UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y41E3.13Y41E3.133e-107chrIV 15,058,268contains similarity to Interpro domain IPR007985 (Haemolysin expression modulating)
2Y75B8A.10Y75B8A.10n/achrIII 12,181,866contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR006662 (Thioredoxin-related)
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4srh-32Y26G10.2n/achrV 17,702,215C. elegans SRH-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5C17B7.8C17B7.8n/achrV 3,322,428C17B7.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.8 has no clear orthologs in other organisms.
6F11D5.6F11D5.6n/achrX 3,325,709
7clec-58ZK666.3n/achrII 10,475,101C. elegans CLEC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
8sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9acl-12C01C10.3n/achrX 7,440,941C. elegans ACL-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
10C01G5.4C01G5.4n/achrIV 6,533,692contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
11C03A7.13C03A7.13n/achrV 5,191,814contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
12T25B6.6T25B6.6n/achrX 9,022,315contains similarity to Interpro domain IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
13Y12A6A.2Y12A6A.2n/achrX 13,619,323contains similarity to Phaseolus lunatus Double-headed bowman-birk inhibitor (Fragment).; TR:Q941H3
14Y57A10B.2Y57A10B.2n/achrII 12,376,431contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
15K10C9.1K10C9.1n/achrV 1,077,400
16C17B7.3C17B7.3n/achrV 3,343,332contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
17F35F10.13F35F10.13n/achrV 3,318,633contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
18ceh-17D1007.1n/achrI 4,569,495ceh-17 encodes a phox-2-like homeodomain protein that is a member of the Q50 paired-like class of homeobox proteins and the vertebrate orthologue of Phox2a and Phox2b; that affects ALA and SIA axonal development; ceh-17 affects ALA and SIA antero-posterior axonal growth and navigation, and is expressed in five neurons of the ring ganglia (ALA and the 4 SIAs) with strongest expression in embryos and in L1 stage larvae.
19grl-8ZC487.5n/achrV 6,732,495grl-8 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
20ncr-2F09G8.4n/achrIII 8,261,990ncr-2 encodes a homolog of human NPC1, which when mutated leads to Niemann-Pick disease, type C (OMIM:257220).
21srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
22F35G8.1F35G8.1n/achrX 9,317,241contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23C49C3.15C49C3.15n/achrIV 17,334,573contains similarity to Interpro domain IPR002101 (Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate MARCKS)
24W03G9.5W03G9.5n/achrI 4,969,127contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
25C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
26T02H6.5T02H6.5n/achrII 687,130contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
27sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
28kin-23W04G5.6n/achrI 11,641,436kin-23 encodes a predicted protein tyrosine kinase; like KIN-30, KIN-23 contains an unusual K to R substitution in kinase subdomain VII; kin-23 mRNA is expressed strongly during the L1/L2 larval stages, weakly in L3 and L4 stages, and at undetectable levels in adults.
29Y49F6C.6Y49F6C.6n/achrII 3,364,648contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
30srbc-48F54B8.6n/achrV 15,820,807C. elegans SRBC-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31K09C6.1K09C6.1n/achrV 860,591contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
32gcy-2R134.2n/achrII 9,509,771gcy-2 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; as loss of gcy-2 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; by sequence similarity, however, GCY-2 can be predicted to function in chemosensory signal transduction.
33F40B5.1F40B5.1n/achrX 8,376,670F40B5.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F40B5.1 has no clear orthologs in other organisms.
34C31A11.1C31A11.1n/achrV 16,294,149contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
35srv-10F53F1.9n/achrV 13,424,568C. elegans SRV-10 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
36pha-2M6.3n/achrX 635,373pha-2 encodes a homeodomain protein that is orthologous to vertebrate Hex proteins required for the development of B lymphocytes and organs derived from foregut endoderm; in C. elegans, pha-2 is essential for proper development and morphogenesis of the pm5 pharyngeal muscles cells during late stages of embryogenesis; in regulating pm5 fate specification, PHA-2 appears to act downstream of the organ identity factor PHA-4, and upstream of ceh-22, whose expression it may negatively regulate in pm5; a rescuing PHA-2::GFP reporter is expressed in pharyngeal cells, intestinal-rectal cells, and postembryonic head neurons.
37F56F11.1F56F11.1n/achrIII 2,892,177
38T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
39C49F5.5C49F5.5n/achrX 11,986,477contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
40F42G2.5F42G2.5n/achrII 2,417,192contains similarity to Pfam domains PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000535 (Major sperm protein)
41B0034.2B0034.2n/achrII 5,944,245
42fbxa-195R09B5.1n/achrV 1,435,696This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
43F11F1.5F11F1.5n/achrIII 13,402,502contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR003661 (Signal transduction histidine kinase, subgroup 1, dimerisation and phosphoacceptor region), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
44T07F8.1T07F8.1n/achrII 7,150,444contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
45C08D8.1C08D8.1n/achrV 8,347,824contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46C17G1.5C17G1.5n/achrX 9,943,135contains similarity to Hepatitis C virus Non-structural protein 5b (Genome polyprotein) (Fragment).; TR:Q8V1C2
47tsp-18F59G1.2n/achrII 5,905,416C. elegans TSP-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
48srw-47K10G4.2n/achrV 17,261,345C. elegans SRW-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
49Y17D7B.2Y17D7B.2n/achrV 18,788,749contains similarity to Xenopus laevis Phosphoinositide-3-kinase.; TR:Q8UUU2
50srsx-13C13D9.6n/achrV 4,982,486C. elegans SRSX-13 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)