UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ace-3Y48B6A.80chrII 14,207,809ace-3 encodes one of four C. elegans acetylcholinesterases (AChE); ACE-3 represents ~5% of the total AChE activity in C. elegans and in vitro, hydrolyzes acetylthio-, butyrylthio-, and propionylthiocholine substrates with equal efficiency; although loss-of-function mutations in ace-3 result in no obvious defects, animals doubly mutant with ace-1 or ace-2 have slight defects in backward locomotion and animals triply mutant for ace-1, -2, and -3 arrest as unhatched, yet fully developed, embryos; ace-3 is the downstream gene in an operon with a fourth AChE-encoding gene, ace-4, and transcriptional reporter fusions with ace-4 upstream sequences direct expression in pharyngeal muscles pm3, 4, 5, and 7, the two CAN (canal associated neuron) cells, midbody dorsal body wall muscles in larvae, and several neurons in the head and anal ganglion
2Y113G7B.14Y113G7B.14n/achrV 20,223,220contains similarity to Pfam domains PF04851 (Type III restriction enzyme, res subunit) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006935 (Restriction endonuclease, type I, R subunit/Type III, Res subunit), IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal)
3H06O01.4H06O01.4n/achrI 7,003,489contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
4ugt-43F01D4.1n/achrIV 10,466,113C. elegans UGT-43 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
5fbxb-36F07E5.6n/achrII 2,061,815C. elegans FBXB-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
6F55H12.2F55H12.2n/achrI 8,868,112contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Tyrosine specific protein phosphatase)
7sri-66F28B1.6n/achrV 17,060,972C. elegans SRI-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
9tag-191C53A5.4n/achrV 14,535,355C. elegans TAG-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
10F16G10.5F16G10.5n/achrII 2,368,093
11ncl-1ZK112.2n/achrIII 7,734,657ncl-1 encodes a cytoplasmic B-box zinc finger protein that negatively regulates rRNA and 5S RNA transcription, nucleolus size, and body size; NCL-1 is orthologous to Drosophila BRAIN TUMOR (BRAT), and ncl-1 mutants can be rescued by brat transgenes; NCL-1 is required for the normally small size of neuronal, muscle, and hypodermal nucleoli, and is already active in 4-cell embryos; NCL-1 may be a repressor of RNA polymerase I and III transcription and an inhibitor of cell growth, based on mutant analysis; ncl-1 animals have much larger neuronal nucleoli than normal, somewhat larger muscle and hypodermal nucleoli, but essentially normal intestinal and germline nucleoli (the last of which are large even in wild-type animals); conversely, intestinal and germline cells have the lowest amounts of NCL-1 protein; ncl-1 animals are 9% larger, have 22% more protein and twice as much rRNA, and transcribe rRNA twice as much as wild-type worms; ncl-1 functions cell autonomously, and ncl-1 mutations suppress the tumorous germline phenotype of pro-1(na48) mutants.
12C04G2.2C04G2.2n/achrIV 10,091,506contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
13C08G5.2C08G5.2n/achrII 740,228
14K07E12.2K07E12.2n/achrIII 6,737,547
15B0280.11B0280.11n/achrIII 7,137,323contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
16K06A1.2K06A1.2n/achrII 6,445,339
17T02H6.4T02H6.4n/achrII 690,572contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
18Y48A6B.8Y48A6B.8n/achrIII 11,028,225contains similarity to Interpro domains IPR003547 (Serine/threonine protein kinase, yersinia), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)
19H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
20B0207.7B0207.7n/achrI 5,946,551contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
21F26C11.1F26C11.1n/achrII 9,894,986contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
22R01E6.7R01E6.7n/achrX 13,568,618contains similarity to Ectocarpus siliculosus virus EsV-1-142.; TR:Q8QKY0
23F26F2.1F26F2.1n/achrV 20,555,875contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
24F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
25W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
26B0513.6B0513.6n/achrIV 13,855,821contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
27srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
29lgc-25R03E1.3n/achrX 14,160,175C. elegans LGC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
30K11C4.2K11C4.2n/achrV 6,895,906contains similarity to Pfam domain PF03006 Haemolysin-III related contains similarity to Interpro domain IPR004254 (Hly-III related proteins)
31W01B11.1W01B11.1n/achrI 3,300,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
32F54H12.5F54H12.5n/achrIII 7,971,111This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
33K06B4.3K06B4.3n/achrV 15,672,799contains similarity to Saccharomyces cerevisiae mRNA binding protein; SGD:YPR042C
34C16D9.5C16D9.5n/achrV 8,244,484contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
35sea-2K10G6.3n/achrII 3,966,905sea-2 is an autosomal signal element gene, whose protein product contains four C2H2 zinc finger domains and three involucrin repeats embedded in extensive regions of low-complexity (e.g., glutamine/asparagine-rich) protein sequence; sea-2 has no obvious biological function in mass RNAi assays.
36F40G9.14F40G9.14n/achrIII 176,962contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
37Y106G6E.1Y106G6E.1n/achrI 10,199,352contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38Y38H6C.15Y38H6C.15n/achrV 20,530,900contains similarity to Interpro domain IPR006017 (Caldesmon)
39T05A8.1T05A8.1n/achrII 2,709,077
40T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
41lips-2C04B4.3n/achrX 12,286,461C. elegans LIPS-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
42F37E3.3F37E3.3n/achrI 6,430,598contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
43R09H10.2R09H10.2n/achrIV 10,606,027contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
44Y7A5A.8Y7A5A.8n/achrX 15,823,201contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IL30
45C03B1.6C03B1.6n/achrX 6,350,637
46F41G3.5F41G3.5n/achrII 6,748,034contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
47K11C4.1K11C4.1n/achrV 6,897,709contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48ZC581.7ZC581.7n/achrI 6,661,388contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
49C33E10.6C33E10.6n/achrX 17,268,242contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227I5
50K07F5.6K07F5.6n/achrIV 9,845,791contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)