UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y51B9A.9Y51B9A.90chrII 9,396,480contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR008351 (JNK MAP kinase), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3hgo-1W06D4.1n/achrI 9,052,445hgo-1 encodes a putative homogentisate 1,2-dioxygenase, orthologous to human HGD (OMIM:607474, mutated in alkaptonuria), that is required for normal resistance to hypertonic stress; HGO-1 is expressed in larval and adult hypodermis and intestine, and in larval pharynx; HGO-1 is required for the tyrosinemic phenotype of K10C2.4(RNAi) animals.
4ttr-24Y51A2D.9n/achrV 18,555,981C. elegans TTR-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
5K02F3.9K02F3.9n/achrIII 840,905
6rlbp-1T23G11.5n/achrI 7,688,763C. elegans RLBP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00620 RhoGAP domain contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
7ZC196.1ZC196.1n/achrV 8,744,495
8Y2H9A.4Y2H9A.4n/achrV 13,447,397contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR007883 (Protein of unknown function DUF713), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
9nhr-19E02H1.7n/achrII 9,601,747C. elegans NHR-19 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10glc-1F11A5.10n/achrV 16,220,736glc-1 encodes the alpha subunit of a glutamate-gated chloride channel and forms a functional channel in Xenopus oocytes; mutations genetically interact with avr-14 and avr-15 mutations such that triple mutants exhibit high level resistance to ivermectin.
11snb-2F23H12.1n/achrV 12,345,050C. elegans SNB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR016444 (Synaptobrevin, metazoa/fungi), IPR001388 (Synaptobrevin)
12tag-225K07C11.5n/achrV 8,202,146K07C11.5 is orthologous to the human gene SIMILAR TO TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE 3 (SORSBY FUNDUS DYSTROPHY, PSEUDOINFLAMMATORY) (TIMP3; OMIM:188826), which when mutated leads to disease.
13spp-8C28C12.5n/achrIV 8,482,669C. elegans SPP-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF03489 Saposin-like type B, region 2 contains similarity to Interpro domains IPR008138 (Saposin-like type B, 2), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
14F16G10.15F16G10.15n/achrII 2,406,470contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
15srg-55W09D12.2n/achrV 14,927,504C. elegans SRG-55 protein ;
16B0393.7B0393.7n/achrIII 4,777,124contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
17F35F10.5F35F10.5n/achrV 3,285,611
18col-85T21B4.2n/achrII 12,494,362C. elegans COL-85 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat), IPR013286 (Annexin, type VII)
19K08D8.1K08D8.1n/achrIV 12,893,458contains similarity to Fusobacterium nucleatum Tryptophanase (EC 4.1.99.1).; TR:Q8RHQ6
20srx-128F55B12.7n/achrV 13,838,056C. elegans SRX-128 protein ;
21magi-1K01A6.2n/achrIV 11,721,610C. elegans MAGI-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) (4), PF00397 (WW domain) (2), PF00625 (Guanylate kinase) contains similarity to Interpro domains IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR002349 (WW), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
22pqn-92Y75B8A.27n/achrIII 12,309,726The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
23zig-2F42F12.2n/achrX 12,340,922zig-2 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-2::gfp reporter fusion is expressed in the PVT interneuron and weakly in 4-6 additional head neurons.
24T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
25T08D2.6T08D2.6n/achrX 180,977contains similarity to Homo sapiens Protein YIPF4; ENSEMBL:ENSP00000238831
26clec-15T07D10.4n/achrI 12,631,859C. elegans CLEC-15 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27Y66H1A.5Y66H1A.5n/achrIV 428,660
28T04A11.5T04A11.5n/achrIV 12,485,693contains similarity to Pfam domain PF02567 Phenazine biosynthesis-like protein contains similarity to Interpro domain IPR003719 (Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein)
29hex-1T14F9.3n/achrX 2,225,047hex-1 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase that is orthologous to the human gene CERVICAL CANCER PROTO-ONCOGENE 7 (HEXB; OMIM:606873), which when mutated leads to disease.
30mxl-3F46G10.6n/achrX 13,350,149C. elegans MXL-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding), IPR002418 (Transcription regulator Myc)
31F27E5.1F27E5.1n/achrII 10,140,416contains similarity to Pfam domain PF02275 Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR003199 (Choloylglycine hydrolase), IPR016699 (Acid ceramidase-like)
32C54D10.9C54D10.9n/achrV 12,448,057contains similarity to Interpro domain IPR001904 (Paxillin)
33col-44F54B11.2n/achrX 13,591,900col-44 encodes a cuticle collagen.
34ZC239.13ZC239.13n/achrII 3,222,611contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
35B0507.5B0507.5n/achrV 8,754,261
36C17B7.12C17B7.12n/achrV 3,353,590
37spp-1T07C4.4n/achrIII 10,355,287spp-1 encodes a predicted transmembrane protein containing a saposin (B) domain that is a member of a saposin-like protein superfamily containing mammalian NK-lysin and granulysin and the protozoan amoebapores; SPP-1 is predicted to function as a lipid-binding protein with cytotoxic, pore-forming activity, and in vitro, does exhibit antibacterial activity; loss of SPP-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not, however, result in any abnormalities.
38pah-1K08F8.4n/achrII 8,763,866pah-1 encodes a biochemically active phenylalanine-4-hydroxylase orthologous to human PAH (OMIM:261600, mutated in phenylketonuria); recombinant PAH-1 has hydroxylase activity on phenylalanine and tryptophan substrates in vitro; pah-1 is expressed in seam cells, tail hypodermal cells, and ventral hypodermis, with stronger posterior than anterior expression; PAH-1 might help provide tyrosine for cross-linking in the cuticle, and is partially required for the tyrosinemic phenotype of K10C2.4(RNAi) animals.
39K07A9.3K07A9.3n/achrIV 1,835,383contains similarity to Interpro domain IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
40C08B6.5C08B6.5n/achrV 10,118,697contains similarity to Danio rerio Glutamate receptor delta-2 subunit precursor (GluR delta-2).; SW:Q68Y21
41ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
42srp-6C03G6.19n/achrV 7,385,156srp-6 encodes a functional serpin (serine protease inhibitor)
43C55H1.1C55H1.1n/achrV 6,851,202contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
44W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
45F15B9.6F15B9.6n/achrV 13,015,372contains similarity to Interpro domain IPR001211 (Phospholipase A2)
46tag-244C34H4.3n/achrIV 1,551,970C. elegans TAG-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
47F58G4.3F58G4.3n/achrV 8,105,172contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
48cal-1C13C12.1n/achrV 12,515,481cal-1 encodes one of five predicted C. elegans calcium-binding calmodulin homologs (the others being CAL-2, CAL-3, CAL-4, and CMD-1); as loss of cal-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of CAL-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
49F54D12.5F54D12.5n/achrII 1,370,835contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
50ceh-28K03A11.3n/achrX 13,075,231A homeobox protein of the NK-2 family; it is expressed in a single pharyngeal neuron, M4.