UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y47H9A.1Y47H9A.10chrI 11,624,828contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
2Y41C4A.11Y41C4A.11n/achrIII 11,721,632Y41C4A.11 encodes a divergent paralog of F38E11.5, the beta' (beta-prime) subunit of the coatomer (COPI) complex; unlike F38E11.5, Y41C4A.11 has no obvious function in mass RNAi assays.
3F35H12.1F35H12.1n/achrX 936,580contains similarity to Interpro domain IPR015649 (Schwannomin interacting protein 1)
4ZK180.2ZK180.2n/achrIV 4,504,345contains similarity to Pfam domain PF01094 Receptor family ligand binding region contains similarity to Interpro domains IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR000923 (Blue (type 1) copper domain)
5Y54E2A.5Y54E2A.5n/achrII 14,756,797
6R13A1.5R13A1.5n/achrIV 7,191,489
7F35E8.1F35E8.1n/achrV 15,904,615contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
8F28A12.3F28A12.3n/achrV 8,641,003
9skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
10F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
11C01G10.4C01G10.4n/achrV 15,089,864contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q5HDQ9
12C29F9.5C29F9.5n/achrIII 118,236contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR003101 (Coactivator CBP, KIX), IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
13Y48A6B.8Y48A6B.8n/achrIII 11,028,225contains similarity to Interpro domains IPR003547 (Serine/threonine protein kinase, yersinia), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)
14R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
15F28C10.4F28C10.4n/achrX 539,044
16F16H6.3F16H6.3n/achrV 18,196,549contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
17tag-312C33D12.6n/achrX 3,057,313C. elegans TAG-312 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF00036 (EF hand) (2), PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR011992 (EF-Hand type), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras), IPR006689 (ARF/SAR superfamily), IPR001854 (Ribosomal protein L29)
18F55E10.7F55E10.7n/achrX 8,349,739contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19C53D6.5C53D6.5n/achrIV 9,026,997contains similarity to Enterococcus hirae V-type sodium pump subunit F (EC 3.6.3.14) (Na(+)-translocating ATPasessubunit F).; SW:P43437
20nlp-25Y43F8C.1n/achrV 19,607,891C. elegans NLP-25 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000817 (Prion protein)
21ZC190.8ZC190.8n/achrV 8,687,699contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
22K06B4.3K06B4.3n/achrV 15,672,799contains similarity to Saccharomyces cerevisiae mRNA binding protein; SGD:YPR042C
23arf-1.1F45E4.1n/achrIV 7,635,253arf-1.1 encodes a member of the ADP-ribosylation factor family.
24F18G5.5F18G5.5n/achrX 9,256,665
25F37E3.3F37E3.3n/achrI 6,430,598contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
26sri-36F33H12.5n/achrII 2,584,688C. elegans SRI-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
28BE10.3BE10.3n/achrIII 12,810,237contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
29K03B4.6K03B4.6n/achrV 4,673,573contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domains IPR004920 (Protein of unknown function DUF263), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
30F13H8.6F13H8.6n/achrII 6,285,852
31T02E9.1T02E9.1n/achrV 11,351,210contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32T02H6.6T02H6.6n/achrII 683,947
33gst-40F56B3.10n/achrIV 761,476C. elegans GST-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
34C12D5.9C12D5.9n/achrV 7,689,147contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
35tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
36R11.2R11.2n/achrX 16,184,757contains similarity to Homo sapiens Chromosome-associated kinesin KIF4A; ENSEMBL:ENSP00000262784
37C55A6.6C55A6.6n/achrV 11,514,222contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
38T02E9.3T02E9.3n/achrV 11,364,314T02E9.3 encodes a homolog of human melatonin type 1b receptors, and more generally of mammalian dopamine and serotonin (5-HT) receptors; T02E9.3 is partly required for male tail curling, with T02E9.3(RNAi) animals showing reduced curling in exogenous 5-HT; T02E9.3 is required for full sensitivity to 5-HT, normal brood sizes, and pharyngeal pumping; T02E9.3 is expressed in head and tail neurons.
39Y7A9A.1Y7A9A.1n/achrIV 16,199,192contains similarity to Pfam domain PF01019 Gamma-glutamyltranspeptidase contains similarity to Interpro domain IPR000101 (Gamma-glutamyltranspeptidase)
40bath-25T27C10.4n/achrI 10,877,883C. elegans BATH-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00036 (EF hand) (2), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
41F12A10.5F12A10.5n/achrII 5,481,296contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
42cyp-33C6F41B5.7n/achrV 2,248,474C. elegans CYP-33C6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
43sulp-4K12G11.1n/achrV 11,877,220sulp-4 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-4 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids and when expressed in Xenopus oocytes, SULP-4 exhibits robust transport of sulfate and more modest transport of chloride ions and oxalate; a SULP-4::GFP fusion is expressed in the apical canaliculae of the excretory cell and also in some head neurons.
44C31H1.2C31H1.2n/achrIV 5,792,361contains similarity to Pfam domain PF02013 Cellulose or protein binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003616 (Post-SET zinc-binding region), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR002883 (Dockerin, cellulose-binding family V)
45R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
46ZK418.6ZK418.6n/achrIII 7,076,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47Y6B3B.3Y6B3B.3n/achrI 13,716,143contains similarity to Interpro domain IPR010133 ()
48C01B12.4C01B12.4n/achrII 7,948contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)
49C13C4.4C13C4.4n/achrV 12,110,082contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR006355 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, hypothetical 2), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
50Y41C4A.1Y41C4A.1n/achrIII 11,648,712contains similarity to Oryza sativa Putative aspartate kinase.; TR:Q851Z6