UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y52B11A.10Y52B11A.100chrI 11,045,757contains similarity to Pfam domains PF02854 (MIF4G domain) , PF02847 (MA3 domain) contains similarity to Interpro domains IPR003890 (MIF4G-like, type 3), IPR016021 (MIF4-like, type 1/2/3), IPR003891 (Initiation factor eIF-4 gamma, MA3), IPR016024 (Armadillo-type fold)
2F22F7.2F22F7.2n/achrV 2,125,082contains similarity to Pfam domain PF03435 Saccharopine dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR005097 (Saccharopine dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
3sra-29F18C5.8n/achrII 6,575,011C. elegans SRA-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
4C28G1.4C28G1.4n/achrX 8,851,319contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
5C05A9.3C05A9.3n/achrX 10,830,625contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
6M28.2M28.2n/achrII 10,636,216contains similarity to Phytophthora infestans NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L (EC 1.6.5.3).; SW:NULM_PHYIN
7F40G9.1F40G9.1n/achrIII 196,177contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
8srsx-8F52F10.5n/achrV 1,552,074C. elegans SRSX-8 protein ;
9nhr-179F16B4.11n/achrV 1,616,853C. elegans NHR-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10F47E1.1F47E1.1n/achrX 9,075,645
11T26C5.4T26C5.4n/achrII 9,249,704contains similarity to Encephalitozoon cuniculi SER/THR protein phosphatase 2-A (EC 3.1.3.16) (Serine/threoninesprotein phosphatase).; TR:Q8SS50
12Y45G12C.6Y45G12C.6n/achrV 2,541,544contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13K04G11.1K04G11.1n/achrX 14,335,998contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
14D2023.6D2023.6n/achrV 11,828,318D2023.6 is orthologous to a set of uncharacterized putative protein kinases from eukaryotes and from prokaryotes (e.g., UbiB from E. coli), and paralogous to COQ-8 from C. elegans and ABC1 (COQ8) from S. cerevisiae; like COQ-8, D2023.6 may be involved in ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis.
15srh-77DC2.6n/achrV 224,988C. elegans SRH-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16R53.2R53.2n/achrII 9,964,971contains similarity to Pfam domain PF02223 Thymidylate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000062 (Thymidylate kinase)
17cul-5ZK856.1n/achrV 10,181,305cul-5 encodes a cullin, orthologous to vasopressin-activated calcium-mobilizing receptor-1 in mammals, that is thought to regulate the cell cycle by virtue of its paralogy to cul-1 and cul-2; however, CUL-5 is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens, and does not appear to interact with any of 17 Skp1-related proteins (SKR-1 through SKR-21).
18K06A4.4K06A4.4n/achrV 9,502,894contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
19sptf-3Y40B1A.4n/achrI 13,362,400C. elegans SPTF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
20C26B2.8C26B2.8n/achrIV 8,014,864contains similarity to Interpro domains IPR008914 (Phosphatidylethanolamine-binding protein PEBP), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
21ddl-2Y48E1B.1n/achrII 13,545,140C. elegans DDL-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
22fbxa-200T07D3.1n/achrII 905,248C. elegans FBXA-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
23D1053.4D1053.4n/achrX 11,722,796contains similarity to Naja kaouthia Cytotoxin 5 (Cytotoxin II).; SW:CX5_NAJKA
24C50F2.2C50F2.2n/achrI 3,885,072contains similarity to Interpro domain IPR002951 (Atrophin)
25EEED8.6EEED8.6n/achrII 5,385,733EEED8.6 encodes an ATP/ADP-activated metallocarboxypeptidase, orthologous to mammalian AGBL4 proteins, that may function in vivo as an alpha-tubulin C-terminal tyrosine carboxypeptidase; recombinant EEED8.6 is active in vitro on several different C-terminal amino acids of synthetic peptide substrates (with carboxypeptidase A- and B-like, but not O-like specificity); unlike most carboxypeptidases, but like tubulin carboxypeptidase, EEED8.6 is inhibited by high salt or by Z-Glu-Tyr dipeptide; EEED8.6 and its mammalian AGBL4 orthologs, along with other proteins such as mammalian AGBL5, comprise a M14D2 peptidase subfamily; by homolog-based structural modelling, EEED8.6 is predicted to have an unusually open active site.
26F09G8.5F09G8.5n/achrIII 8,256,200contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR010916 (TonB box, conserved site)
27B0334.6B0334.6n/achrII 11,512,193contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28C44E4.5C44E4.5n/achrI 4,607,929contains similarity to Pfam domain PF04969 CS domain contains similarity to Interpro domains IPR008978 (HSP20-like chaperone), IPR017447 (CS), IPR007052 (CS domain)
29str-78Y40H7A.1n/achrIV 15,145,449C. elegans STR-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30T14G10.8T14G10.8n/achrIV 10,146,609contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P08235 Mineralocorticoid receptor; ENSEMBL:ENSP00000281330
31F31F4.1F31F4.1n/achrV 685,113contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
32F48C1.4F48C1.4n/achrI 5,313,536
33math-21C40D2.3n/achrII 1,994,852C. elegans MATH-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
34M153.3M153.3n/achrX 12,143,295contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
35W08F4.10W08F4.10n/achrII 590,892contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
36Y75B12B.3Y75B12B.3n/achrV 15,186,069contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
37R148.2R148.2n/achrIII 3,184,321
38nas-8C34D4.9n/achrIV 7,117,415nas-8 encodes an astacin-like metalloprotease.
39nhr-271T03E6.3n/achrV 16,579,462C. elegans NHR-271 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
40F56B3.8F56B3.8n/achrIV 774,932contains similarity to Pfam domains PF00181 (Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain) , PF03947 (Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002171 (Ribosomal protein L2), IPR008991 (Translation protein SH3-like), IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR014722 (Translation protein SH3-like, subgroup)
41sdz-15F23F12.4n/achrIII 6,499,273This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
42F58F6.3F58F6.3n/achrIV 1,375,965
43glb-10C29F5.7n/achrII 6,308,800glb-10 encodes a globin; glb-10 is expressed in pharynx, intestine, vulval muscle, and many neurons, with at least some subcellular localization to synapses; however, glb-10 has no obvious function in mass RNAi assays.
44srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45prx-6F39G3.7n/achrV 4,717,742C. elegans PRX-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal)
46F53F8.1F53F8.1n/achrV 20,682,534The F53F8.1 gene encodes a homolog of human WT1, which when mutated leads to Wilms tumour (OMIM:194070).
47C03F11.2C03F11.2n/achrX 5,395,712contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
48K09B11.3K09B11.3n/achrIV 13,430,380contains similarity to Homo sapiens DJ614O4.3; ENSEMBL:ENSP00000305301
49Y52B11A.9Y52B11A.9n/achrI 11,036,452contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR005824 (KOW), IPR002358 (Ribosomal protein L6, conserved site-1), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
50srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)