UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sre-41Y57A10B.51e-178chrII 12,388,981C. elegans SRE-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
2twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
3F41D9.1F41D9.1n/achrX 8,380,568contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR001452 (Src homology-3), IPR004012 (RUN), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
4fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
5srw-43F14F8.5n/achrV 16,686,204C. elegans SRW-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
6srbc-54F54B8.11n/achrV 15,833,053C. elegans SRBC-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7Y62H9A.9Y62H9A.9n/achrX 11,896,785contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I659
8srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;
9clec-140T05A7.2n/achrII 4,675,089C. elegans CLEC-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
10F32D8.1F32D8.1n/achrV 10,882,070contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
11srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
14srw-84Y43F8A.4n/achrV 19,382,978C. elegans SRW-84 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
15nas-10K09C8.3n/achrX 10,962,779nas-10 encodes an astacin-like metalloprotease.
16sra-20F28C12.4n/achrI 12,697,375C. elegans SRA-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
17srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18lgc-32T19D7.1n/achrX 674,438C. elegans LGC-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
19nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
20C31B8.9C31B8.9n/achrV 2,912,083contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
21C45E5.2C45E5.2n/achrIV 5,742,716contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
22srt-37F47D2.8n/achrV 4,280,809C. elegans SRT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
23math-17C16C4.9n/achrII 1,880,205C. elegans MATH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
24C50H2.6C50H2.6n/achrV 9,921,737contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
25sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
27F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
28ncx-5Y32F6B.2n/achrV 10,488,232ncx-5 encodes a putative 4Na[+]/1Ca[2+],1K[+] exchanger, orthologous to human SLC24A1-5 and paralogous to NCX-4; NCX-5 is predicted to export free cytoplasmic Ca[2+] with low affinity but high capacity, being complemented by low-capacity/high-affinity Ca[2+] ATPase pumps such as MCA-1/-3; NCX-5 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-5 has no obvious function in mass RNAi assays.
29srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31AH9.4AH9.4n/achrX 2,272,675contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
32F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
33H14A12.5H14A12.5n/achrIII 7,467,767
34nhr-208R07B7.15n/achrV 12,095,111C. elegans NHR-208 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35F23A7.3F23A7.3n/achrX 16,221,101contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Endocytosis protein end4 (SLA2 protein homolog).; SW:Q9P6L5
36F52D2.5F52D2.5n/achrX 1,974,154
37W06G6.2W06G6.2n/achrV 16,629,439contains similarity to Bombyx mori Hunchback protein (Fragment).; SW:HUNB_BOMMO
38srg-62C24B9.12n/achrV 2,741,420C. elegans SRG-62 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
39K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
40B0496.5B0496.5n/achrIV 7,421,847contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41B0564.9B0564.9n/achrIV 13,137,002contains similarity to Pfam domains PF00560 (Leucine Rich Repeat) , PF07723 (Leucine Rich Repeat) contains similarity to Interpro domain IPR006553 (Leucine-rich repeat, cysteine-containing subtype)
42sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43T05C1.1T05C1.1n/achrII 4,479,688
44F21C10.1F21C10.1n/achrV 9,132,804contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
45sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
46srh-214T20B3.4n/achrV 16,828,966C. elegans SRH-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srx-32R13D11.9n/achrV 820,140C. elegans SRX-32 protein ;
48glt-4T22E5.2n/achrX 6,405,125glt-4 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
49C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
50F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)