UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sru-12Y45F10B.58e-179chrIV 13,583,783C. elegans SRU-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
2K01A6.5K01A6.5n/achrIV 11,743,140contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q14202 Zinc finger protein 261; ENSEMBL:ENSP00000322845
3sri-19Y69E1A.6n/achrIV 10,960,112C. elegans SRI-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4C07G3.8C07G3.8n/achrV 3,497,698contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
5str-67K10C9.6n/achrV 1,063,591C. elegans STR-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
7F01E11.3F01E11.3n/achrX 6,975,202
8srd-12C39H7.6n/achrIV 5,629,500C. elegans SRD-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001073 (Complement C1q protein)
9C07D8.3C07D8.3n/achrX 7,361,807
10F23C8.3F23C8.3n/achrI 2,440,875
11Y53C12B.2Y53C12B.2n/achrII 9,740,855contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
12F41H8.2F41H8.2n/achrV 827,588contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
13Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
14C30F2.2C30F2.2n/achrX 16,080,929contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
15srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16srab-16R13D11.6n/achrV 783,761C. elegans SRAB-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
17Y43F8C.11Y43F8C.11n/achrV 19,670,774contains similarity to Mus sp Interleukin-3 receptor beta subunit (Fragment).; TR:Q64130
18C10E2.2C10E2.2n/achrX 16,746,897This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
19nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
22K10C3.4K10C3.4n/achrI 9,861,391contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 98.; SW:Q6INX1
23F32B4.5F32B4.5n/achrI 11,519,244contains similarity to Homo sapiens BTB/POZ domain-containing protein KCTD16; ENSEMBL:ENSP00000329906
24C18A11.2C18A11.2n/achrX 8,067,797
25C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
26ilys-1C45G7.1n/achrIV 2,470,894C. elegans ILYS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
27F45C12.3F45C12.3n/achrII 1,731,227contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
28C38C5.1C38C5.1n/achrX 5,560,137
29exc-9F20D12.5n/achrIV 7,940,302exc-9 encodes a LIM domain-containing protein; exc-9 activity is required for proper development and morphogenesis of the excretory cell canal.
30F35E2.1F35E2.1n/achrI 11,739,734contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
31str-208F26G5.2n/achrV 4,957,686C. elegans STR-208 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32tbx-9T07C4.6n/achrIII 10,340,812C. elegans TBX-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
33clec-114C49A1.9n/achrI 14,233,796C. elegans CLEC-114 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
34C34D10.1C34D10.1n/achrX 8,030,420contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
35Y17G7B.13Y17G7B.13n/achrII 12,045,368contains similarity to Pfam domain PF06090 Domain of unknown function (DUF941) contains similarity to Interpro domain IPR009286 (Protein of unknown function DUF941)
36T05B9.2T05B9.2n/achrII 11,257,607contains similarity to Rattus norvegicus Fibrillin-2.; TR:Q9WUH9
37Y38H6C.9Y38H6C.9n/achrV 20,516,299contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
38F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
39str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40C55B6.5C55B6.5n/achrX 7,205,013contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
41F58A6.2F58A6.2n/achrII 5,137,627
42F56A11.4F56A11.4n/achrIV 550,691contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43sra-20F28C12.4n/achrI 12,697,375C. elegans SRA-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
44K09G1.3K09G1.3n/achrV 9,597,431contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Product of gene unknown; SGD:YKL064W
45gpa-10C55H1.2n/achrV 6,853,746gpa-10 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADF, ASI, ASJ, ALN, CAN, LUA, and the spermatheca.
46C17H11.1C17H11.1n/achrX 8,177,329contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
48clec-231C29F3.4n/achrV 15,350,031C. elegans CLEC-231 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49F56C4.2F56C4.2n/achrIV 10,642,026contains similarity to Oryza sativa DNA binding protein S1FA.; SW:S1FA_ORYSA
50T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675