UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y51A2B.1Y51A2B.18e-53chrV 18,373,264contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domains IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F13D12.3F13D12.3n/achrII 11,721,323contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
4T28H10.3T28H10.3n/achrV 12,513,961contains similarity to Pfam domain PF01650 Peptidase C13 family contains similarity to Interpro domain IPR001096 (Peptidase C13, legumain)
5far-3F15B9.1n/achrV 12,997,151C. elegans FAR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF05823 Nematode fatty acid retinoid binding protein (Gp-FAR-1) contains similarity to Interpro domain IPR008632 (Nematode fatty acid retinoid binding)
6T24F1.5T24F1.5n/achrII 11,319,376contains similarity to Bombyx mori Lebocin 1/2 precursor.; SW:LEB1_BOMMO
7F35F10.1F35F10.1n/achrV 3,317,203contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
8C08E8.4C08E8.4n/achrV 18,372,276contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domain IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464)
9C49H3.3C49H3.3n/achrIV 7,924,622contains similarity to Xenopus tropicalis UPF0446 protein C12orf31 homolog.; SW:Q6NVR5
10nlp-2T24D8.5n/achrX 2,344,350C. elegans NLP-2 protein ;
11C17H12.8C17H12.8n/achrIV 6,819,608contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
12C07A9.8C07A9.8n/achrIII 9,688,522contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
13fat-5W06D12.3n/achrV 17,725,852fat-5 encodes a delta-9 fatty acid desaturase that is predicted to be mitochondrial; when expressed heterologously in S. cerevisiae, FAT-5 rescues the fatty acid auxotrophy of the yeast delta-9 desaturase mutant ole1.
14F57H12.6F57H12.6n/achrIV 7,975,882contains similarity to Onchocerca volvulus OV39 antigen (Fragment).; SW:P31730
15C10G11.1C10G11.1n/achrI 6,307,930
16T28A11.5T28A11.5n/achrV 3,270,895contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
17R06B9.1R06B9.1n/achrII 13,764,398contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
18gst-22F21H7.1n/achrV 16,231,635C. elegans GST-22 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
19F45E1.4F45E1.4n/achrX 7,986,049
20btb-21F47C10.2n/achrV 3,850,930C. elegans BTB-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
21srw-120K12D9.5n/achrV 2,995,551C. elegans SRW-120 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
22bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
23F53A9.1F53A9.1n/achrX 8,711,652contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR002395 (HMW kininogen)
24thn-2F28D1.5n/achrIV 12,383,557C. elegans THN-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00314 Thaumatin family contains similarity to Interpro domain IPR001938 (Thaumatin, pathogenesis-related)
25F20B6.6F20B6.6n/achrX 4,201,908contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
26ZK666.8ZK666.8n/achrII 10,492,235contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
27F20D6.2F20D6.2n/achrV 8,186,659contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
28far-6W02A2.2n/achrIV 13,328,799C. elegans FAR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF05823 Nematode fatty acid retinoid binding protein (Gp-FAR-1) contains similarity to Interpro domain IPR008632 (Nematode fatty acid retinoid binding)
29C17B7.4C17B7.4n/achrV 3,339,687contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR003559 (Cytolethal distending toxin C), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
30ins-7ZK1251.2n/achrIV 9,682,219ins-7 encodes an insulin/IGF-1-like peptide; INS-7 is one of 40 insulin-like peptides in C. elegans; INS-7 likely functions as an agonist for the DAF-2 insulin/IGF-1 receptor, as loss of ins-7 activity via RNAi results in: 1) a significantly increased lifespan that is not further extended in long-lived daf-2 mutant animals, and 2) an increased frequency of dauer formation in animals containing an incompletely penetrant daf-2 mutation; an ins-7 promoter fusion is expressed in amphid sensory neurons, labial neurons, the nerve ring, and ventral cord and tail neurons; ins-7 expression is positively regulated by DAF-2-mediated insulin signaling, suggesting that a positive feedback loop involving INS-7 may amplify DAF-2 pathway activity.
31nlp-30B0213.5n/achrV 3,982,348nlp-30 encodes five predicted neuropeptide-like proteins; in C. elegans, nlp-30 is part of the YGGWamide neuropeptide family that also contains nlp-24, nlp-25, and nlp-27-32; nlp-30 is expressed in the hypodermis, suggesting that the peptides it encodes may have a non-neuronal function; as loss of nlp-30 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of the nlp-30-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
32ins-11C17C3.4n/achrII 5,556,897ins-11 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-11 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and is expressed in the labial sensory neurons, the nerve ring, and other neurons; although the precise role of INS-11 in C. elegans development is not yet clear, loss of INS-11 function via RNA-mediated interference can result in animals that are smaller than wild type (Sma).
33W02D7.4W02D7.4n/achrV 8,297,041contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
34fbxa-24F54D10.2n/achrII 3,817,370C. elegans FBXA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
35C42D4.1C42D4.1n/achrIV 7,189,738contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR002395 (HMW kininogen), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
36C08F11.3C08F11.3n/achrIV 13,620,866contains similarity to Homo sapiens HOR5'Beta8; ENSEMBL:ENSP00000332473
37ilys-3C45G7.3n/achrIV 2,464,939C. elegans ILYS-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
38K01A2.10K01A2.10n/achrII 322,278contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 92; ENSEMBL:ENSP00000238156
39T10B5.7T10B5.7n/achrV 1,847,108contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
40dhs-31T04B2.6n/achrIV 10,040,250C. elegans DHS-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
41F20D6.10F20D6.10n/achrV 8,193,961contains similarity to Homo sapiens Protein FAM133A; ENSEMBL:ENSP00000318974
42C35A5.4C35A5.4n/achrV 10,498,176contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein)
43ins-18T28B8.2n/achrI 8,148,533ins-18 encodes one of 40 C. elegans insulin/IGF-like peptides; INS-18, along with INS-1, are the only two C. elegans insulins that contain a C peptide, characteristic of mammalian insulins, connecting the B and A chains; overexpression of ins-18 induces dauer arrest at 26 degrees C and enhances the dauer arrest seen in a daf-2 mutant at 20 degrees C, suggesting that INS-18 functions to antagonize DAF-2 receptor signaling; ins-18::gfp reporters are expressed in neurons and the intestine.
44spp-1T07C4.4n/achrIII 10,355,287spp-1 encodes a predicted transmembrane protein containing a saposin (B) domain that is a member of a saposin-like protein superfamily containing mammalian NK-lysin and granulysin and the protozoan amoebapores; SPP-1 is predicted to function as a lipid-binding protein with cytotoxic, pore-forming activity, and in vitro, does exhibit antibacterial activity; loss of SPP-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not, however, result in any abnormalities.
45ttr-27R90.2n/achrV 12,903,803C. elegans TTR-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
46F07C3.9F07C3.9n/achrV 9,254,456
47F49H6.5F49H6.5n/achrV 17,024,380The F49H6.5 gene encodes a homolog of the human gene MOCS1A, which when mutated leads to molybdenum cofactor deficiency (OMIM:252150).
48F47B8.4F47B8.4n/achrV 14,324,002contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
49clec-79F47C12.4n/achrIV 3,974,525C. elegans CLEC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000538 (Link), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50fbxa-2T13F3.5n/achrV 16,268,911This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.