegans SRZ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
17T20D4.16T20D4.16n/achrV 3,394,536
18C23G10.10C23G10.10n/achrIII 6,213,461
19F35F10.13F35F10.13n/achrV 3,318,633contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
20srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C12D5.4C12D5.4n/achrV 7,672,548
22C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
23F46B3.8F46B3.8n/achrV 20,618,293contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
24fbxa-195R09B5.1n/achrV 1,435,696This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
25B0207.10B0207.10n/achrI 5,959,278
26B0546.5B0546.5n/achrIV 3,389,078contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domain IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
27ZC239.13ZC239.13n/achrII 3,222,611contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
28F11A5.7F11A5.7n/achrV 16,205,976contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29C46E10.2C46E10.2n/achrII 3,723,631
30R04E5.7R04E5.7n/achrX 8,797,318
31srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C03A7.13C03A7.13n/achrV 5,191,814contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
33math-31F52C6.6n/achrII 1,912,654C. elegans MATH-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
34srh-19F19G12.5n/achrX 1,414,840C. elegans SRH-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35M162.6M162.6n/achrV 19,782,521contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
36C24G7.4C24G7.4n/achrI 4,096,469contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
37sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
38F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39ZC487.2ZC487.2n/achrV 6,721,684
40ceh-28K03A11.3n/achrX 13,075,231A homeobox protein of the NK-2 family; it is expressed in a single pharyngeal neuron, M4.
41C04B4.6C04B4.6n/achrX 12,275,348contains similarity to Corynebacterium efficiens Putative alanyl-tRNA synthetase.; TR:Q8FT23
42C50E3.9C50E3.9n/achrV 7,599,821contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
43Y32B12A.1Y32B12A.1n/achrV 16,488,780contains similarity to Pfam domain PF00569 Zinc finger, ZZ type contains similarity to Interpro domain IPR000433 (Zinc finger, ZZ-type)
44T28A11.6T28A11.6n/achrV 3,262,901
45R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
46srw-47K10G4.2n/achrV 17,261,345C. elegans SRW-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47nhr-158C17E7.6n/achrV 3,872,180C. elegans NHR-158 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48str-92F59A1.3n/achrV 17,675,766C. elegans STR-92 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49srw-91K04F1.4n/achrV 1,680,088C. elegans SRW-91 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50Y37E11B.7Y37E11B.7n/achrIV 3,599,789