UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y43F8C.5Y43F8C.54e-124chrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
2K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
3far-4F15B9.2n/achrV 12,999,023far-4 encodes a fatty acid and retinol-binding protein, paralogous to FAR-3 and FAR-5 and distantly homologous to FAR proteins of parasitic nematodes; FAR-4 binds lipids in vitro; far-4 is transcribed at highest levels in the fourth larval stage, and is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi assays.
4ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
5F40E3.5F40E3.5n/achrI 2,646,674contains similarity to Interpro domain IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
6ZC239.14ZC239.14n/achrII 3,221,697contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
7C28H8.8C28H8.8n/achrIII 5,887,890contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
8C17H12.10C17H12.10n/achrIV 6,808,208
9F28H7.4F28H7.4n/achrV 10,746,917contains similarity to Interpro domain IPR011893 (SelT/selW/selH selenoprotein)
10F44B9.9F44B9.9n/achrIII 8,030,412contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
11T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
12ZK353.4ZK353.4n/achrIII 8,388,992contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Uncharacterized serine/threonine-rich protein PB15E9.01c precursor.; SW:Q8TFG9
13H09F14.1H09F14.1n/achrV 10,614,197contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
14cnc-7F53H2.2n/achrV 20,389,778C. elegans CNC-7 protein ;
15fbxb-1T26H2.1n/achrV 19,240,953This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
16F42C5.3F42C5.3n/achrIV 7,286,758contains similarity to Homo sapiens Intersectin 1 short form transcript variant 8; ENSEMBL:ENSP00000370685
17F57H12.4F57H12.4n/achrIV 7,971,993contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001920 (Asp/Glu racemase), IPR009126 (Cholecystokinin receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18W03F11.4W03F11.4n/achrI 2,238,497contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
19T08G11.2T08G11.2n/achrI 8,919,920T08G11.2 encodes a nematode-specific sperm protein, required for a normally high ovulation rate, that interacts with EGL-32; despite not being EGL-32, and although T08G11.2(tm336) complements egl-32(n155), T08G11.2 can partially rescue egl-32 mutants when expressed transgenically, implying that T08G11.2 can be a nonorthologous replacement for EGL-32 function in vivo; T08G11.2 has an SH2 motif, but this motif lacks a critical arginine residue; T08G11.2 has no obvious non-nematode homologs, but is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and Y81G3A.1); T08G11.2(tm336) hermaphrodites have a lowered ovulation rate (and thus a lowered rate of egg-laying), retaining significantly fewer eggs than wild-type, yet also retaining late-stage embryos; T08G11.2 has no obvious phenotype in mass RNAi experiments, possibly because of genetic redundancy with its paralogs; T08G11.2 expression is strongly enriched in spermatogenesis.
20F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
21Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
22F57A8.6F57A8.6n/achrV 10,072,890contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
23F26A1.8F26A1.8n/achrIII 4,821,475contains similarity to Interpro domain IPR000010 (Proteinase inhibitor I25, cystatin)
24Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
25flp-17C52D10.11n/achrIV 17,191,022C. elegans FLP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
26Y8A9A.2Y8A9A.2n/achrII 3,798,109contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000694 (Proline-rich region)
27B0261.5B0261.5n/achrI 5,250,115
28F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
29T24D5.5T24D5.5n/achrX 12,599,103contains similarity to Plasmodium falciparum PfEMP1-like protein.; TR:Q8IC59
30gab-1ZC482.1n/achrIII 12,775,682gab-1 encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor beta-like subunit with both the neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding and transmembrane domains; gab-1 can form a GABA-responsive channel when co-expressed with alpha/gamma type subunits in a heterologous expression system; experiments with gab-1 indicate that GABA receptors are involved in the mechanism of resistance to the widely used broad-spectrum anthelmintic drug Ivermectin.
31R06C1.6R06C1.6n/achrI 11,950,040contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CCR4 Associated Factor 120 kDa; SGD:YNL278W
32F46A9.2F46A9.2n/achrI 9,459,902contains similarity to Saccharomyces cerevisiae part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA); similar to microtubule binding proteins and to X90565_5.cds; SGD:YLR197W
33C17C3.3C17C3.3n/achrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
34cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
35R13A1.5R13A1.5n/achrIV 7,191,489
36F19G12.1F19G12.1n/achrX 1,431,242contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
37Y49F6C.6Y49F6C.6n/achrII 3,364,648contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
38set-11F34D6.4n/achrII 2,692,391set-11 encodes a putative histone H3 lysine-9 methyltransferase orthologous to human EHMT1 (OMIM:607001, mutated in 9q subtelomeric deletion syndrome) and EHMT2 (OMIM:604599); neither set-11(n4488) nor set-11(RNAi) have any obvious phenotypes.
39C17E4.1C17E4.1n/achrI 9,409,217contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
40spp-9T25C12.2n/achrX 11,487,901C. elegans SPP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03489 Saposin-like type B, region 2 contains similarity to Interpro domains IPR008138 (Saposin-like type B, 2), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
41C34D1.4C34D1.4n/achrV 13,258,178
42C23H4.6C23H4.6n/achrX 12,238,124contains similarity to Pfam domain PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR003395 (RecF/RecN/SMC protein, N-terminal)
43F41D3.6F41D3.6n/achrI 12,265,384contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
44M163.1M163.1n/achrX 14,503,087contains similarity to Mus musculus Adapter-related protein complex 3 beta 1 subunit (Beta-adaptin 3A)s(AP-3 complex beta-3A subunit) (Beta-3A-adaptin).; SW:A3B1_MOUSE
45srd-23Y40H7A.5n/achrIV 15,181,398C. elegans SRD-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46srbc-3F35F10.2n/achrV 3,309,077C. elegans SRBC-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47ZK666.2ZK666.2n/achrII 10,471,714contains similarity to Homo sapiens ASH1; ENSEMBL:ENSP00000265206
48ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
49E02C12.10E02C12.10n/achrV 9,376,724contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
50R05G6.1R05G6.1n/achrIV 7,539,920